Pokémon-tuotesarjan julkaisuissa esiintyy usein ryhmä vihollisia tai jokin kuvitteellinen rikollisryhmä, jota päähenkilö ja hänen liittolaisensa vastustavat. Usein jokaisella sukupolvella ja alueella on oma vihollisryhmänsä, joka yrittää saavuttaa tavoitteensa Pokémon-taisteluilla ja muutoin Pokémoneja avuksi käyttäen. Rikollisryhmä pääsääntöisesti häviää joko pelaajalle videopeleissä tai animesarjassa Ash Ketchumille ja hänen ystävilleen.

Alla on luetteloituna pääsarjassa ja muissa Pokémoniin liittyvissä medioissa tähän asti esitellyt vihollisryhmät.

Rakettiryhmä

Aquaryhmä Aquaryhmä (engl. Team Aqua, japaniksi アクア団 Aqua-dan) on vihollisryhmä Pokémon Sapphiressa, Emeraldissa sekä Alpha Sapphiressa. Aquaryhmän tukikohta sijaitsee Hoennissa ja heidän johtajansa on nimeltään Archie.

Ryhmän tavoitteena on nostaa merenpintaa. He haluavat saada aikaan valtavan sateen, joka nostaisi meren pintaa. Saavuttaakseen tavoitteensa he yrittävät napata mahtavan Kyogre-Pokémonin (lienee sattumaa, että Kyogren evissä on A kirjain). He ovat hyvin organisoituja ja kunnioittavia vastustajia. He käyttävät sinisiä asuja, joihin on kirjailtu tunnus "A". Joukkoja johtaa kapteeni tai komentaja Shelly.

Aquaryhmä on Magmaryhmän verivihollinen, ja ryhmien välillä vallitsee ikuinen sotatila.

Animessa Aquaryhmän jäsenet käyttävät Walreineja, Carvanhoja sekä Crawdaunteja.

Videopeleissä Aquaryhmän jäsenet käyttävät vesityypin, myrkkytyypin ja pimeystyypin Pokémoneja.

Magmaryhmä Magmaryhmä (engl. Team Magma, japaniksi マグマ団 Magma-dan) on vihollisyhmä Pokémon Rubyssa, Emeraldissa sekä Omega Rubyssa. Magmaryhmän tukikohta sijaitsee Hoennissa ja heidän johtajansa on nimeltään Maxie.

Ryhmän tavoitteena on kohottaa maailman mantereita. He haluavat saada kaikki toimivat tulivuoret purkautumaan ja jopa herättää nukkuvia tulivuoria peittääkseen koko maailman laavakuoreen. Saavuttaakseen tavoitteensa he yrittävät napata mahtavan Groudon-Pokémonin. He ovat hyvin organisoituja ja kunnioittavia vastustajia. He käyttävät punaisia asuja, joihin on kirjailtu tunnus "M". Joukkoja johtaa komentaja Tabitha.

Magmaryhmä on Aquaryhmän verivihollinen, ja ryhmien välillä vallitsee ikuinen sotatila.

Animessa Magmaryhmän jäsenet käyttävät Houndoomeja, Mightyenoja ja Golbateja.

Galactic-tiimi Galactic-tiimi, tunnettu myös yhdessä jaksossa nimellä Galactic-ryhmä (, japaniksi: ギンガ団 Ginga-dan), on Pokémon-televisiosarjassa, -videopeleissä ja -mangassa esiintyvä kuvitteellinen rikollinen organisaatio. Se esiintyy ensimmäistä kertaa Pokemonin neljännen sukupolven peleissä Pokémon Diamond ja Pearl. Myöhemmin järjestö ilmestyy myös Pokémon Platinumissa, animesarjassa ja mangasarjoissa.

Järjestöä johtaa Cyrus (Japaniksi: アカギ Akagi), jonka unelmana on luoda itselleen uusi maailma; menetelmä eroaa hiukan eri peleissä, sekä animessa tai mangassa. Cyrusin mielestä maailma on epätäydellinen, sillä ihmisen, tai minkä tahansa muun elollisen, "henki" on epätäydellinen. Hän haluaa omia unelmiaan vastaavan maailman, jossa voi itse olla jumala. Cyrus on melko nuori, mutta silti hyvin älykäs. Pokémon Platinumissa hänen isoisänsä löytyy masentuneena talosta Route 228:lla. Hän kertoo, että hänen lapsenlapsena ei ikinä pystynyt täyttämään vanhempiensa odotuksia, ja viihtyi paremmin koneiden kuin ihmisten seurassa. Hän katuu myös, ettei ottanut Cyrusia nuorena omaan huostaansa. Kun pelaaja pilaa Cyrusin juonen, hän raivostuu ja katoaa jonnekin lopullisesti.

Komentajia ovat Mars (Japanikis: マーズ Mars), Jupiter (Japaniksi: ジュピター Jupiter) ja Saturn (Japaniksi: サターン Saturn). He ovat saaneet nimensä aurinkokunnan planeettojen mukaan. Pokémon Platinumissa esiintyy Galactic-tiimin professori, Charon (Japaniksi: プルート Pluto), joka on ilmeisesti tehnyt Rotomiin liittyvää tutkimusta. Heti Platinumin alkupuolella päähenkilö törmää Kansainvälisen poliisin etsivä Lookeriin (Japaniksi: ハンサム Handsome), joka jahtaa Galactic-tiimiä ja avustaa päähenkilöä tämän tästä miltei koko pelin ajan. Marsia vastaan taistellaan peleissä kaikkein useimmin. Hän käyttää joka kerta Puruglya, joka esiintyy myös animessa, samaten kuin Jupiterin Skuntank. He eivät ilmeisesti tule toimeen, mutta molemmat ihailevat Cyrusia, ja päättävät erota Galactic-tiimistä, kun heihin törmää Pokémon Platinumin loppupuolella Stark Mountainilla.

Saturn esiintyy peleissä vähemmän kuin muut komentajat tai Cyrus, mutta animessa toistaiseksi eniten. Hänen Toxicroakinsa esiintyy sekä peleissä että animessa. Saturn on ilmeisesti kaikkein korkea-arvoisin jäsen heti Cyrusin jälkeen, sillä Cyrusin kadottua tavalliset Galactic-tiimin jäsenet seuraavat Saturnia. Pokémon Platinumissa hän ei esiinny Stark Mountainilla, mutta hän on Galactic Veilstone Buildingissa. Hän puhuu Cyrusista, ja vaikuttaa olevan lievästi järkyttynyt kuultuaan tämän oikeista tavoitteista. Saturn mainitsee myös oppineensa, ettei tuhoaminen ole ratkaisu, ja ehkä Galactic-tiimin jäljellä olevien jäsenten pitäisi alkaa toimia rehellisesti. Charon esiintyy pikaisissa rooleissa Pokémon Platinumissa ja animessa. Hän on Platinumin loppupuolella Stark Mountainilla. Hän kertoo olevansa "uusi johtaja", mutta yrittäessään varastaa Magma-kiven ja herättää Heatranin, Looker saa hänet kiinni ja toimittaa vankilaan.

Kuten muillakin Pokémon-sarjassa esiintyneillä ryhmillä, on Galactic-tiimilläkin oma "tyylinsä" ja omat univormunsa, jotka muistuttavat lievästi avaruuspukuja. Heidän tunnuksensa on keltainen G.

Anime Animessa Galactic-tiimi esiintyi ensi kertaa, kun Saturn pyysi Rakettiryhmää varastamaan Adamant-kuulan Eterna Cityn museosta, mutta he epäonnistuivat. Myöhemmin Saturn kätyreineen käytti Arceusille kuuluneita Roiske-, Rauta- ja Dracolaattoja löytääkseen Keihäsavaimeksi kutsutun kuution Solaceon raunioista. Ash ystävineen itse kohtasi Saturnin ensi kertaa, kun Galactic-tiimi yritti aktivoida Keihäsavaimen todellisen ulkomuodon Veilstone Citystä löytyneillä meteoriiteillä.

