Elongaciji-pridruženi faktor 1 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom EAF1 sa hromosoma 3. Dio je porodice proteina EAF.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 268 aminokiselina, а molekulska težina 29.042 Da.
1020304050 MNGTANPLLDREEHCLRLGESFEKRPRASFHTIRYDFKPASIDTSCEGEL QVGKGDEVTITLPHIPGSTPPMTVFKGNKRPYQKDCVLIINHDTGEYVLE KLSSSIQVKKTRAEGSSKIQARMEQQPTRPPQTSQPPPPPPPMPFRAPTK PPVGPKTSPLKDNPSPEPQLDDIKRELRAEVDIIEQMSSSSGSSSSDSES SSGSDDDSSSSGGEDNGPASPPQPSHQQPYNSRPAVANGTSRPQGSNQLM NTLRNDLQLSESGSDSDD
Funkcija Mehanizmi koji upravljaju procesom elongacije tokom sinteze eukariotske iRNK razotkrivaju se nedavnim studijama. Ove studije su dovele do očekivanog otkrića raznolike kolekcije faktora transkripcije koji direktno reguliraju aktivnosti RNK-polimeraze II i neočekivanog otkrića uloge mnogih faktora elongacije u drugim osnovnim procesima, kao što su popravak DNK, rekombinacije itd. Transkripcijski mehanizam i strukturni karakteristike glavnih RNK-polimeraza konzervirani su među vrstama. Geni aktivni tokom elongacije spadaju u različite klase kao što su: domaćinski geni , regulirani ćelijskim ciklusom, geni specifični za razvoj i diferencijaciju itd. Lista gena uključenih u elongaciju u posljednje vrijeme raste i uključuje: –TFIIS, DSIF, NELF, P-Tefb i ostale koji su uključeni u zaustavljanje uzrokovano lijekom ili sekvencom ovisnoog –TFIIF, ELL, elongin, elongator itd., koji su uključeni u povećanje katalitske brzine elongacije promjenom Km i/ili Vmax Pol II –FACT, Paf1 i drugih faktora koji su uključeni u modifikaciju hromatina – proteini za popravak DNK, faktori eksporta i prerade RNK, 19S proteasom i niz drugih faktora kao što su Spt5-Spt5, Paf1 i NELF kompleksi, FCP1P itd.Arndt i Kane, 2003..
Elongacija također predstavlja procesnu fazu transkripcije u kojoj se aktivnosti nekoliko faktora prerade iRNK spajaju na transkripciju kroz njihovo vezivanje za RNK-polimerazu (Pol II). Jedan od ključnih događaja koji omogućava ovu interakciju je diferencijalna fosforilacija Pol II CTD. Obrazac fosforilacije CTD menja se tokom transkripcije, a najznačajnije na početku i tokom procesa elongacije. TFIIH-zavisna Ser5 fosforilacija je primećena prvenstveno u promotorskim regijama, dok se fosforilacija Ser2 posredovana sa P-Tefb viđa uglavnom u kodirajućim sekvencama, tokom elongacije. Eksperimentalni dokazi sugeriraju dinamičku povezanost faktora prerade RNK s različito modificiranim oblicima polimeraze tokom ciklusa transkripcije.Komarnitsky et al., 2000)Komarnitsky et al 2000Arndt & Kane 2003Shilatifard et al 2003 Izvori REACTOME: R-HSA-75955
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 3 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika