vignette|Stortorget, la place centrale de Lund, dans les années 1860.
Lund est l'une des plus anciennes villes de Suède bien qu'elle soit initialement une ville danoise. La date de fondation officielle de la ville est 990, cependant, des fouilles effectuées non loin de là, à Uppåkra, laissent penser que Lund date en fait du et a été déplacé en 990 sur le site actuel.
La ville qui s'était développée sur le site d'Uppåkra était déjà probablement la ville la plus importante du Danemark à partir du , et lorsque l'actuelle Lund fut construite, la ville reprit naturellement cette importance. Ainsi, dès les premières années après sa fondation, une Monnaie fut installée dans la ville, et plusieurs marchés s'y tenaient, qui comptaient parmi les plus importants de la Scanie, elle-même plus importante région du Danemark. La ville s'imposa donc rapidement comme une ville commerciale de premier ordre, malgré l'absence d'ouverture sur la mer. Mais rapidement, Lund devint aussi un centre religieux important. Si les premières églises datent de la fondation de la ville, ce rôle s'accentua avec la création du diocèse de Lund en 1060 et ensuite la construction de la première cathédrale de Lund. Le roi du Danemark aspirait avant tout à s'affranchir de l'influence de l'archidiocèse de Hambourg-Brême, auquel était rattachée toute la Scandinavie. Ses requêtes finirent par être entendues par le pape, qui autorise en 1103 la formation d'un archidiocèse scandinave dont le siège serait Lund. La cité devient ainsi le centre religieux de toute la Scandinavie, et une nouvelle cathédrale s'élève à l'emplacement de l'ancienne.
Commença alors un véritable âge d'or qui dura presque durant tout le Moyen Âge. Les archevêques de Lund vont ainsi jouer un rôle central dans la politique danoise, étant parfois surnommés le "second du roi", et leurs propriétés vont s'étendre grâce aux dons et privilèges que leur cédera la couronne en remerciement de leur soutien. Le nombre de bâtiments religieux augmenta alors jusqu'à atteindre 27. L'économie de la ville continua sa croissance grâce aux échanges avec la puissante ligue hanséatique, et le pouvoir politique de la ville va s'étendre grâce au déplacement du Landsting (assemblée régionale) de Scanie à Lund.
Cependant, dans une ère où le commerce maritime est crucial, Lund perdit peu à peu son importance économique au profit de sa voisine Malmö, mais conserva son importance religieuse. Mais cette dernière subit fortement le contrecoup de la réforme protestante, qui s'installa peu à peu au Danemark au . Presque toutes les églises et cloîtres furent fermés, et leurs propriétés réquisitionnées par le roi. Les problèmes de Lund furent encore aggravés par les nombreux conflits, principalement avec la Suède, qui affligèrent la Scanie au . Outre les importantes levées de taxes, la ville fut à plusieurs reprises partiellement détruites par les offensives, en particulier en 1678. En 1658, le Danemark dut céder la Scanie et Lund à la Suède victorieuse (Traité de Roskilde).
Afin de "suédifier" les anciennes provinces danoises, la Suède décida de fonder l'université de Lund en 1666. Si l'université eut des débuts difficiles, elle parvint dans la seconde moitié du à devenir prestigieuse. La ville reprit alors son développement, accompagné par une importante croissance démographique. Lund retrouva sa grandeur d'antan, et accueillit la première voie de chemin de fer nationale, puis la première autoroute de Suède. Cependant, la prédominance des activités liées à l'université perdura, l'industrialisation n'affectant la ville que marginalement. Cette industrialisation se renforça cependant au , avec le développement de nombreuses industries de haute technologie, en lien étroit avec l'université, qui sont, depuis, la base de l'économie de la ville.
Uppåkra vignette|Reconstitution du temple d'Uppåkra.
En 1934, lors de la construction d'une ferme dans le village d'Uppåkra, à environ au sud de Lund, des objets datés d'environ 400 après Jesus-Christ furent découverts . Des fouilles plus approfondies ont été réalisées à partir des années 1990, et ont montré que l'actuel Uppåkra fut le site d'une occupation continue entre , et le . Ce village était probablement une place centrale de la Scanie et même de tout le Danemark à partir du .
De nombreux éléments montrent que ce village d'Uppåkra était probablement le prédécesseur de Lund. Premièrement, la ville de Lund fut fondée précisément à la fin de la période d'occupation d'Uppåkra. Mais aussi, le rôle central que possédait Uppåkra à cette époque a été repris par la ville de Lund; en particulier, le marché Tre högar marknad (le marché des trois tumulus), qui avait lieu tous les ans à Lund mais que l'on sait d'origine plus ancienne, avait probablement commencé à Uppåkra, dont deux tumulus (Storehög et Lillehög) sont connus. Il est même possible que le nom Lund soit celui de l'ancien village d'Uppåkra. En effet, alors que le nom Uppåkra n'apparaît que tardivement (1085 dans une lettre de donation à Lund), le nom Lund apparaît dans la saga d'Egill, fils de Grímr le Chauve, censée se dérouler avant la fondation de l'actuel Lund. De plus, le nom Lund se réfère à un bois sacré païen, ce qui convient mieux à l'ancienne ville païenne d'Uppåkra qu'à la ville catholique de Lund.
Quoi qu'il en soit, la présence d'Uppåkra fut un élément important pour la fondation de Lund à son emplacement actuel, car le réseau routier et la population de l'ancienne ville favorisait l'établissement de la nouvelle.
Moyen Âge Fondation et développement du commerce thumb|200px|Lund autour de l'an 1000, on distingue la monnaie (Myntverket) au nord-ouest La ville fut fondée à son emplacement actuel aux alentours de 990, probablement sur une initiative du roi Sven à la Barbe fourchue . Le commerce devint rapidement une activité prépondérante dans la ville. En particulier, durant tout le Moyen Âge, la ville accueillait au printemps le marché Tre högar marknad, qui attirait probablement des gens de toute la Scanie à Lund. Cette position commerçante fut encore renforcée lorsque le roi Cnut le Grand, fils et successeur de Sven, installa dans la ville une monnaie, probablement pendant l'hiver 1019-1020, même si des pièces y ont probablement déjà été frappées vers 995, sous le règne de son père . Le fait d'avoir une fabrique de monnaie était très prestigieux à l'époque, mais en plus, la fabrique de Lund était la plus importante de tout le Danemark: ainsi, alors que le pays comptait 9 fabriques, un tiers de toute la monnaie frappée au Danemark l'était à Lund. La fabrique reposait en grande partie sur le savoir-faire anglais, l'Angleterre étant à cette époque dirigée par Cnut.
Le roi installa aussi dans la ville peu après sa fondation une résidence (Kungsgården). En effet, à cette époque, le Danemark n'avait pas de véritable capitale; à la place, le roi était itinérant, et avait des résidences dans les villes les plus importantes, permettant d'accueillir lui et sa cour. Tout ceci tend à montrer que Lund était probablement la ville la plus importante du royaume à cette époque.
Le siège de l'archidiocèse de la Scandinavie Lund a été dès sa fondation une ville chrétienne. Une église en bois a été datée du début des années 990, au niveau de la rue Kattesund, à l'emplacement du musée Drottens Kyrkoruin, justifiant l'époque présumée de la fondation de la ville . Le Danemark faisait à cette époque, comme toute la scandinavie partie de l'archidiocèse de Hambourg-Brême, qui avait été chargé d'évangéliser la région. Cependant, le Danemark voyait d'un mauvais œil ceci, car il y voyait une menace contre son indépendance. Le roi Sven II de Danemark tenta en 1054 d'obtenir la création d'un archidiocèse du Danemark auprès du pape Léon IX. Bien que le pape n'était pas hostile à cette idée, l'archevêque Adalbert de Brême s'y opposa fermement, et l'archidiocèse ne fut pas créé. En 1060, Sven II divisa les trois diocèses qui composait alors le Danemark (Fionie, Seeland et Scanie) en dix, de façon à mieux justifier la formation de l'archidiocèse. Lund devient alors un évêché, tout comme sa voisine Dalby. En 1085, au plus tard, fut consacrée l'autel d'une première cathédrale à Lund, à l'emplacement de l'actuelle. En cette même année fut fondée Katedralskolan , qui devint ainsi l'école la plus ancienne des pays nordiques. Le fait pour Lund de devenir un évêché signifia une croissance en importance de la ville comparée aux autres villes importantes de la région, comme Helsingborg ou Ystad.
Un nouvel essai de création d'un archidiocèse eut lieu avec le nouveau pape Alexandre II, mais sans réponse. Enfin, en 1103, Éric de Danemark profite d'un pèlerinage à Rome pour demander au pape Pascal II non plus la fondation d'un archidiocèse du Danemark, mais d'un l'archidiocèse scandinave. Cette fois-ci, le pape accepta et l'année suivante, l'évêque de Lund Ascer est fait archévêque. Cependant, cette décision ne convenait toujours pas à l'archevêché de Hambourg-Brême. De plus, le concordat de Worms en 1122 marqua la réconciliation entre la papauté et le Saint-Empire romain germanique après la querelle des Investitures. À la même période, des conflits de succession secouent la royauté danoise. Knud Lavard venait en effet d'être assassiné par Magnus de Suède, et le futur Éric II de Danemark décida alors de mener une révolte contre Magnus et son père qui le soutenait, le roi Niels de Danemark. Ce dernier, pour s'assurer du support du Saint-Empire romain germanique, accepta de réintégrer la Scandinavie à l'archidiocèse de Hambourg-Brême le . Ascer prit alors en 1134 position en faveur d'Éric, et ils combattirent ensemble le contre une armée menée par Niels et Magnus, lors de la bataille de Fotevik, près de Skanör. Cette bataille se conclut par une victoire d'Éric, et la mort de Magnus. Ascer mourut de vieillesse en 1137, et son successeur Eskil de Lund fit rétablir en 1138 l'archevêché de Lund.
Âge d'or de Lund L'archevêque de Lund et le pouvoir royal thumb|250px|La cathédrale de Lund avant sa rénovation par Helgo Zettervall À partir de l'établissement de Lund comme archevêché, la vie religieuse devint au centre de l'histoire de la ville. Mais les archevêques de Lund prirent rapidement une importance proche de celle du souverain lui-même. Pour remercier Ascer de son aide pour gagner le trône, Éric II concéda à l'archevêché plusieurs privilèges, qui permirent sa croissance économique. En particulier, sous Ascer, le patrimoine de l'église augmenta considérablement. Une bibliothèque commença aussi à se constituer, dans la sacristie de la cathédrale dans un premier temps (les livres étaient à l'époque un bien très précieux). En 1145, l'actuelle cathédrale de Lund fut consacrée par Eskil, cette cathédrale n'avait aucun équivalent dans les pays nordiques.