En taxonomía, el nombre Biota o imperio Biota,Bernard Pelletier 2015, Empire Biota: Taxonomy and Evolution. Lulu.com, 2016 ISBN 1329799984, 9781329799981 se utiliza a veces para referirse al grupo taxonómico superior al superdominio que reúne a todas las entidades relacionadas con la vida. Todos los representantes de este clado están compuesto por biomoléculas, se propagan (ya sea por reproducción o replicación) y se relacionan con los otros organismos ya sea de manera perjudicial o beneficiosa. Se contraponen a las formas geológicas no biológicas clasificadas por Linneo en el reino Mineralia. No debe confundirse con el término "biota" usado en ecología, donde indica el conjunto de especies presentes en una región geográfica. Biota no es necesariamente un clado ni es sinónimo de ser vivo o vida, ya que incluye a los acelulares y otras formas donde no hay consenso de si son realmente seres vivos.
Biota deriva del griego «βίος» bíos = ‘vida’, y sus son sinónimos Vitae, Eobionti, Panbiota, TerrabiotaVitae BioLib y Bionta.WALTON, Lee Barker: "Studies Concerning Organisms Occurring in Water Supplies With Particular Reference to Those Founded in Ohio" in Ohio Biological Survey Bulletin, 24 (1930), pp.1-86.
El concepto incluye tanto a los organismos celulares o seres vivos universales como a los organismos no celulares (como los virus). No hay un acuerdo sobre si se debe denominar "ser vivo" únicamente a los celulares o a todas las entidades biológicas.
En todo caso, se usa a veces una clasificación en dos grandes superdominios o divisiones radicalmente diferentes:
Cytota: que incluye los organismos tanto unicelulares como pluricelulares, ya estén constituidos por células eucariotas o procariotas con genomas de ADN bicatenario. También incluye al organismo descubierto recientemente Parakaryon myojinensis. Acytota: que incluye replicadores o entidades acelulares como los virus, virusoides y viroides que contienen diferentes tipos de genomas.
También se han propuesto nuevos linajes de vida como los nanobios que están compuestos de nanoorganismos aún por definir, los estudios han afirmado que su estructura y morfología es similar a la de otros organismos celulares procariotas y que poseen algunas características que definen la vida como la composición orgánica, un tipo de membrana plasmática, reproducción, crecimiento, metabolismo o intercambio de energía, homeostasis, respuestas al cambio ambiental, etc. Pero existen discrepancias sobre si son seres vivos porque su tamaño es demasiado pequeño para almacenar el genoma. Estos últimos pueden incluirse en Cytota.
Origen y evolución
thumb|250px|La seta Amanita, la babosa Ariolimax y la herbácea Poa, representantes de los tres reinos eucariotas complejos (Animalia, Fungi y Plantae). El origen de los seres vivos es todavía un tema controvertido, los fósiles más antiguos que se conocen son los microfósiles de Canadá de entre hace 3770 millones de años, basado en el reloj molecular de arqueas y bacterias, se estima que el último antepasado común universal (LUCA) vivió hace 4.200 millones de años,A genomic timescale of prokaryote evolution: insights into the origin of methanogenesis, phototrophy, and the colonization of land. BMC. LUCA a su vez procedía de formas protocelulares intermediarias conocidas como protobiontes que vivieron durante el Hádico época en la que aparecieron los primeros replicadores entre 4250-4450 millones de años. De LUCA surgieron las bacterias y arqueas como dos linajes separados, aunque otra teoría poco apoyada sugiere que las arqueas se derivaron de las bacterias. Los estudios moleculares y ultraestructurales han descubierto que los eucariotas evolucionaron de arqueas del filo Promethearchaeota o Asgard en un evento de endosimbiosis con una alfaproteobacteria, a través de ellas se adquirieron las mitocondrias. Al mismo tiempo también se originarían otros orgánulos y se adquiriría la fagotrofia.Anja Spang et al. 2015 Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes. Nature. 2015 May 14; 521(7551): 173-179.Katarzyna Zaremba-Niedzwiedzka et al. 2016-2017, Asgard archaea illuminate the origin of eukaryotic cellular complexity. Nature 541, 353-358 (19 de enero de 2017) doi:10.1038/nature21031 Los protistas constituyen el estado ancestral de los animales, plantas y hongos según los análisis moleculares. De acuerdo con estos estudios los animales se originaron de una colonia de protozoos similares a los coanoflagelados formado una colonia de microvellosidades,Elisabeth Hehenberger et al. Novel Predators Reshape Holozoan Phylogeny and Reveal the Presence of a Two-Component Signaling System in the Ancestor of Animals. Science Direct. los hongos se originaron de protozoos parasitarios que perdieron la fagotrofia remplazándola por la osmotrofia y que tuvieron una tendencia a formar colonias filamentosas, las primeras plantas fueron las algas verdes, algas rojas y glaucofitas que evolucionaron de una endosimbiosis entre un protozoo y una cianobacteria a través de ellas adquirieron los cloroplastos que permitieron que estos organismos pudieran ser fotosintéticos. Las plantas terrestres evolucionaron de algas verdes que lograron salir del medio marino y colonizar el medio terrestre. Las otras algas como las algas pardas y las algas unicelulares obtuvieron sus cloroplastos por endosimbiosis secundarias entre protozoos y algas rojas o verdes.Olivier De Clerck et al. 2012 Diversity and Evolution of Algae Primary Endosymbiosis. Advances in Botanical Research, Volume 64, Elsevier Ltd. ISSN 0065-2296, http://dx.doi.org/10.1016/B978-0-12-391499-6.00002-5Taylor, F.J.R. 1974, Implications and extensions of the Serial Endosymbiosis Theory of the origin of eukaryotes Taxon 23 (2/3): 229-258. thumb|220px|Árbol de la vida, nótese que se excluye a los Acytota. thumb|250px|La arquea Nanoarchaeum parasitando a la arquea Ignicoccus. El origen de los virus y los agentes subvirales es un tema incierto ya que no fosilizan y los restos de ADN o ARN de virus fósiles han sido encontrados especialmente en los genomas de seres vivos que fueron infectados por estos virus, https://www.nationalgeographic.com/science/phenomena/2010/11/18/i-am-virus-animal-genomes-contain-more-fossil-viruses-than-ever-expected/ basado en la secuencia de proteínas y determinados genes de virus, viroides y virusoides se estima que estos agentes infecciosos son más antiguos que los seres vivos y que surgieron antes que el último LUCA, las propuestas sobre su origen son controvertidas. Existen varias teorías que proponen relacionar a los seres acelulares con los celulares. La hipótesis del mundo de ARN por ejemplo postula que las moléculas de ARN fueron las entidades biológicas precursoras de la vida. Una teoría propuesta es que los viroides, virusoides y virus satélite de ARN son reliquias vivas del mundo de ARN debido a que ambos se replican a través de ribozimas en lugar de enzimas, su replicación se basa únicamente en el ARN (sin pasar por un extremo o secuencia de ADN, una característica ausente en las células), poseen propiedades químicas propuestas para el mundo de ARN y el clado primigenio, tienen genes y métodos replicativos ausentes en los organismos celulares.Viroids and Virusoids Relics of RNA World Scielo.Viroids: “living fossils” of primordial RNAs? NCBI. Los virus de ARN también pueden considerarse reliquias puesto que su replicación se basa únicamente en el ARN y podrían estar relacionados con la primera codificación de proteínas. Algunos virus de ADN bicatenario (principalmente bacteriófagos) tienen uracilo en su ADN denominado ADN-U, el uracilo es considerado un nucleótido típico del ARN. Este tipo de ADN está ausente en las células, por lo que dichos virus podrían representar una reliquia de la transición del ARN al ADN. Estudios moleculares han sugerido que los acelulares son un taxón parafilético de los organismos celulares y que la familia Mimiviridae es la más cercana a estos. El totalidad de proteínas virales no tienen homólogos con las células o las secuencias son divergentes, el módulo de replicación vírico es diferente del celular como consecuencia de ello se ha sugerido que los virus se originaron en protobiontes que se separaron para dar origen a las células procariotas durante el mundo de ARN. Mart Krupovic, Valerian V. Dolja, Eugene V. Koonin (2020). The LUCA and its complex virome. Nature. thumb|240px|Bacteriófago Qβ, un fago de ARN. Los análisis filogenéticos han descubierto que los acelulares pueden dividirse en siete dominios basado en la presencia de ciertos caracteres proteicos o similitudes en la secuencia de aminoácidos; Riboviria, Adnaviria, Duplodnaviria, Varidnaviria, Monodnaviria, Singelaviria, Telodnaviria, Ribozyviria y Viroidia. El dominio Riboviria incluye a los virus de ARN y los virus retrotranscritos, el dominio Ribozyviria contiene a los virusoides, el dominio Viroidia contiene los viroides, mientras que los demás dominios solo son de virus de ADN. Los virus de estos dominios con excepción de Monodnaviria, se originaron antes que el último antepasado común universal (LUCA) en protobiontes durante el mundo de ARN. El descubrimiento de los microcompartimientos bacterianos y los nanocompartimientos de encapsulina, que son orgánulos procariotas proteicos que forman estructuras similares a las cápsides virales icosaédricas, pero sin genoma, da la credibilidad de que los virus surgieron de un evento en el que ciertos replicones quedaron atrapados dentro las cápsides, originando los genomas y que las cápsides habrían surgido primero a través de proteínas de microcompartimiento primordiales. Según este punto de vista los primeros virus fueron icosaédricos y las otras formas geométricas habrían derivado posteriormente. Algunos virus también pudieron surgir de nuevo al haberse integrado por error replicativo el ácido nucleico y las enzimas de elementos genéticos móviles (plásmidos, transposones e intrones) en las cápsides de otros virus como Monodnaviria, Pararnavirae, Ampullaviridae o Guttaviridae. thumb|281px|Viroides o virusoides son moléculas de ARN no codificante y sin transcripción de ADN. Similares a los primeros replicadores de ARN sin codificación y transcripción. thumb|281px|Virus de la familia Endornaviridae. Los virus de esta familia consisten en una RdRP unida a una cadena de ARN, similar a los primeros replicadores de ARN y proteínas. thumb|280px|Recreación de replicadores durante la codificación. thumb|280px|Transiciones del mundo de ARN, indicando el orígenes de los diferentes tipos de virus y algunos elementos genómicos. thumb|280px|Representación hipotética de un protobionte.