Mars ja Jupiter tekivät ensiesiintymisensä, kun Cyrus lähetti heidät varastamaan uudelleen Adamant-kuulan sekä tällä kertaa myös Lustrous-kuulan. Cyrus, joka esiintyi tavallisena liikemiehenä, kuuli Ashiltä ja Dawnilta kohtaamisesta legendaarisiin järvensuojelijoihin kuuluneiden Mespritin ja Azelfin kanssa Verity-järvellä ja Valor-järvellä. He eivät aavistaneet, että Cyrus halusi käyttää tietoa rakentaakseen heidän suurinta asettaan, Punaketjua. Mars johti myöhemmin myös joukkoja aktivoimaan Iron-saarella sijaitsevat rauniot selvittääkseen mistä päin Coronet-vuorta he löytäisivät Keihäspylvääksi kutsutun rakennelman.

Galactic-tiimin toiminta oli myös herättänyt Kansainvälisen poliisin huomion, joka lähetti etsivä Lookerin tutkimaan järjestöä ja pysäyttämään heidät. Tiedemies Charon teki ensiesiintymisensä yrittäessään Saturnin kanssa etsiä pääsyreittiä Keihäspylväälle. Heidän löytämänsä paikka ei kuitenkaan ollut oikea paikka, joten he perääntyivät. Kun Galactic-tiimi sai Punaketjun valmiiksi, Cyrus palkkasi pokémon-metsästäjä J:n ja tämän apurit vangitsemaan Azelfin, Mespritin ja Uxien. Järvensuojelijoiden sekä Adamant- ja Lustrous-kuulien avulla Galactic-tiimi onnistui pääsemään Keihäspylvään luokse ja tuomaan Dialgan ja Palkian esiin, jotta Cyrus voisi Punaketjulla orjuuttaa nämä. Dialga ja Palkia loivat portaalin, joka loisi uuden maailman ja tuhoaisi vanhan. Cyrus meni yksin sen läpi, koska ei halunnut ketään muuta ihmistä uuteen maailmaansa, edes omia palvelijoitaan. Ash ystävineen vapautti järvensuojelijat sekä Dialgan ja Palkian, jotka sulkivat portaalin. Tämän jälkeen Looker pidätti Saturnin, Marsin ja Jupiterin, mutta Charon (joka oli aavistanut Cyrusin todelliset aikeet alusta alkaen) onnistui pakenemaan.

Neliosaisessa erikoistarinassa Pokémon: Arceus-kronikat, Saturn, Mars ja Jupiter karkasivat vankilasta ja saivat käsiinsä Arceusin Liekkilaatan. He yrittivät yhdessä laatan sekä Saturnin pyydystämän Heatranin avulla avata portaalin, jonka kautta tuoda Cyrus takaisin. Sinnoh-festivaalin vuoksi Canalave Cityyn saapuneet Ash, Goh, Dawn ja Brock huomasivat ulottuvuusrepeämien aiheuttamat sääilmiöt ja kohtasivat myöhemmin Galactic-tiimin estääkseen näiden aikeet. Cynthian avustuksella he saivat Galactic-tiimin jäsenet napattua, ja rauhoittivat myös järvensuojelijoiden sekä Arceusin avulla Saturnin hallinnasta riistäytyneen Heatranin.

Plasmaryhmä Plasmaryhmä (engl. Team Plasma, Japaniksi: プラズマ団 Plasma-dan) on rikollinen järjestö, joka esiintyy ensimmäistä kertaa Pokemonin viidennen sukupolven peleissä Pokémon Black ja White.

Järjestöä johtaa poika nimeltä N (Japaniksi: エヌ N), jonka tavoitteena on vapauttaa kaikki pokémonit kouluttajistaan. He herättivät kauan sitten uneen vaipuneet ja toisiaan vastaan sotineet legendaarisen Tao-kolmikon kaksi pokémonia, Reshiramin ja Zekromin saadakseen edes toisen niistä hallintaansa. Todellisuudessa N:n kasvatti-isä, Ghetsis Harmonia (Japaniksi: ゲーチス・ハルモニア G-Cis Harmonia), yksi Plasmaryhmälle työskentelevästä seitsemästä tietäjästä, onkin käyttänyt kasvattipoikansa rikollisjärjestöä omiin tarkoituksiinsa. Hän halusi pokémonien vapautuvan vain voidakseen itse orjuuttaa ne ja tulla siten koko maailman valtiaaksi.

Videopeleissä Pokémon Black 2 ja White 2 Plasmaryhmä jatkaa toimintaansa Ghetsiksen johtamana ja pyrkii toteuttamaan tavoitteensa kolmannen Tao-kolmikon pokémonin, Kyuremin, avulla jäädyttääkseen koko Unovan.

Plasmaryhmä on myös luonut muinaisen hyönteispokémonin DNAn ja kyberneettisten laitteiden avulla Genesectin aikeinaan tehdä siitä maailman voimakkain Pokémon. N ei hyväksynyt tieteellisesti luotuja Pokémoneja, mutta yksi hänen tiedemiehistään, Dudley, jatkoi yhä työtään Genesectin luomisessa raivoissaan N:n mielipiteestä.

Anime Plasmaryhmän piti tehdä ensiesiintymisensä Black and Whiten jaksoissa 23 ja 24, mutta vuoden 2011 Japanin maanjäristyksen vuoksi näitä jaksoja ei näytetty ja Plasmaryhmän ensiesiintyminen siirrettiin vasta 16. kaudelle, jossa nämä muistuttivat enemmän Black 2 ja White 2 -pelien versioita. Perutuissa jaksoissa Plasmaryhmä olisi taistellut Rakettiryhmän kanssa meteoniitiksi kutsutun kiven hallinnasta. Ja jaksojen lopussa Ash ja Pikachu olisivat estäneet kiven voimia aiheutumasta Castelia Cityn tuhoksi tuhoamalla kiven.

N esiintyi ensi kerran jaksossa Nimeni on N! ja seuraavan kerran jaksossa Pelastakaa Braviary, jossa hän liittyi Ashin ja muiden mukaan matkalle kohti Valkoisia Raunioita etsimään tietoa Reshiramista. N:n kohtaamisen jälkeen tiedemies Colress sekä muutamat Plasmaryhmän kätyrit ovat hyökänneet useasti heidän kimppuunsa.

Jaksossa Salaisuuksia sumusta! N tunnusti Ashille olevansa Plasmaryhmän johtajan, Ghetsiksen, adoptiopoika ja Plasmaryhmän entinen jäsen. Plasmaryhmän hyökätessä hän pakeni kasvattisiskojensa, Anthean ja Concordian, kanssa. Mutta hän palasi jaksossa Ash ja N: Ihanteiden törmäys! Valkoisten Raunioiden luona ja varasti Reshiramin kutsumiseen tarvittavan Valon Kiven estääkseen tämän heräämisen. Seuraavassa jaksossa Plasmaryhmä ja herättämisseremonia! hän kuitenkin luovuttaa Kiven Plasmaryhmälle, jotta tämä vapauttaisi Ashin Pikachun Colressin hallinnasta. Ghetsis itse saapuu raunioille ja käyttää Colressin konetta Reshiramin hallintaan. Jaksossa Mitä on totuuden ja ihanteiden tuolla puolen? Ash, Pikachu ja N vapauttivat Reshiramin ja tämän avulla tuhosivat Colressin koneen. Sen jälkeen Sinnohissa aiemmin nähty etsivä Looker pidätti kaikki Plasmaryhmän jäsenet.

Peliversion tavoin elokuvassa Genesect ja legenda herää esiintyvät viisi Genesectiä ovat Plasmaryhmän luomuksia, jotka olivat karanneet ja yrittivät etsiä itselleen kotia.

Ryhmä Flare Ryhmä Flare (, , kirjallisesti Flare-jengi) on rikollinen järjestö, joka esiintyy peleissä Pokémon X ja Y.

Ryhmä Flare tavoittelee itselleen suuria määriä rahaa rakentaakseen "kauniimman ja paremman" maailman. Järjestöä johtaa mies nimeltä Lysandre (Japaniksi: フラダリ Fleur-de-lis), joka on myös Lysandre Labs -nimisen yhtiön omistaja. Hän polveutuu Kalosin entisen kuninkaan nuoremmasta veljestä.