thumb|Molekylstrukturen af NCAM med fem immunglobulin-lignende domæner (Neural cell adhesion molecule eller CD56)
Immunglobulin-superfamilien er en familie af proteiner, der indeholder et eller flere immunglobulin-domæner eller immunglobulin-lignende domæner. Immunglobulin-superfamilien omfatter immunglobuliner og i hundredvis af andre proteiner med forskellige funktioner. Eksempler udover antistofferne er celleadhæsionsmolekyler, muskelproteiner bl.a. kæmpe muskelproteinet titin og receptortyrosinkinaser. Immunglobulin-lignende domæner kan være involveret i bindinger imellem proteiner og imellem proteiner og andre ligander.The Immunoglobulin Gene Superfamily. Basic Neurochemistry: Molecular, Cellular and Medical Aspects 1999
Immunglobulin-superfamilien er en af de største protein-familier og tegner sig for mere end 2 % af de samlede menneskelige gener. Yderligere er immunglobulin-lignende domæner rigt fordelt i naturen, i både hvirveldyr og hvirvelløse dyr, planter, svampe, parasitter, bakterier og virus med mange forskelligartede funktioner ud over molekylære bindings- og genkendelsesprocesser.Immunoglobulin domains in Escherichia coli and other enterobacteria: from pathogenesis to applications in antibody technologies. FEMS Microbiology Reviews 2013
Den molekylære evolutionshistorie er beskrevet her. “Immunoglobin Superfamily” af A.N. Barclay Immunglobulin-domænet
Immunoglobulin-domænet er en type proteindomæne der er kompakt og stabilt. Det består af en sandwich af to β-ark bygget op af 7-9 antiparallelle β-kæder, der krydser mellem de to β-ark. Typisk består domænet af 70-125 aminosyrer med en molekylvægt på 12-15 kDa.
De 7-9 β-kæders forskellige overkrydsning mellem to β-ark giver basis for fire forskellige immunglobulin-domæner: V-type, C1-type, C2-type og I-type og der refereres til proteinerne som V-set, C1-set, C2-set og I-set.Structural view of adherin-mediated cell-cell adhesion. Ikura 1999
Fire underfamilier
Der skelnes mellem fire underfamilier: V-sættet (efter Variabel, V-set) med V-type immunglobulindomæne, C1-sættet og C2-sættet (efter Constant, C1-set, C2-set) med hhv. C1-type og C2-type immunglobulindomæne samt I-sættet (efter Intermediate, I-set) med I-type immunglobulindomæne.
Et givent protein kan være i flere underfamilier, da det kan være opbygget med flere typer immunglobulin-domæner (se eksempler).
Nogle proteiner i immunglobulin-superfamilien thumb|Immunglobulin-domæner i muskelproteinet titin. a) Skematisk tegning af en del af en sarkomer. b) Udsnit af I-båndet med seks immunglobulin-domæner. c) β-kæderne i to β-ark i et immunglobulin-domæne.Disulfide isomerization reactions in titin immunoglobulin-domains enable a mode of protein elasticity. Nature Communications 2018
thumb|Proteindomæner af A-båndet af titin. Røde bånd er immunglobulin-domæner, hvide og gule bånd er Fn3-domæner, det sorte bånd er et domæne af proteinkinase.Epitope of titin A-band-specific monoclonal antibody Tit1 5 H1.1 is highly conserved in several Fn3 domains of the titin molecule. Cell Division 2012
112 I-type immunglobulin-domæner: kæmpe muskelproteinet titin, 3-3,7 MDa, det største protein, der kendes (se billederne)Damped elastic recoil of the titin spring in myofibrils of human myocardium. Proc Natl Acad Sci U S A. 2003 70 immunglobulin-domæner (20 V-type og 50 C-type domæner): IgM 24 immunglobulin-domæner (8 V-type og 16 C-type domæner): IgA 20 immunglobulin-domæner (fire V-type og 16 C-type domæner): IgD i regnbueørredDiscovery and Characterization of Secretory IgD in Rainbow Trout: Secretory IgD Is Produced through a Novel Splicing Mechanism. Journal of Immunology 2012 17 immunglobulin-domæner (et V-type og 16 C-type domæner): sialoadhesin, siglec-1 eller CD169, et lectin på overfladen af makrofager 14 immunglobulin-domæner (fire V-type og 10 C-type domæner): IgE og IgY fra fugle 12 immunglobulin-domæner (fire V-type og otte C-type domæner): IgG og IgD 12 immunglobulin-domæner (to V-type og 10 C-type domæner): IgNAR fra haj 10 immunglobulin-domæner (V-type og C2-type domæner): DSCAM, Downs Syndrome cell adhesion molecule regulerer neuroners Syv immunglobulin-domæner: VEGFR, vascular epidermis growth factor receptorStructure of the Full-length VEGFR-1 Extracellular Domain in Complex with VEGF-A. Structure 2017 Seks immunglobulin-domæner (to V-type og fire C-type domæner): hcIgG fra kamel m.fl. Fem immunglobulin-lignende domæner: NCAM, Neural cell adhesion molecule, CD56 Fire immunglobulin-domæner: CD4 Tre immunglobulin-domæner: nectin To immunglobulin-domæner: CAR (coxsackievirus- og adenovirus-receptoren),Coxsackievirus and Adenovirus Receptor Amino-Terminal Immunoglobulin V-Related Domain Binds Adenovirus Type 2 and Fiber Knob from Adenovirus Type 12. Journal of Virology 1999 CD2, CD8, CD58/LFA-3, Intercellular adhesion molecule (ICAM), Killer-cell immunoglobulin-like receptor, SIGLEC (sialinsyre-bindende lektiner) Et V-type immunglobulin-domæne: Thy1 eller CD90, markør for T-celler, det mindste medlem af immunglobulin-superfamilien Et C1-type immunglobulin-domæne: Major histocompatibility complex, MHC klasse I og klasse II Et immunglobulin-lignende domæne: Izumo, fusionsprotein på spermatozoerIzumo is part of a multiprotein family whose members form large complexes on mammalian sperm. Molecular Reproduction and Development 2009
For lister over proteiner i immunglobulin-superfamilien, se V-set, C1-set, C2-set og I-set.
Se også
Receptor
Henvisninger
Kategori:Proteiner