náhled|Katedrála svatého Víta, Václava a Vojtěcha na Hradčanech náhled|Čeští buddhisté se zenovou mistryní Bon Shim Církve a náboženské společnosti v České republice mohou být registrovány podle speciálního zákona,Zákon č. 3/2002 Sb., o církvích a náboženských společnostechZákon č. 308/1991 Sb., o svobodě náboženské víry a postavení církví a náboženských společností (zrušen zákonem 3/2002 Sb.)Zákon č. 161/1992 Sb., o registraci církví a náboženských společností. (zrušen zákonem 3/2002 Sb.) čímž se stávají z hlediska státního práva právnickými osobami speciálního typu a mohou pak zřizovat a nechat si zaevidovat další právnické osoby podle téhož zákona. Případný vztah těchto vnitrostátních právnických osob k nadnárodní církvi nebo jiné organizaci musí být popsán v základním dokumentu, jehož zpracování je jednou z podmínek registrace.

Neregistrované církve a náboženské společnosti mohou na základě sdružovacího práva a dalších lidských práv svých členů působit také, a to buď jako jiný typ právnické osoby (například jako spolek) nebo neformálně bez společné právní subjektivity, ale pak se na ně nevztahují výsady ani povinnosti stanovené pro registrované církve a náboženské společnosti speciálním zákonem o církvích a náboženských společnostech, například právo požádat o oprávnění působit na státních školách, v armádě atd., o oprávnění být financovány podle zvláštních zákonů atd. Registrace není povinná, úvodní části zákona (§ 4, o svobodě vyznání, a § 5, podmínky vzniku a působení) se vztahují i na neregistrované církve a náboženské společnosti.

Zákon nenutí registrované církve a náboženské společnosti, aby se výslovně rozhodly, zda jsou církví, nebo zda jsou náboženskou společností, popřípadě obojím současně, a neumožňuje ani neukládá ani ministerstvu kultury, aby o tom v rámci registrace rozhodlo za ně. Proto registrované subjekty nelze jednoznačně na tyto dvě skupiny rozdělit, pokud se samy ve svém názvu nebo základním dokumentu některým z těchto slov neoznačily.

Církev a náboženská společnost rovněž není povinna se výslovně přihlásit k některému z náboženství nebo náboženských směrů, v základním dokumentu musí v tomto ohledu uvést pouze poslání církve a náboženské společnosti a základní články její víry.

Registrované církve a náboženské společnosti vpravo|50pxvpravo|50pxvpravo|50pxvpravo|50pxvpravo|50px

Ke konci roku 2025 je v České republice registrováno 45 církví a náboženských společností. Téhož roku bylo v rámci Ministerstva kultury ČR zřízeno samostatné oddělení pro církve a náboženské společnosti (SOCNS).Rok 2022 na samostatném oddělení církví a náboženských společností Ministerstva kultury : Dingir - Náboženský infoservis, 23. 2. 2023 Od té doby je počet úspěšně schválených církví a hnutí stejný, změny nastávají pouze v počtu řízení s novými uskupeními.

Rejstříky registrovaných církví a náboženských společností, svazů církví a náboženských společností a evidovaných právnických osob jsou veřejně přístupné.Rejstříky registrovaných církví a náboženských společností, svazů církví a náboženských společností a evidovaných právnických osob

Následující seznam je řazen chronologicky podle data registrace, subjekty se stejným datem registrace jsou řazeny abecedně. Zvláštními právy se rozumí 6 práv, která jsou přiznávána ministerstvem po splnění zákonných podmínek na základě žádosti: právo církevních sňatků, duchovní služby ve věznicích, v ozbrojených silách, vyučovat náboženství ve státních školách, zřizovat církevní školy a právo zpovědního tajemství.

Náboženské tradice v Česku Orientační symboly náboženství zastoupených v České republice: abrahámovská náboženství: 13px katolické křesťanství 13px pravoslavné křesťanství 13px evangelické křesťanství (protestantství) 15px evangelikální křesťanství, ostatní 18px judaismus 18px islám 18px Bahá'í  indická náboženství: 18px tibetský buddhismus (vadžrajána) 18px mahájánový buddhismus 18px zenový buddhismus (čchan) 18px théravádový buddhismus 18px hinduismus  nová náboženská hnutí: 18px slovanské novopohanství (Rodná víra) 18px eklektické novopohanství 18px Wicca 18px severské novopohanství 18px neodruidství 18px keltské novopohanství 15px scientologové 18px hnutí Haré Kršna

Seznam církví a náboženských společností Církve a náboženské společností registrované podle zákona č. 308/1991 Sb. náhled|170px|Okázale zdobený krucifix náhled|170px|Bible náhled|170px|Sousoší svatých Cyrila a Metoděje v Třebíči náhled|170px|Katedrální chrám svatých Cyrila a Metoděje, ústřední pravoslavný chrám pražské eparchie náhled|170px|Liturgické předměty judaismu náhled|170px|Gutenbergova bible náhled|170px|Sbor Prokopa Holého v Olomouci-Černovíře, Církev československá husitská náhled|170px|Socha Buddhy náhled|170px|Brněnská mešita (Brno-Štýřice, 2007) náhled|170px|Rituální pomůcky užívané v buddhismu Diamantové cesty, dordže, zvonek a mála.

13px Církev řeckokatolickáŘeckokatolická církev – Registrace převzata z Rakousko-Uherska, zvláštní práva včetně zpovědního tajemství a s výjimkou práva vyučování náboženství ve státních školách a zakládání církevních škol přiznána 7. ledna 2002. 13px Církev římskokatolickáŘímskokatolická církev – Registrace převzata z Rakousko-Uherska, zvláštní práva včetně zpovědního tajemství přiznána 7. ledna 2002, přidružený člen Ekumenické rady církví (ERC), člen Vojenské duchovní služby (VDS). 13px Českobratrská církev evangelická – Registrace převzata z Rakousko-Uherska, zvláštní práva včetně zpovědního tajemství přiznána 7. ledna 2002, člen ERC, člen VDS. 13px Evangelická církev augsburského vyznání v České republiceEvangelická církev augsburského vyznání (ECAV, dřívější Slovenská evangelická církev augsburského vyznání) – Registrace převzata z Rakousko-Uherska, zvláštní práva včetně zpovědního tajemství a s výjimkou práva vyučování náboženství ve státních školách a zakládání církevních škol přiznána 7. ledna 2002, člen ERC. 13px Jednota bratrskáJednota bratrská – Registrace převzata z Rakousko-Uherska, zvláštní práva včetně zpovědního tajemství s výjimkou vyučování náboženství ve státních školách přiznána 7. ledna 2002, člen ERC. 13px Pravoslavná církev v českých zemích – Registrace převzata z Rakousko-Uherska, zvláštní práva včetně zpovědního tajemství a s výjimkou práv vyučovat náboženství ve státních školách a zakládat církevní školy přiznána 7. ledna 2002, člen ERC. 13px Slezská církev evangelická augsburského vyznáníSlezská církev evangelická augsburského vyznání – Registrace převzata z Rakousko-Uherska, zvláštní práva včetně zpovědního tajemství přiznána 7. ledna 2002, člen ERC. 13px Starokatolická církev v České republiceStarokatolická církev – Registrace převzata z Rakousko-Uherska, zvláštní práva včetně zpovědního tajemství přiznána 7. ledna 2002, člen ERC. 13px Církev československá husitskáCírkev československá husitská – Registrace převzata z roku 1920, zvláštní práva včetně zpovědního tajemství přiznána 7. ledna 2002, člen ERC, člen VDS, 13px Náboženská společnost českých unitářůNáboženská společnost českých unitářů – Registrace převzata z roku 1930, zvláštní práva být financována, církevních sňatků a zpovědního tajemství přiznána 7. ledna 2002. 13px Bratrská jednota baptistůBratrská jednota baptistů – Registrace převzata z roku 1951, zvláštní práva včetně zpovědního tajemství s výjimkou vyučování náboženství ve státních školách přiznána 7. ledna 2002, člen ERC. 15px Federace židovských obcí v České republiceFederace židovských obcí – Registrace převzata z Rakousko-Uherska, zvláštní práva být financována, církevních sňatků a zřizování církevních škol přiznána 7. ledna 2002, pozorovatelský člen ERC. 13px Církev adventistů sedmého dneCírkev adventistů sedmého dne – Registrace převzata z roku 1951, zvláštní práva včetně zpovědního tajemství přiznána 7. ledna 2002, pozorovatelský člen ERC, člen VDS. 13px Církev bratrskáCírkev bratrská – Registrace převzata z roku 1951, zvláštní práva včetně zpovědního tajemství s výjimkou vyučování náboženství ve státních školách přiznána 7. ledna 2002, člen ERC, člen VDS. 13px Evangelická církev metodistickáEvangelická církev metodistická – Registrace převzata z roku 1951, zvláštní práva včetně zpovědního tajemství a s výjimkou práva vyučování náboženství ve státních školách a zakládání církevních škol přiznána 7. ledna 2002, člen ERC. 13px Křesťanské sboryKřesťanské sbory – Registrace převzata z roku 1956, zvláštní práva včetně zpovědního tajemství a s výjimkami práva být financována podle zvláštního zákona, práva působení v ozbrojených silách a práva zřizovat církevní školy přiznána 7. ledna 2002 13px Novoapoštolská církev v České republice – Registrace převzata z roku 1956, zvláštní práva církevních sňatků a zpovědního tajemství přiznána 7. ledna 2002. 13px Apoštolská církevApoštolská církev – Registrace převzata z roku 1989, zvláštní práva včetně zpovědního tajemství přiznána 7. ledna 2002, člen ERC. 13px Církev Ježíše Krista Svatých posledních dnů v České republiceCírkev Ježíše Krista svatých posledních dní – Registrace převzata z roku 1990, zvláštní práva církevních sňatků a zpovědního tajemství přiznána 7. ledna 2002. 13px Náboženská společnost Svědkové Jehovovi – Zaregistrována dne 1. září 1993, zvláštní práva církevních sňatků, duchovní služby ve věznicích a vyučování náboženství ve státních školách přiznána 7. ledna 2002, právo na zpovědní tajemství nejprve zamítnuto (v roce 2008 potvrzeno Ústavním soudem),http://aktualne.centrum.cz/domaci/soudy-a-pravo/clanek.phtml?id=601907 přiznáno 2011 na základě změny základního dokumentu. 13px Luterská evangelická církev augsburského vyznání v České republice – Zaregistrována dne 19. ledna 1995, zvláštní práva včetně zpovědního tajemství, s výjimkami působení ve věznicích a v armádě a práva zřizovat církevní školy, přiznána 7. ledna 2002. Vznikla rozdělením Slezské církve evangelické augsburského vyznání.

Církve a náboženské společností registrované podle zákona č. 3/2002 Sb.

13px Církev Křesťanská společenství – Zaregistrována dne 20. června 2002. 13px Obec křesťanů v České republiceObec křesťanů – Zaregistrována dne 4. září 2002. 15px Mezinárodní společnost pro vědomí Krišny, Hnutí Hare Krišna Česká republikaHare Krišna - Společnost pro vědomí Krišny , české stránky (ISKCON) – Zaregistrována 21. listopadu 2002. 15px Česká hinduistická náboženská společnostČeská hinduistická náboženská společnost – v počátcích v 90. letech jako Jóga v denním životě, zaregistrována 25. listopadu 2002. – Tatáž společnost změnila roku 2016 název na Višva Guru Díp Hindu Mandir – české hinduistické společenství (registrována od 11. června 2015), pod nímž působí do současnosti.Višva Guru Díp Hindu Mandir v Religionistické encyklopedii Známé uskupení Jóga v denním životě je její sesterskou organizací. 15px Ústředí muslimských obcí v České republice – Zaregistrována od 7. září 2004.Adam Drda: Čeští muslimové nepředstavují početnou skupinu, BBC, 7. září 2004 – Je jedinou náboženskou společností, která byla v minulosti uznána a registrace jí původním zákonem nebyla rokem 1991 přiznána: dosáhla jí až dodatečně.Vyjádření k návrhu zákona o svobodě náboženského vyznání a postavení církví a náboženských společností, Ústředí muslimských obcí v České republice, Vladimír Sáňka, 25. června 2001. 17px Buddhismus Diamantové cesty linie Karma Kagjü – Zaregistrována 8. června 2007. 15px Višva Nirmala Dharma – Zaregistrována 14. července 2007. 13px Ruská pravoslavná církev, podvorje patriarchy moskevského a celé Rusi v České republice – Zaregistrována 26. května 2007. 13px Církev živého BohaCírkev živého Boha – Zaregistrována 15. prosince 2007. 13px Církev Nová nadějeCírkev Nová naděje – Zaregistrována 3. září 2009. 13px Církev Slovo života – Zaregistrována 6. srpna 2010Jan Jiřička: Státní registraci letos získala jedna církev, na peníze dosáhne až za 10 let, iDnes.cz, 12. prosince 2010.