Varpaisjärven seurakunta oli vuosina 1909–2010 Varpaisjärvellä ja vuosina 2011–2024 Lapinlahdella Pohjois-Savossa toiminut Suomen evankelis-luterilaisen kirkon seurakunta. Seurakunta kuului Kuopion hiippakuntaan ja Iisalmen rovastikuntaan, ja vuosina 2011–2024 seurakunta oli osa Ylä-Savon seurakuntayhtymää. Seurakunnan viimeinen kirkkoherra oli Helena Nykänen.
Varpaisjärven alue kuuluu Pohjois-Savon leimallisesti herännäishenkiseen herätysliikealueeseen. Liikkellä on kuitenkin vain vähän erityistä kannatusta Varpaisjärvellä.
Varpaisjärven seurakunta lakkautettiin vuoden 2025 alussa ja liitettiin Lapinlahden seurakuntaan, jonka nimi muutettiin Lapinlahden–Varpaisjärven seurakunnaksi.
Lähteet
Luokka:Kuopion hiippakunnan entiset seurakunnat Seurakunta