Sintaksin-vezujući protein 5 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom STXBP5 sa hromosoma 6. Također je poznat kao tomozin, po japanskom 友 = "prijatelj", zbog svoje uloge vezujućeg proteina.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 1.151 aminokiselina, a molekulska težina 127.573 Da.
1020304050 MRKFNIRKVLDGLTAGSSSASQQQQQQHPPGNREPEIQETLQSEHFQLCK TVRHGFPYQPSALAFDPVQKILAVGTQTGALRLFGRPGVECYCQHDSGAA VIQLQFLINEGALVSALADDTLHLWNLRQKRPAILHSLKFCRERVTFCHL PFQSKWLYVGTERGNIHIVNVESFTLSGYVIMWNKAIELSSKSHPGPVVH ISDNPMDEGKLLIGFESGTVVLWDLKSKKADYRYTYDEAIHSVAWHHEGK QFICSHSDGTLTIWNVRSPAKPVQTITPHGKQLKDGKKPEPCKPILKVEF KTTRSGEPFIILSGGLSYDTVGRRPCLTVMHGKSTAVLEMDYSIVDFLTL CETPYPNDFQEPYAVVVLLEKDLVLIDLAQNGYPIFENPYPLSIHESPVT CCEYFADCPVDLIPALYSVGARQKRQGYSKKEWPINGGNWGLGAQSYPEI IITGHADGSVKFWDASAITLQVLYKLKTSKVFEKSRNKDDRPNTDIVDED PYAIQIISWCPESRMLCIAGVSAHVIIYRFSKQEVITEVIPMLEVRLLYE INDVETPEGEQPPPLPTPVGGSNPQPIPPQSHPSTSSSSSDGLRDNVPCL KVKNSPLKQSPGYQTELVIQLVWVGGEPPQQITSLAVNSSYGLVVFGNCN GIAMVDYLQKAVLLNLGTIELYGSNDPYRREPRSPRKSRQPSGAGLCDIS EGTVVPEDRCKSPTSGSSSPHNSDDEQKMNNFIEKVKTKSRKFSKMVAND IAKMSRKLSLPTDLKPDLDVKDNSFSRSRSSSVTSIDKESREAISALHFC ETFTRKTDSSPSPCLWVGTTLGTVLVIALNLPPGGEQRLLQPVIVSPSGT ILRLKGAILRMAFLDTTGCLIPPAYEPWREHNVPEEKDEKEKLKKRRPVS VSPSSSQEISENQYAVICSEKQAKVISLPTQNCAYKQNITETSFVLRGDI VALSNSICLACFCANGHIMTFSLPSLRPLLDVYYLPLTNMRIARTFCFTN NGQALYLVSPTEIQRLTYSQETCENLQEMLGELFTPVETPEAPNRGFFKG LFGGGAQSLDREELFGESSSGKASRSLAQHIPGPGGIEGVKGAASGVVGE LARARLALDERGQKLGDLEERTAAMLSSAESFSKHAHEIMLKYKDKKWYQ F
Struktura Prvobitno su identificirane dva funkcionalna domena, uključujući jedan koji se veže za sintaksin, ali je nedavna kristalizacija homologa kvasca Sro7 otkrila da tomozin vjerovatno ima tri funkcionalna domena: jedan WD40 domen i jedan domen koji se veže za sintaksin, kao što je prethodno prepoznato, ali i drugi WD40 domen. Studija je također sugerirala da tomozinski 'sintaksin vezujući domen' nije razlog zašto tomozin inhibira oslobađanje neurotransmitera, kao što je prvobitno predloženo. Struktura zasnovana na Sro7 data je na SWISS-MODEL-u, koji uključuje WD40 domene, ali ne i većinu domena upredene zavojnice koji veže sintaksin vidljiv u infokutiji.
Funkcija
Sintaksin 1 je komponenta 7S i 20S SNARE kompleksa koji su uključeni u preradu i fuziju sinapsnih vezikula sa presinapsnom plazmamembranom. Ovaj gen kodira protein koji se vezuje za sintaksin 1. Kod pacova, sličan protein disocira sintaksin 1 od kompleksa Munc18/n-Sec1/rbSec1, da bi se formirao 10S kompleks, intermedijer koji se može konvertovati u 7S SNARE kompleks. Stoga se smatra da je ovaj protein uključen u oslobađanje neurotransmitera, stimulirajući formiranje SNARE kompleksa. Identificirane su alternativno prerađene varijante transkripta, ali njihova biološka valjanost nije utvrđena.
Poziciono kloniranje sugerira da tomozin može inhibirati lučenje neurotransmitera u neuronima Caenorhabditis elegans. Ova hipoteza je testirana i potvrđena, pokazujući da tomozin specifično inhibira primanje sinapsnih vezikula – biohemijski korak koji neposredno prethodi fuziji vezikula i oslobađanju neurotransmitera.
Interakcije
Pokazalo se da STXBP5 ima interakcije sa STX4 i STX1A.
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Kategorija:Geni na hromosomu 6 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika