Secret Invasion és un crossover ficcional en format sèrie limitada escrit pel estatunidenc Brian Michael Bendis, dibuixat per Leinil Francis Yu, i publicat per l'editorial Marvel Comics el 2008.

La sèrie explica la invasió fictícia sobre el planeta Terra planejada per la raça alienígena skrull, i com es van infiltrar (suplantant alguns superherois) i com es desenvolupa la guerra per a fer-los fora.

Antecedents Després de la Guerra Kree-Skrull, un grup secret anomenat els Illuminati (conformat per Iron Man, Dr. Strange, Namor, Reed Richards, Black Bolt i Charles Xavier) viatja a la capital de l'imperi dels skrull amb la finalitat d'advertir al seu emperador que la Terra no toleraria un altre atac per part d'ells. Quan es retiren són atacats i capturats pels Skrull. Durant la seva reclusió, a cadascun dels Illuminati se'ls analitza la seva més poderosa característica (l'armadura d'Iron Man, la màgia del Dr. Strange, la raó de la força de Namor, l'elasticitat de Reed Richards, les cordes vocals de Black Bolt, i els poders psíquics de Charles Xavier).

Poc després d'això aconsegueixen escapar, però la raça ja té el que volia d'ells. Els Illuminati van arribar a la conclusió que una invasió skrull era imminent. Temps després la reina skrull Veranke, seguint una antiga profecia, comença a reclutar i moure les seves tropes per a una invasió, ja que la Terra és l'únic lloc on podrien sobreviure després que Galactus devastés l'imperi. El primer skrull que es va poder infiltrar seria una versió d'Elektra Natchios. En el moment que la invasió va ser planejada, va haver-hi moltes coses que els skrulls van haver de tractar: Primer: Els mutants; es va deixar clar que l'imperi no podria barallar contra un exèrcit de mutants i aquesta va ser la raó per la qual van sobrevenir els esdeveniments de House of M. Segon: Es necessitava que els superherois es dividissin, barallessin entre ells... motiu pel qual van tenir lloc els esdeveniments de Civil War. Tercer: Les mines de vibranium a la terra salvatge, mineral amb el qual podrien elaborar-se armes tan poderoses que no li donarien cap oportunitat a l'imperi Skrull de conquistar la Terra. Quart: La dissolució dels Venjadors. Es necessitava que els herois més poderosos de la Terra no estiguessin i efectivament es va aconseguir que Hulk fos tancat sota terra (en World War Hulk), Thor va morir en batalla en el Ragnarok i, La Bruixa Escarlata es va tornar mentalment inestable i va desaparèixer, el Dr. Estrany va deixar de ser el "hechicero" suprem i finalment es va assumir que Sentry tard o d'hora acabaria per sucumbir a la seva pròpia bogeria.

Invasió Secreta Després de la guerra kreeoskrull Poc després de la guerra kreeoskrull, un petit grup d'herois de la Terra es van unir per a enfrontar-se en secret contra l'Imperi Skrull. Oficialment es va fer dir "Iluminati", aquest grup representa les diverses faccions de l'univers Marvel, i consistia en Iron Man (Tony Stark), Mr. Fantàstic (Reed Richards), Namor, Black Bolt (Blackagar Boltagon), Charles Xavier i Doctor Strange (Stephen Strange). Van atacar la capital de l'imperi, i després van amenaçar l'emperador que un altre atac dels Skrulls els portaria a la guerra. Malgrat tot, van ser capturats, separats, i van experimentar amb ells. Els Skrulls van analitzar els seus captius (la seva fisiologia, genètica, i tecnologia, etc) i la informació obtinguda a partir del seu comportament, fins que Iron Man va ser capaç de crear una oportunitat per a fugir. Els Illuminati van reconèixer que un altre atac era inevitable, mentre que l'Imperi Skrull va començar a fer ús de les dades compilades. La recerca va donar lloc a la creació de clons impossibles de distingir dels originals, que tenien la capacitat de duplicar gairebé qualsevol poder sobrehumà, i que eren plenament conscient de les emocions o els records de la persona que copiaven.

L'hereva al tron Skrull, la Princesa Veranke, va al·legar que una profecia predeia l'anihilació del seu planeta i la necessitat de trobar un de nou (en aquest cas la Terra). El Rei Dorrek la va exiliar del seu món a una presó per tal d'incitar l'extremisme religiós. Després de la destrucció del planeta Skrull per part de Galactus, Veranke va esdevenir la nova reina de llinatge, i això assenyalava el ressorgiment de l'Imperi Skrull sota el seu comandament. Ella va decidir liderar una invasió contra la Terra amb la informació obtinguda dels Iluminati. El pla consistia en disfressar-se com a persones importants de la societat i així afeblir les defenses de la Terra des de dins, la qual cosa deixaria vulnerable el planeta per a un assalt militar. Veranke va decidir que ella mateixa suplantaria a Spider-Woman, raonant com es podria fer el major dany.

La Infiltració Després dels esdeveniments de Secret War, Nick Fury passa a la clandestinitat després de descobrir que una invasió alienígena és imminent. Fury recluta a Jessica Drew (Spider-Woman) perquè s'infiltre en H.I.D.R.A. i S.H.I.E.L.D., d'aquesta podria estar vigilant en tots dos fronts a la recerca de qualsevol activitat sospitosa. No obstant això, la cèl·lula d'H.I.D.R.A. amb la qual fa contacte, sobtadament es revela com un esquadró d'invasió Skrull. Això li dona una oportunitat a la reina Veranke per a reemplaçar a Jessica Drew. Fury recluta l'exagent de S.H.I.E.L.D. Daisy Jonhson amb la finalitat de reclutar un grup d'adolescents superpoderosos, l'existència dels quals tan sols Fury coneixia. Els adolescents (Yo Yo, Druid, Stonewall, Phobos i Hellfire) juntament amb l'agent Jonhson formen els nous Howling Commandos de Nick Fury. Gràcies al curt temps en què la reina Veranke va substituir a Jessica Drew i la fugida massiva de la Bassa, el pla skrull avança sense impediments, però alhora, Veranke és convidada a formar part dels Nous Venjadors, cosa que accepta per a poder-se infiltrar al grup.

Sota les ordres de la Reina, un grup d'infiltrats skrulls disfressats d'agents S.H.I.E.L.D. i dirigit per un nou agent skrull disfressat de Fontaine comença a fer explotar les mines de Vibranium a la Terra Salvatge, utilitzant com a esclaus els nadius. Ells són descoberts per Ka-Tsar, Shanna, i Sauron, que organitzen una força guerrillera per oposar-se a la imminent invasió skrull. Els agents S.H.I.E.L.D. skrulls, amb excepció del skrull de Fontaine, són destruïts per una explosió del portaavions quan els Nous Venjadors viatgen a la Terra Salvatge.

Un temps després es produeix una batalla entre els Nous Venjadors i el clan ninja The Hand (la Mà) per a la sort de Maya Lopez (Ronin). Durant la lluita, Ronin s'allibera de la influència de la mà i assassina el seu líder Elektra. Moments després de la seva mort, Elektra es revela com un skrull. Augmentant les tensions entre els Nous Venjadors, ja que ningú va ser capaç de detectar la veritable naturalesa d'Elektra. Ells suposen que qualsevol d'ells també podria ser un skrull. Spider-Woman "suggereix que es lliuri el cadàver de l'Elektra skrull a Iron Man, però Luke Cage s'oposa, ja que creu que Iron Man és un skrull també. Durant l'accident de l'aterratge de la nau en la qual viatgen, a causa de l'enfrontament dels The Mighty Avengers contra el virus Ultron, Spider-Woman (Veranke) noqueja Wolverine, l'únic membre de l'equip que roman conscient després de l'impacte, i s'emporta el cadàver d'Elektra per portar-ho davant Iron Man.

Iron Man queda esbalaït en contemplar el cadàver de l'Elektra skrull, i llavors suposa que és conseqüència de l'atac dels Iluminati a l'imperi Skrull anys enrere. Ell reuneix el grup per primera vegada des de la seva separació poc abans de Civil War, i es pregunta si açò significa que una invasió ha tingut lloc. El grup es mostra sorprès i se sorprèn encara més quan Black Bolt parla per donar la seva opinió. Aleshores es revela que Black Bolt també és un skrull i comença a lluitar contra el grup. Aquest fals Black Bolt a més dels poders de l'original posseeix els poders combinats dels altres Illuminati. Namor se les arregla per a matar el fals Black Bolt, però després són atacats per altres 2 skrulls amb els poders de Cyclops, Colossus, i Nightcrawler; a més un d'ells carrega una còpia tecnològica del martell de Thor (Mjolnir). Aquests skrulls són morts per Iron Man, que detona una petita bomba nuclear amb la seva armadura. Namor els recorda que qualsevol d'ells també podria ser un skrull, i que la confiança s'ha trencat. Després d'això els cinc prenen camins diferents.

La Invasió La història comença amb el Passatge dels 11, un versicle del Llibre dels Mons dels skrulls:

Anys enrere, un comando explorador skrull es dirigeix a unes coves, anunciant a diversos éssers amb túniques que l'imperi ha estat destruït. Tal com ho diuen les escriptures, és moment d'actuar. El comando sembla assentir a les ordres de la seva "Reina".

En el present, a la base espacial de SWORD en l'òrbita terrestre, Dum Dum Dugan està de visita juntament amb l'agent Brand i es disposen a iniciar una reunió informativa; quan de sobte els radars de la base detecten una nau skrull, que impacta a la Terra Salvatge. Immediatament, Tony Stark és notificat d'aquest esdeveniment, i deixa a Hank Pym i Reed Richards a càrrec de l'autòpsia del cadàver del skrull que es va fer passar per Elektra, la fisiologia del qual s'ha perfeccionat fins a ser indetectable. Tony avisa a Spider-Woman, que al seu torn li ho notifica a Luke Cage i als seus Nous Venjadors, ja que prefereix confiar més en ells que en el propi Stark a l'hora d'interceptar la nau skrull. Jarvis escolta atent. Amb l'ajuda de Cloak els Nous Venjadors entren a la Torre Stark i se n'adonen de la presència de Black Widow. Més tard, els Nous Venjadors arriben a la Terra Salvatge. En apropar-se a la seva destinació, els Venjadors perceben que la base on van ser capturats pels Mutats de Sauron (Nous Venjadors, núm.5) no està igual com l'havien deixat anteriorment. Tanmateix, això no els deté, i arriben a on es troba la nau; només per a ser interceptats per Iron Man i els seus The Mighty Avengers. Cage no escolta les amenaces de Tony i obre la comporta de la nau.

En aquest mateix instant, Dum Dum Dugan mussita: "Ell t'Estima". Tot seguit, la base de SWORD explota, i els seus ocupants activen els seus vestits especials per sobreviure al buit de l'espai. Jarvis, a la Torre Stark, trau del seu vestit un control remot, alliberant un virus alienígena que afecta la biotecnologia de Stark, així com a totes les seves propietats. Jarvis murmura ""Ell t'Estima".

A l'Edifici Baxter, un turista se separa d'un grup visitant, es tracta de Lyja que pren la forma de Sue Storm, i accedeix al laboratori de Reed Richards; sense fer cas a les salutacions del seu germà Johnny, i els seus fills Franklin i Valeria. Johnny creia que Susan estava en Vancouver. Invisible Woman activa un portal cap a la Zona Negativa, el qual engoleix tota la part superior de l'Edifici Baxter; repetint, "Ell t'Estima".

Mentrestant a la Terra Salvatge, Tony es desmaia, amb la seva armadura inservible. Cage creu que és un engany, i els altres dubten a l'hora d'ajudar-lo. L'Agent Brand li notifica a SHIELD l'ocorregut a l'espai, però Maria Hill no pot fer res al respecte; ja que també el virus va afectar la infraestructura tecnològica del Helicarrier, que sembla col·lapsar-se sobre una metròpoli americana. Poc després, la Muntanya Thunderbolt és atacada pel Capità Mar-Vell dels kree, deixant fora de combat els Thunderbolts: Norman Osborn, Songbird, i Swordsman. Dues presons per a superdolents són desactivades alliberant tots els seus presos. També, a la presó de màxima seguretat de The Raft, ocorre un desperfecte en els sistemes, permetent que els interns escapin, incloent Doctor Doom, capturat recentment. El kree Noh Varr, que va prendre com seva la presó secreta de The Cube, és testimoni d'un motí, provocat per fallades en els sistemes de seguretat. Noh Varr decideix posar fi al seu auto-exili, i deixa la presó.