CIITA je ljudski gen sa p kraka hromosoma 16, koji kodira protein zvani transaktivator klase II glavog kompleksa histokompatibilnosti. Mutacije ovog gena su odgovorne za sindrom golih limfocita u kojem je imunski sistem ozbiljno ugrožen i ne može se efikasno boriti protiv infekcije. Hromosomskim preuređenjem CIITA-e uključeno je u patogenezu Hodgkinovog limfoma i primarnog medijastinskog B-ćelijskog limfoma.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 1.130 aminokiselina, a molekulska težina 123.514 Da.
1020304050 MRCLAPRPAGSYLSEPQGSSQCATMELGPLEGGYLELLNSDADPLCLYHF YDQMDLAGEEEIELYSEPDTDTINCDQFSRLLCDMEGDEETREAYANIAE LDQYVFQDSQLEGLSKDIFKHIGPDEVIGESMEMPAEVGQKSQKRPFPEE LPADLKHWKPAEPPTVVTGSLLVRPVSDCSTLPCLPLPALFNQEPASGQM RLEKTDQIPMPFSSSSLSCLNLPEGPIQFVPTISTLPHGLWQISEAGTGV SSIFIYHGEVPQASQVPPPSGFTVHGLPTSPDRPGSTSPFAPSATDLPSM PEPALTSRANMTEHKTSPTQCPAAGEVSNKLPKWPEPVEQFYRSLQDTYG AEPAGPDGILVEVDLVQARLERSSSKSLERELATPDWAERQLAQGGLAEV LLAAKEHRRPRETRVIAVLGKAGQGKSYWAGAVSRAWACGRLPQYDFVFS VPCHCLNRPGDAYGLQDLLFSLGPQPLVAADEVFSHILKRPDRVLLILDG FEELEAQDGFLHSTCGPAPAEPCSLRGLLAGLFQKKLLRGCTLLLTARPR GRLVQSLSKADALFELSGFSMEQAQAYVMRYFESSGMTEHQDRALTLLRD RPLLLSHSHSPTLCRAVCQLSEALLELGEDAKLPSTLTGLYVGLLGRAAL DSPPGALAELAKLAWELGRRHQSTLQEDQFPSADVRTWAMAKGLVQHPPR AAESELAFPSFLLQCFLGALWLALSGEIKDKELPQYLALTPRKKRPYDNW LEGVPRFLAGLIFQPPARCLGALLGPSAAASVDRKQKVLARYLKRLQPGT LRARQLLELLHCAHEAEEAGIWQHVVQELPGRLSFLGTRLTPPDAHVLGK ALEAAGQDFSLDLRSTGICPSGLGSLVGLSCVTRFRAALSDTVALWESLQ QHGETKLLQAAEEKFTIEPFKAKSLKDVEDLGKLVQTQRTRSSSEDTAGE LPAVRDLKKLEFALGPVSGPQAFPKLVRILTAFSSLQHLDLDALSENKIG DEGVSQLSATFPQLKSLETLNLSQNNITDLGAYKLAEALPSLAASLLRLS LYNNCICDVGAESLARVLPDMVSLRVMDVQYNKFTAAGAQQLAASLRRCP HVETLAMWTPTIPFSVQEHLQQQDSRISLR
Funkcija CIITA iRNK može se detektovati samo u ljudskom leukocitnzm antigenima (HLA) sistema klase II-pozitivne ćelijske linije i tkiva. Ova vrlo ograničena distribucija tkiva sugerira da je ekspresija gena HLA klase II u velikoj mjeri pod kontrolom CIITA-e. Međutim, izgleda da se CIITA ne vezuje direktno za DNK. Umjesto toga CIITA funkcionira kroz aktivaciju transkripcijskog faktora RFX5. Stoga je CIITA klasifikovan kao transkripcijski koaktivator.
CIITA protein sadrži kiseli domenski aktivator transkripcije, 4 LRRs (leucinom bogatih ponavljanja) i GTP vezujući domen. Protein koristi GTP vezivanje kako bi olakšao vlastiti transport u jedro. Jednom u jedru, protein djeluje kao pozitivan regulator transkripcija gena, glavnog kompleksa histokompatibilnosti klase II i često se naziva "master kontrolni faktor" za ekspresiju ovih gena.
Ekspresiju CIITA inducira interferon gama, možda potpomognut drugim signalima. MHC II ekspresija u ćelijama crijevnog epitela je pojačana pod upalom.
Interakcije Pokazalo se da CIITA interraguje sa:
MAPK1, Koaktivator 1 jedearnog receptora, RFX5, RFXANK, XPO1, i ZXDC.
Također pogledajte MHC klasa II
Reference
Vanjski linkovi
Kategorija:LRR proteini Kategorija:NOD receptori Kategorija:Geni na hromosomu 16 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika