DEAH-kujtijska helikaza 8, jest protein/enzim koji je kod ljudi kodiran genom DHX8 sa hromosoma 17. Ovaj protein je član porodice polipepti DEAH-kutije. Glavna karakteristika ove grupe je njihov konzervirani motiv DEAH (Asp- Glu- Ala- His). Širok spektar RNK-helikaza pripada ovoj porodici. Konkretno, DHX8 djeluje kao ATP-zavisna RNK-helikaza, uključena u splajsing i regulaciju oslobađanja prerađenih iRNK iz splajsosoma iz jedra. Objavljene studije su pokazale posljedice mutacija DHX8, aneke od njih su kritične za biološke procese kao što je hematopoeza i povezane su s nekim bolestima..
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 1.220 aminokiselina, a molekulska težina 139.315 Da.
1020304050 MAVAVAMAGALIGSEPGPAEELAKLEYLSLVSKVCTELDNHLGINDKDLA EFVISLAEKNTTFDTFKASLVKNGAEFTDSLISNLLRLIQTMRPPAKPST SKDPVVKPKTEKEKLKELFPVLCQPDNPSVRTMLDEDDVKVAVDVLKELE ALMPSAAGQEKQRDAEHRDRTKKKKRSRSRDRNRDRDRDRERNRDRDHKR RHRSRSRSRSRTRERNKVKSRYRSRSRSQSPPKDRKDRDKYGERNLDRWR DKHVDRPPPEEPTIGDIYNGKVTSIMQFGCFVQLEGLRKRWEGLVHISEL RREGRVANVADVVSKGQRVKVKVLSFTGTKTSLSMKDVDQETGEDLNPNR RRNLVGETNEETSMRNPDRPTHLSLVSAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKW EIKQMIAANVLSKEEFPDFDEETGILPKVDDEEDEDLEIELVEEEPPFLR GHTKQSMDMSPIKIVKNPDGSLSQAAMMQSALAKERRELKQAQREAEMDS IPMGLNKHWVDPLPDAEGRQIAANMRGIGMMPNDIPEWKKHAFGGNKASY GKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGSGKTTQITQ YLAEAGYTSRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFED CTSPETVIKYMTDGMLLRECLIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGL LKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYFYEAPIFTIPGRTYPVEILYTK EPETDYLDASLITVMQIHLTEPPGDILVFLTGQEEIDTACEILYERMKSL GPDVPELIILPVYSALPSEMQTRIFDPAPPGSRKVVIATNIAETSLTIDG IYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRAGRAGRTGPGKCY RLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPP METLITAMEQLYTLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLG CSEEMLTIVSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFHQTEGDHLTLLAVYN SWKNNKFSNPWCYENFIQARSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKLDVVSCGKST VRVQKAICSGFFRNAAKKDPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSALFNRQPEWVV YHELVLTTKEYMREVTTIDPRWLVEFAPAFFKVSDPTKLSKQKKQQRLEP LYNRYEEPNAWRISRAFRRR
Struktura
thumb|left|Aminokiselinska sekvenca DHX8 i njegova sekundarna struktura.
Protein DHX8 je dio proteinskog kompleksa zvanog splajsosom, koji je zadužen za preradu pre-iRNK. Splajsosom ima osam glavnih funkcionalnih stanja, svako sa različitim sastavom i strukturom; pet od osam stanje je strukturno okarakterisano.
DHX8 ima različite domene: S1-RNK vezujući domen (DEAD/DEAH kutija), helikazni konzervirani C-terminalni domen, domen povezan s helikazom (HA2) i oligonukleotid/oligosaharid-vezujući OB)- preklopni domen (svaki prerađen sa unutrašnje poremećenim regijana).
Postoje neke regije proteina koji su veoma važne za njegovu aktivnost, kao što je R620 i regioni sa kukom i zaokretom. Također, DHX8Δ547 je katalitskki aktivno jezgro proteina DHX8. Sastoji se od dva RecA domena i C-terminalnog WH, ustavljački OB-nabrani domena i N-terminalnu regiju.
Ukupna težina DHX8 strukture je 156580,13 Da.
Sekundarna struktura: 36% alfa-heliksa: 26 heliksa i 246 ostataka 16% beta-listova: 29 lanaca i 110 ostataka.
Funkcija DHX8 je lokalizovan u ćelijskom jedu i stimuliran prisustvom RNK. Ovaj protein je komponenta splajsosoma, tako da učestvuje u pereradipre-iRNK.; Splajsing je proces spajanja egzona iz primarnih transkripata iRNK i eliminacije intronskih sekvenci, pomoću splajsosomnog mehanizma, tako da je proizvedena iRNK bez introna, koja se sastoji isključivo od spojenih egzona. Prerada se završava rastavljanjem splajsosomnog kompleksa i oslobađanjem rezultirajućih zrelih RNK-a do vanjskog dijela jedra, ovisno o ATP-u. Splajsosom zahtijeva konformacijske promjene da bi mogao katalizirati reakcije spajanja i kasnije zrelih iRNK koje se oslobađaju na vanjski dio jedra. Jedna od ATP-ovisnih helikaza potrebnih za ove konformacijske promjene je DHX8. Nadalje, DHX8 ima ključnu ulogu u oslobađanju, olakšavanju jedarnog eksporta prerađene iRNK. Karakterizacija proteina je pokazala da DHX8 ima prednost vezanja za RNK bogate adeninom. Ovo vezivanje je praćeno hidrolizom ATP-a i time oslobađanjem ADP-a.
Reference
Vanjski linksovi
Kategorija:Geni na hromosomu 17 Kategorija:Enzimi Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika