Jonstrup kan henvise til flere stednavne i Danmark: Jonstrup (Saltum Sogn) – en bebyggelse i Saltum Sogn, Jammerbugt Kommune. Jonstrup (Sankt Hans Sogn) – en bebyggelse og et ejerlav i Sankt Hans Sogn, Hjørring Kommune Jonstrup (Tikøb Sogn) – en bebyggelse og et ejerlav i Tikøb Sogn, Helsingør Kommune Jonstrup (Ugerløse Sogn) – en bebyggelse og et ejerlav i Ugerløse Sogn, Holbæk Kommune Jonstrup (ved Værløse) – en bebyggelse i Værløse og Måløv Sogne, Furesø og Ballerup Kommuner Jonstrup (herregård) - en forsvunden herregård i Osted Sogn, Lejre Kommune
Der kan desuden være tale om: Jonstrup Seminarium = Jonstrup Statsseminarium