Le nom Boonen ou peut avoir deux origines : forme flatteuse moyen néerlandaise Bonin du nom germain Bono (de Boniface) : nom paternel ; nom de profession : du nl. boon : fève, haricot : planteur de fèves.
Variantes : , Bonen, Boons, Boen, Boens, , Boenne.
Arnold Boonen (1669-1729), portraitiste néerlandais, frère de Jasper ; Jacques Boonen (1577-1655), peintre hollandais ; Jacobus Boonen (1573-1655), archevêque de Malines de 1621 à sa mort ; Jacky Boonen (1968-), footballeur belge ; Jasper Boonen (1677-1729), peintre et graveur néerlandais, frère d'Arnold ; Sven Boonen (1978-), judoka belge ; Thomas Boonen (2003-), acteur québécois ; Tom Boonen (1980-), cycliste belge.