Cisteinom i tirozinom bogati protein 1 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom CYYR1 sa hromosoma 21, lokus 21q21.2. Ovaj protein ima funkciju koja još nije dovoljno shvaćena.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 154 aminokiseline, a molekulska težina 16.626 Da.
1020304050 MDAPRLPVRPGVLLPKLVLLFVYADDCLAQCGKDCKSYCCDGTTPYCCSY YAYIGNILSGTAIAGIVFGIVFIMGVIAGIAICICMCMKNHRATRVGILR TTHINTVSSYPGPPPYGHDHEMEYCADLPPPYSPTPQGPAQRSPPPPYPG NARK
Struktura Proizvod gena je jednoprolazni tip 1 transmembranskog proteina sa četiri egzona i vrlo velikim intronom od 85,8 kb i kodira protein koji sadrži 154 aminokiseline. Najistaknutije obilježje identificirano u proteinu je centralni, jedinstveni cisteinom i tirozinom bogati proteinski domen, na dijelu proteina koji se nalazi unutar ćelije. Utvrđeno je da je ovaj domen jako konzerviran kod nižih kičmenjaka (riba) do ljudi, ali ga nema kod bakterija i beskičmenjaka.
Svojstva i domeni Bioinformatička analiza predvidjela je sljedeća svojstva za CYYR1: Molekulaska težina = 16,6 kdal Izoelektrična tačka = 8,28 Aminokiselinska sekvenca duga je 153 aminokiseline i sadrži tri domea.SDSC Biology Workbench 2.0 1 MDAPRLPVRP GVLLPKLVLL FVYADDCLAQ CGKDCKSYCC DGTTPYCCSY 51 YAYIGNILSG TAIAGIVFGI VFIMGVIAGI AICICMCMKN HRATRVGILR 101 TTHINTVSSY PGPPPYGHDH EMEYCDLPPP YSPTPQGPAQ RSPPPPYPGN 151 ARK Korištenjem bioinformatičkih alata utvrđeni su sljedeći domeni: Signalni peptid – Položaj 1–29 Transmembranski domen – Položaj 62–82 Poli-prolinski domen – Položaj 144–149
Ortolozi Višestruka poravnavanja sekvenci urađena su sa ortolozima gena CYYR1 i pokazuju da je proteinska sekvenca visoko konzervirana kod svih kičmenjaka.
Rod i vrsta Pristupni broj Identiitet skvence Pan troglodytes XP_001158941.1 99,2% Macaca mulatta XP_001104127.1 95,5% Mus musculus NP_659102.1 88,2% Xenopus laevis NP_001088967.1 74,3% Danio rerio NP_998047.1 60,4%
U Homo sapiens nema poznatih ili predviđenih paraloga.
Interakcije Pokazalo se da CYYR1 povećava nivo glutationa (GSH) u ćelijama kvasca kada nadopunjuje defekt u preuzimanju GSH u ćelijama kvasca kojima nedostaje Hgt1p, primarni transporter GSH kvasaca. Međutim, gen CYYR1 nije prirodno pronađen u kvascu, tako da je funkcija CYYR1 još uvijek nepoznata.
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 21 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika