Protein 2 sa nukleotid-vezujućim domenom oligomerizacije (NOD2), znan i kao protein 15 sa domenom regrotacije kaspaze (CARD15) ili protein 1 upalne bolesti crijeva (IBD1), jest protein koji je kod ljudi kodiran genom NOD2 sa p kraka hromosoma 16. NOD2 ima važnu ulogu u imunskom sistemu. Prepoznaje bakterijske molekule (peptidoglikane) i stimulira imunsku reakciju.
NOD2 je unutarćelijski receptor prepoznavanja uzorka, koji je po strukturi sličan rezistentnim proteinima biljaka i prepoznaje molekule koji sadrže specifičnu strukturu zvanu muramil-dipeptid (MDP) koja se nalazi u određenim bakterijama.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 1.040 aminokiselina, a molekulska težina 115.283 Da.
1020304050 MGEEGGSASHDEEERASVLLGHSPGCEMCSQEAFQAQRSQLVELLVSGSL EGFESVLDWLLSWEVLSWEDYEGFHLLGQPLSHLARRLLDTVWNKGTWAC QKLIAAAQEAQADSQSPKLHGCWDPHSLHPARDLQSHRPAIVRRLHSHVE NMLDLAWERGFVSQYECDEIRLPIFTPSQRARRLLDLATVKANGLAAFLL QHVQELPVPLALPLEAATCKKYMAKLRTTVSAQSRFLSTYDGAETLCLED IYTENVLEVWADVGMAGPPQKSPATLGLEELFSTPGHLNDDADTVLVVGE AGSGKSTLLQRLHLLWAAGQDFQEFLFVFPFSCRQLQCMAKPLSVRTLLF EHCCWPDVGQEDIFQLLLDHPDRVLLTFDGFDEFKFRFTDRERHCSPTDP TSVQTLLFNLLQGNLLKNARKVVTSRPAAVSAFLRKYIRTEFNLKGFSEQ GIELYLRKRHHEPGVADRLIRLLQETSALHGLCHLPVFSWMVSKCHQELL LQEGGSPKTTTDMYLLILQHFLLHATPPDSASQGLGPSLLRGRLPTLLHL GRLALWGLGMCCYVFSAQQLQAAQVSPDDISLGFLVRAKGVVPGSTAPLE FLHITFQCFFAAFYLALSADVPPALLRHLFNCGRPGNSPMARLLPTMCIQ ASEGKDSSVAALLQKAEPHNLQITAAFLAGLLSREHWGLLAECQTSEKAL LRRQACARWCLARSLRKHFHSIPPAAPGEAKSVHAMPGFIWLIRSLYEMQ EERLARKAARGLNVGHLKLTFCSVGPTECAALAFVLQHLRRPVALQLDYN SVGDIGVEQLLPCLGVCKALYLRDNNISDRGICKLIECALHCEQLQKLAL FNNKLTDGCAHSMAKLLACRQNFLALRLGNNYITAAGAQVLAEGLRGNTS LQFLGFWGNRVGDEGAQALAEALGDHQSLRWLSLVGNNIGSVGAQALALM LAKNVMLEELCLEENHLQDEGVCSLAEGLKKNSSLKILKLSNNCITYLGA EALLQALERNDTILEVWLRGNTFSLEEVDKLGCRDTRLLL
Struktura thumbnail|left| Proteinski model NOD2 koji se sastoji od dva N-terminalna CARD domena (crvena) povezana preko spiralnog linkera (plava) sa centralnim NOD domenom (zelena). Na C-terminalu nalazi se LRR domen (cijan).
C-terminalni dio proteina sadrži ponavljanje bogato leucinom, domen za koji je poznato da ima ulogu u interakcijama protein-protein. Srednji dio proteina karakterizira NOD-ov domen uključen u samooligomerizaciju proteina. N-terminalni dio sadrži dva CARD domena za koje se zna da imaju ulogu u apoptozi i NF-κB putevima aktivacije.
Funkcija Ovaj gen je član porodice NOD1/Apaf-1 (također poznate kao porodica NOD-liki receptori) i kodira protein sa dva domena regrutacije kaspaze ( CARD-a) i jedanaest ponavljanja bogatih leucinom (LRR). Protein se prvenstveno eksprimira u leukocitima periferne krvi. Ima ulogu u imunskom odgovoru, tako što prepoznaje bakterijske molekule koje posjeduju muramil-dipeptidni (MDP) dio i aktivira NF-κB protein.
Klinički značaj Mutacije ovog gena su povezane sa Crohnovom bolešću, Blauovim sindromom, teškom plućnom sarkoidozom i bolešću transplanta protiv domaćina.
NOD2 gen je povezan sa upalnim bolestima kao što su upalna bolest crijeva/Crohnova bolest i Blauov sindrom.
Interakcije Pokazalo se da NOD2 reaguje sa NLRC4.
Također se pokazalo da se NOD2 vezuje za MAVS, kao odgovor na tretman ssRNK ili virusne RNK i aktivira IFN odgovor. Ovo je prvi izvještaj da NOD2 djeluje kao receptor za prepoznavanje uzoraka za viruse.
Također pogledajte Mifamurtid, NOD2 aktivator za liječenje osteosarkoma
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Kategorija:LRR proteini Kategorija:NOD-liki receptori Kategorija:Geni na hromosomu 16 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika