Se denomina secuencia de aminoácidos, secuencia peptídica o secuencia aminoacídica al orden en que están dispuestas las unidades individuales llamadas aminoácidos, que se encadenan mediante enlaces peptídicos formando estructuras mayores denominadas péptidos.
Características La representación de una secuencia de aminoácidos (aa) se puede realizar de varias formas: por los nombres de sus aminoácidos, por un código de tres letras, por un código de una letra o por una representación gráfica.
Un ejemplo es la secuencia de aa del péptido natural de 10aa llamado hormona liberadora de gonadotropina (GnRH): Nombre completo: pÁcido glutámico-Histidina-Triptófano-Serina-Tirosina-Glicina-Leucina-Arginina-Prolina-Glicina–NH2 Código de tres letras: pGlu-His-Trp-Ser-Tyr-Gly-Leu-Arg-Pro-Gly–NH2 Código de una letra: pE-H-W-S-Y-G-L-R-P-G–NH2
La secuencia de aminoácidos se conoce como estructura primaria de la proteína. Esta secuencia determina su estructura tridimensional y su función biológica.
thumb|izq|Secuencia de aminoácidos de las dos cadenas de la insulina humana. thumb|300px|Estructura primaria de las cadenas de la insulina. Cadena A en verde, Cadena B en rojo.
Las cadenas lineales se pliegan sobre sí mismas para adquirir estructuras secundaria y terciaria. Durante décadas, la predicción de la estructura tridimensional a partir únicamente de la secuencia primaria representó uno de los mayores desafíos de la biología estructural, un hito alcanzado de forma precisa gracias al desarrollo de herramientas computacionales basadas en inteligencia artificial como AlphaFold.
La secuencia de aminoácidos de una proteína viene determinada en última instancia por la secuencia de nucleótidos del ADN del gen que la codifica.
Motivos Los motivos de secuencia de aminoácidos específicos generalmente median una función común, como la unión a otras proteínas o la localización subcelular particular. Debido a su corta longitud (5-15 aa) y a su alto nivel de variabilidad de secuencia, presentan desafíos para la predicción computacional simple.
Véase también Estructura primaria de las proteínas Enlace peptídico Polipéptido KKXX (secuencia de aminoácidos) KDEL
Referencias
Categoría:Estructura de las proteínas