thumb|500px|right|Representación gráfica del ADN circulante tumoral en el plasma sanguíneo.El ADN circulante tumoral (ADNct o ctDNA, circulating tumor DNA, por sus siglas en inglés) es ADN liberado al torrente sanguíneo proveniente de células tumorales liberadas al mismo mediante una serie de mecanismos que no están del todo esclarecidos.https://medlineplus.gov/spanish/genetica/entender/pruebas/adntumoralcirculante/ Por lo tanto, su cuantificación y caracterización podría ayudar en el diagnóstico de cáncer, tratamiento y detectar recaídas, así como para determinar las mutaciones en células tumorales. La detección del ADNct en plasma supone una herramienta emergente en la clínica pues es mínimamente invasiva, empleándose, sobre todo, en el campo de la oncología, aun así, se necesitan más ensayos para poder estudiar la evolución del tumor y la adquisición de mecanismos de resistencia ante fármacos (farmacorresistencia). Existen técnicas basadas en genómica, como la secuenciación del genoma completo (WGS (Whole genome sequencing), por sus siglas en inglés), que posibilitan estudiar el ADNct en diferentes tipos de cáncer teniendo en cuenta las características genéticas del cáncer.
Técnicas
WGMAF El WGMAF (Whole Genome Mutant Alelle Fractions) permite evaluar los niveles de ADNct a partir de una muestra del tumor del paciente obtenida realizando una biopsia, combinada con análisis de plasma periódicos. La técnica consiste en realizar un WGS para tumores que contengan al menos 50 mutaciones detectables, para poder monitorizar posteriormente los fragmentos asociados en el torrente sanguíneo.
Con la generación de una librería genética individualizada para cada paciente se puede monitorizar la respuesta a tratamientos quimioterápicos para poder catalogar al paciente como respondedor (reducción de fracción de alelos mutantes en plasma) o no respondedor (el medicamento de elección está siendo ineficaz y sería recomendable otra alternativa terapéutica).
ARTEMIS-DELFI ARTEMIS-DELFI (Analysis of repeat elements in disease-DNA evaluation of fragments for early interception) permite analizar el fragmentoma del ADNct en plasma, sin necesitar una biopsia previa de tumor. Esta técnica de machine learning permite evaluar cambios en la fragmentación del DNAct tras tratamiento quimioterápico, según la variación del número de copias del fragmentoma.
Los pacientes se pueden separar entre respondedores (scores bajos con poca variación del número de copias (CNV) en plasma) o no respondedores (scores altos, alta inestabilidad genética y variación del número de copias).
ARTEMIS-DELFI permite también identificar fast-fails (no respondedores) en pacientes tras un ciclo de quimioterapia, dirigiendo así hacia un cambio de fármaco que sí produzca respuesta.
Véase también Secuenciación del genoma Biopsia líquida
Referencias
Categoría:ADN Categoría:Oncología Categoría:Anatomía patológica Categoría:Neoplasias