XPB (xeroderma pigmentosum tip B) je ATP-ovisna DNK helikaza , kod ljudi koji je dio kompleksa transkripcijskog faktora TFIIH, Kod ljudi, gen XPB nalazi se na hromosomu 2.
Struktura Dr. John Tainer i njegova grupa u The Scripps Research Institute riješili su 3D strukturu arhejskog homologa XPB rendgenskom kristalografijom.
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 782 aminokiseline, a molekulska težina 89.278 Da.
1020304050 MGKRDRADRDKKKSRKRHYEDEEDDEEDAPGNDPQEAVPSAAGKQVDESG TKVDEYGAKDYRLQMPLKDDHTSRPLWVAPDGHIFLEAFSPVYKYAQDFL VAIAEPVCRPTHVHEYKLTAYSLYAAVSVGLQTSDITEYLRKLSKTGVPD GIMQFIKLCTVSYGKVKLVLKHNRYFVESCHPDVIQHLLQDPVIRECRLR NSEGEATELITETFTSKSAISKTAESSGGPSTSRVTDPQGKSDIPMDLFD FYEQMDKDEEEEEETQTVSFEVKQEMIEELQKRCIHLEYPLLAEYDFRND SVNPDINIDLKPTAVLRPYQEKSLRKMFGNGRARSGVIVLPCGAGKSLVG VTAACTVRKRCLVLGNSAVSVEQWKAQFKMWSTIDDSQICRFTSDAKDKP IGCSVAISTYSMLGHTTKRSWEAERVMEWLKTQEWGLMILDEVHTIPAKM FRRVLTIVQAHCKLGLTATLVREDDKIVDLNFLIGPKLYEANWMELQNNG YIAKVQCAEVWCPMSPEFYREYVAIKTKKRILLYTMNPNKFRACQFLIKF HERRNDKIIVFADNVFALKEYAIRLNKPYIYGPTSQGERMQILQNFKHNP KINTIFISKVGDTSFDLPEANVLIQISSHGGSRRQEAQRLGRVLRAKKGM VAEEYNAFFYSLVSQDTQEMAYSTKRQRFLVDQGYSFKVITKLAGMEEED LAFSTKEEQQQLLQKVLAATDLDAEEEVVAGEFGSRSSQASRRFGTMSSM SGADDTVYMEYHSSRSKAPSKHVHPLFKRFRK
Funkcija XPB ima značajnu ulogu u normalnoj baznoj transkripciji, transkripcijski spojenom popravku (TCR) i popravak ekscizijom nukleotida (NER). Pokazalo se da pročišćeni XPB odmotava DNK sa 3’-5’ polarnosti.
Funkcija XPB(ERCC3) proteina u NER-u je da pomogne u odmotavanju DNK dvostruke spirale nakon što se oštećenje prvobitno prepozna. NER je put u više koraka koji uklanja širok spektar različitih oštećenja DNK koja narušavaju normalno uparivanje baza. Takva oštećenja uključuju glomazne hemijske adukte, UV-inducirane pirimidinske dimere i nekoliko oblika oksidativnog oštećenja. Mutacije gena XPB(ERCC3) mogu kod ljudi dovesti do bolesti xeroderma pigmentosum (XP) ili XP u kombinaciji sa Cockayneovim sindromom (XPCS). Mutantne XPB ćelije pojedinaca sa XPCS fenotipom su osjetljive na UV-zračenje i akutni oksidativni stres.
Poremećaji Mutacije u XPB i drugim srodnim komplementarnim grupama, XPA-XPG, dovode do brojnih genetički poremećaj|genetičkih poremećaja]] kao što su Xeroderma pigmentosum, Cockayneov sindrom i trihotiodistrofija.
Interakcije Pokazalo se da je XPB u interakciji sa:
BCR, CDK7, ERCC2, GTF2H1, GTF2H2, GTF2H4, GTF2H5, P53, PSMC5, i XPC.
Inhibitori malih molekula Snažni, bioaktivni prirodni proizvodi poput triptolida koji inhibiraju transkripciju sisara putem inhibicije XPB podjedinice općeg transkripcijskog faktora TFIIH nedavno su prijavljeni kao konjugat glukoze za ciljanje hipoksijskih ćelija raka s povećanom ekspresijom transportera glukoze.
Također pogledajte Xeroderma pigmentosum, komplementarna grupa G
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi GeneReviews/NIH/NCBI/UW entry on Xeroderma Pigmentosum
Kategorija:EC 3.6.4 Kategorija:Geni na hromosomu 2 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika Kategorija:Replikacija DNK