Nukleotidnovezujući protein 1 sa domenom oligomerizacije (NOD1) jest protein koji je kod ljudi kodiran genom NOD1 sa p kraka hromosoma 7. Prepoznaje bakterijske molekule i stimulira imunsku reakciju.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 953 aminokiseline, a molekulska težina 107.691 Da.
1020304050 MEEQGHSEMEIIPSESHPHIQLLKSNRELLVTHIRNTQCLVDNLLKNDYF SAEDAEIVCACPTQPDKVRKILDLVQSKGEEVSEFFLYLLQQLADAYVDL RPWLLEIGFSPSLLTQSKVVVNTDPVSRYTQQLRHHLGRDSKFVLCYAQK EELLLEEIYMDTIMELVGFSNESLGSLNSLACLLDHTTGILNEQGETIFI LGDAGVGKSMLLQRLQSLWATGRLDAGVKFFFHFRCRMFSCFKESDRLCL QDLLFKHYCYPERDPEEVFAFLLRFPHVALFTFDGLDELHSDLDLSRVPD SSCPWEPAHPLVLLANLLSGKLLKGASKLLTARTGIEVPRQFLRKKVLLR GFSPSHLRAYARRMFPERALQDRLLSQLEANPNLCSLCSVPLFCWIIFRC FQHFRAAFEGSPQLPDCTMTLTDVFLLVTEVHLNRMQPSSLVQRNTRSPV ETLHAGRDTLCSLGQVAHRGMEKSLFVFTQEEVQASGLQERDMQLGFLRA LPELGPGGDQQSYEFFHLTLQAFFTAFFLVLDDRVGTQELLRFFQEWMPP AGAATTSCYPPFLPFQCLQGSGPAREDLFKNKDHFQFTNLFLCGLLSKAK QKLLRHLVPAAALRRKRKALWAHLFSSLRGYLKSLPRVQVESFNQVQAMP TFIWMLRCIYETQSQKVGQLAARGICANYLKLTYCNACSADCSALSFVLH HFPKRLALDLDNNNLNDYGVRELQPCFSRLTVLRLSVNQITDGGVKVLSE ELTKYKIVTYLGLYNNQITDVGARYVTKILDECKGLTHLKLGKNKITSEG GKYLALAVKNSKSISEVGMWGNQVGDEGAKAFAEALRNHPSLTTLSLASN GISTEGGKSLARALQQNTSLEILWLTQNELNDEVAESLAEMLKVNQTLKH LWLIQNQITAKGTAQLADALQSNTGITEICLNGNLIKPEEAKVYEDEKRI ICF
Funkcija NOD1 protein sadrži domen regrutacije kaspaze (CARD). NOD1 je član porodice proteina nodolikih receptota i blizak je srodnik NOD2. NOD1 je unutarćrlijski receptor prepoznavanja uzoraka, koji je po strukturi sličan otpornim proteinima biljaka, i posreduje urođeni i stečeni imunitet, prepoznavanjem molekula koji sadrže dio D-glutamil-mezo-diaminopimelne kiseline (iE-DAP), uključujući bakterijski peptidoglikan. Nod1 stupa u interakciju sa RIPK2 preko Card domen|CARD-a]] obiju molekula (Pogledajte strukturu NOD1 CARD na desnom panelu). Stimulacija NOD1 molekulama koji sadrže iE-DAP rezultira aktivacijom faktora transkripcije NF-κB.
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Kategorija:LRR proteini Kategorija:Nodoliki receptori Kategorija:Geni na hromosomu 7 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika