Otoferlin jest protein koji je kod ljudi kodiran genom OTOF sa hromosoma 2.
Amiokiselininska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 1.997 aminokiselina, a molkekulska težina 226.753 Da.
1020304050 MALLIHLKTVSELRGRGDRIAKVTFRGQSFYSRVLENCEDVADFDETFRW PVASSIDRNEMLEIQVFNYSKVFSNKLIGTFRMVLQKVVEESHVEVTDTL IDDNNAIIKTSLCVEVRYQATDGTVGSWDDGDFLGDESLQEEEKDSQETD GLLPGSRPSSRPPGEKSFRRAGRSVFSAMKLGKNRSHKEEPQRPDEPAVL EMEDLDHLAIRLGDGLDPDSVSLASVTALTTNVSNKRSKPDIKMEPSAGR PMDYQVSITVIEARQLVGLNMDPVVCVEVGDDKKYTSMKESTNCPYYNEY FVFDFHVSPDVMFDKIIKISVIHSKNLLRSGTLVGSFKMDVGTVYSQPEH QFHHKWAILSDPDDISSGLKGYVKCDVAVVGKGDNIKTPHKANETDEDDI EGNLLLPEGVPPERQWARFYVKIYRAEGLPRMNTSLMANVKKAFIGENKD LVDPYVQVFFAGQKGKTSVQKSSYEPLWNEQVVFTDLFPPLCKRMKVQIR DSDKVNDVAIGTHFIDLRKISNDGDKGFLPTLGPAWVNMYGSTRNYTLLD EHQDLNEGLGEGVSFRARLLLGLAVEIVDTSNPELTSSTEVQVEQATPIS ESCAGKMEEFFLFGAFLEASMIDRRNGDKPITFEVTIGNYGNEVDGLSRP QRPRPRKEPGDEEEVDLIQNASDDEAGDAGDLASVSSTPPMRPQVTDRNY FHLPYLERKPCIYIKSWWPDQRRRLYNANIMDHIADKLEEGLNDIQEMIK TEKSYPERRLRGVLEELSCGCCRFLSLADKDQGHSSRTRLDRERLKSCMR ELENMGQQARMLRAQVKRHTVRDKLRLCQNFLQKLRFLADEPQHSIPDIF IWMMSNNKRVAYARVPSKDLLFSIVEEETGKDCAKVKTLFLKLPGKRGFG SAGWTVQAKVELYLWLGLSKQRKEFLCGLPCGFQEVKAAQGLGLHAFPPV SLVYTKKQAFQLRAHMYQARSLFAADSSGLSDPFARVFFINQSQCTEVLN ETLCPTWDQMLVFDNLELYGEAHELRDDPPIIVIEIYDQDSMGKADFMGR TFAKPLVKMADEAYCPPRFPPQLEYYQIYRGNATAGDLLAAFELLQIGPA GKADLPPINGPVDVDRGPIMPVPMGIRPVLSKYRVEVLFWGLRDLKRVNL AQVDRPRVDIECAGKGVQSSLIHNYKKNPNFNTLVKWFEVDLPENELLHP PLNIRVVDCRAFGRYTLVGSHAVSSLRRFIYRPPDRSAPSWNTTVRLLRR CRVLCNGGSSSHSTGEVVVTMEPEVPIKKLETMVKLDATSEAVVKVDVAE EEKEKKKKKKGTAEEPEEEEPDESMLDWWSKYFASIDTMKEQLRQQEPSG IDLEEKEEVDNTEGLKGSMKGKEKARAAKEEKKKKTQSSGSGQGSEAPEK KKPKIDELKVYPKELESEFDNFEDWLHTFNLLRGKTGDDEDGSTEEERIV GRFKGSLCVYKVPLPEDVSREAGYDSTYGMFQGIPSNDPINVLVRVYVVR ATDLHPADINGKADPYIAIRLGKTDIRDKENYISKQLNPVFGKSFDIEAS FPMESMLTVAVYDWDLVGTDDLIGETKIDLENRFYSKHRATCGIAQTYST HGYNIWRDPMKPSQILTRLCKDGKVDGPHFGPPGRVKVANRVFTGPSEIE DENGQRKPTDEHVALLALRHWEDIPRAGCRLVPEHVETRPLLNPDKPGIE QGRLELWVDMFPMDMPAPGTPLDISPRKPKKYELRVIIWNTDEVVLEDDD FFTGEKSSDIFVRGWLKGQQEDKQDTDVHYHSLTGEGNFNWRYLFPFDYL AAEEKIVISKKESMFSWDETEYKIPARLTLQIWDADHFSADDFLGAIELD LNRFPRGAKTAKQCTMEMATGEVDVPLVSIFKQKRVKGWWPLLARNENDE FELTGKVEAELHLLTAEEAEKNPVGLARNEPDPLEKPNRPDTSFIWFLNP LKSARYFLWHTYRWLLLKLLLLLLLLLLLALFLYSVPGYLVKKILGA
Funkcija
Mutacije u ovom genu uzrok su neurosenzorne nesindromske recesivna gluhoće, DFNB9. Kratki oblik kodiranog proteina ima tri C2 domena, jedan karboksi-terminal, transmembranski domen koji se nalazi iu faktoru spermatogeneze C. elegans FER-1 i ljudskom disferlinu, dok duga obrazac ima šest C2 domena. Homologni proteini otoferlina kod ljudi za koje se pokazalo da su povezani s ljudskim bolestima su disferlin i mioferlin. I disferlin i mioferlin imaju po sedam C2 domena. C2A u dužem obliku otoferlina sa šest C2 domena je strukturno sličan disferlinu C2A. Međutim, petlja 1 na mjestu vezivanja za kalcij otoferlina C2A je značajno kraća od homologne petlje u domenima disferlina i mioferlina C2A. Zbog toga se ne može vezati za kalcij. Otoferlin C2A također nije u stanju da se veže za fosfolipide i stoga je strukturno i funkcionalno drugačiji od drugih C2 domena. Homologija sugerira da ovaj protein može biti uključen u fuziju vezikulske membrane. Slično disferlinu i mioferlinu, otoferlin ima FerA domen i pokazalo se da njegov FerA domen stupa u interakciju s blizanci-ionskim lipidima na način ovisan o kalciju i s negativno nabijenim lipidima na način koji ne ovisi o kalciju. Procijenjeni naboj FerA domena među proteinima ferlina značajno varira. Na pH 7, procijenjeni naboj disferlina je –8,4 dok je otoferlin FerA +8,5. Za ovaj gen nađeno je nekoliko varijanti transkripta koje kodiraju više izoformi.
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi GeneReviews/NCBI/NIH/UW entry on OTOF-Related Deafness
Kategorija:Geni na hromosomu 2 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika