Kostel svatého Jana Nepomuckého se v Praze nachází na těchto místech:
Kostel svatého Jana Nepomuckého (Dejvice) – zvaný V trníčku, na Jenerálce, barokní Kostel svatého Jana Nepomuckého (Hradčany) – původně u kláštera voršilek, dnes vojenský, barokní od K. I. Dientzenhofera Kostel svatého Jana Nepomuckého (Košíře) – funkcionalistický Kostel svatého Jana Nepomuckého na Skalce – na Novém Městě, barokní od K. I. Dientzenhofera Kostel svatého Jana Nepomuckého (Velká Chuchle) – ve Velké Chuchli, barokní
Související články Kaple svatého Jana Nepomuckého (Praha)