Annihilaatio voi tarkoittaa:

Luonnontieteissä

annihilaatio, reaktio, jossa hiukkanen ja sen antihiukkanen törmäävät annihilaatio-operaattori, kvanttimekaanisesta tilasta hiukkasen vähentävä operaattori

Muualla

annihilationismi, kristillinen oppijärjestelmä