Le département du Doubs compte, en , 299 sites recensés zones naturelles d'intérêt écologique, faunistique et floristique (ZNIEFF) de type I et II . Liste des sites
ZNIEFF de type I
430002189 La Provenchère et au Mont ; 430002241 Tourbières et lacs de Bellefontaine-Les Mortes ; 430002265 La Grande Seigne et les Vespries ; 430002266 Vallon de Valbois et corniche de Chassagne-Saint-Denis ; 430002267 Le Crêt des Roches ; 430002268 Roches de Chatard ; 430002269 Cirque de Nans et bois de Neuchâtel ; 430002270 Côte de Champvermol ; 430002271 Cirque de Consolation ; 430002272 Corniches et Bois de la Côte ; 430002273 Mont de Thoraise ; 430002274 Colline de Chaudanne ; 430002275 Reculée de Norvaux ; 430002276 Forêts du Noirmont et du Risol ; 430002278 Prés-bois de Boujailles ; 430002279 Source du Lison, Grotte Sarrazine et zones humides de Nans ; 430002281 Forêt du Buclet ; 430002283 Lac, Tourbière et zones humides de Malpas ; 430002284 Bief Belin, ruisseau du Saut et zones humides associées ; 430002285 Zones humides entre Chaffois, Houtaud, Granges-Narboz et Sainte-Colombe ; 430002287 Zones humides et prairies sèches entre Les Granges-Narboz et Sainte-Colombe ; 430002290 Zones humides de Vau les Aigues à La Loitière ; 430002293 Tourbière de Vaux-et-Chantegrue et Bief Belin : 430002294 Tourbières du Trouillot et des Chazaux ; 430002296 Tourbières de Mouthe : 430002297 Tourbière près Les Essarts ; 430002298 Tourbière des Hôpitaux-Vieux ; 430002301 Ruisseau de La Morte et Tourbière du Frambourg ; 430002302 Plaine du Doubs entre Saint-Point et Pontarlier ; 430002303 Tourbière du Bois des Placettes ; 430002304 Tourbière de la Combe du Voirnon ; 430002305 Ruisseau et Marais de la Bonnavette ; 430002306 Tourbière et Lac de Remoray ; 430002307 Lac de Saint-Point et zones humides environnantes ; 430002308 Zones humides sous la Côte des Essarts ; 430002311 Tourbière de Villeneuve d'Amont ; 430002312 La Gouille et le Grand Marais ; 430002313 Tourbière de Bioules ; 430002314 La Petite et le Grande Seigne, les Grandes Planches et La Seigne Juan ; 430002315 Aux Laichères, Près maudits et Derrière le Désert ; 430002317 Les Embauchés, Cerneux du Levant et du Couchant, Près Caillet ; 430002319 Marais de Bois-Saint-Pierre ; 430002320 Les Marais de Domprel ; 430002321 Marais de Saône ; 430002322 Les Seignes et les Creugnots ; 430002323 Les Seignes du Bélieu à Narbief ; 430002324 Tourbières de Chapelle-des-Bois ; 430002325 Haute-Vallée du Doubs de Mouthe aux Longevilles ; 430002326 Marais des Biez ; 430002328 Tourbière des Cerneux-Gourinots et zones humides environnantes ; 430002330 Tourbières et zones humides du Russey (Le verbois, Les Seignes des Guinots et le Creux du Moulin) ; 430002331 Les Seignes du Mémont ; 430002359 Marais de Saulnot ; 430002753 Le Mont d'Or et le Morond ; 430004250 Crêt du Trembiaz ; 430007719 Tourbière et marais de Boujailles ; 430007720 Les Saignes Landry ; 430007753 Marais des Grands Prés,l'Étang et Terreau Alexandre ; 430007778 Falaises de Scey-en-Varais et rocher de Colonne ; 430007780 Roche Sarrazine et tourbière de Montpetot ; 430007781 Forêt de Chailluz et falaise de la Dame Blanche ; 430007788 La Côte de Liesle, la Fassure et la Côte d'Or ; 430007789 Colline de Rosemont ; 430007790 Colline de Planoise ; 430007794 Château Simon ; 430007795 Falaises et Bois de Babre et de la Côte Envers ; 430007796 Mont Julien ; 430007797 Corniches et Vallon de Montglioz ; 430007798 Combe de l'Œil de BŒuf ; 430007799 Falaises du Plain du Mont et des Essarts ; 430007804 Gorges de l'Audeux et du Sesserant : 430007806 Rocher du Tourbillon et Grotte de Plaisir-Fontaine ; 430007808 Pelouse de Pré Nicard ; 430007809 Vallée de La Barbèche ; 430007814 Mont Olivot ; 430007815 Croix Beneton ; 430007816 Grotte et falaise du Château de La Roche ; 430007817 La Roche Fendue, la Côte du Ban ; 430007818 Ruisseau et Vallon de Cornebouche ; 430007819 Vallons des Ruisseaux de Vergetolle et de Raffenot ; 430007822 Les Roches du Cerf et le Bois de Charopey ; 430007823 Plaine alluviale du Doubs à Morteau ; 430007824 Défilé d'Entre-Roches et du Coin de la Roche ; 430007825 Fort Mahler et Côteau sur le RD 67 ; 430007827 L'Entonnoir, zones humides du Drugeon et Côte de La Feuillée ; 430007828 Marais et zones humides du Cébriot, de Chaux-Neuve à Mouthe ; 430007829 Falaises de la Citadelle ; 430007830 Falaises de La Grange Golgru ; 430007831 Falaises du Saut de la Pucelle ; 430007833 Falaises et Ruisseau de Château-Renaud ; 430007834 Rochers du Capucin ; 430007836 Falaises de la Combe du Frêne ; 430007837 Falaises du Verboz et ferme du Ruhier ; 430007838 Falaises d'Hauteroche ; 430007840 Roche du Miroir et Falaises de Cerneux-Boillon ; 430007841 Roches de la Côte de Parfonbief ; 430007842 Falaises des Échelles de la Mort ; 430007844 Côtes du Doubs du Saut à Biaufond ; 430007845 Falaises de Derrière-le-Mont ; 430007846 Falaises du Fauteuil de Gargantua ; 430007848 Roche Gauthier ; 430007849 Falaises du Bois de Narpent ; 430007850 La Raie de Buis ; 430007852 Corniches de La Citadelle et Côtes du Doubs ; 430007853 Bois de La Roche, Falaises et Pelouses de Montfaucon ; 430007855 Falaise du Saut de Gamache ; 430007856 Rochers de La Louvière du Biais et du Rechandet ; 430007857 Falaises du Mont ; 430007858 Falaises de l'Essart de Saussaye ; 430007860 Falaises des Bois de la Combe du Falot ; 430007861 Cul de Vau et Vauclusotte ; 430007862 Á Rochien ; 430007863 Falaises de la Côte du Frêne ; 430007864 Falaises de Montursin ; 430007865 Falaises et Coteaux des Sapois ; 430007869 Mine-Grotte du Coteau Couillery ; 430007870 Grotte aux Ours ; 430007873 Vallée de La Tounolle et Méandres de L'Ognon ; 430009404 Centre de rencontre de Glay ; 430009449 Bois du Forbonnet et Tourbière vivante de Frasne ; 430009451 Grotte de la Tuilerie ; 430009452 Grotte de La Malatierre ou de Vaureuge ; 430009453 Gouffre de Pourpevelle ; 430009455 Forêt de Courtefontaine ; 430009456 Forêt communale de Liesle ; 430010443 Plaine de L'Ognon de Marnay à Pagney ; 430010454 Grand Étang de Frasne ; 430010455 L'Étang Lucien et Les Vaudins ; 430010456 Ensemble de Marais entre Bouverans, Dompierre-les-Tilleuls et Frasne ; 430010457 Côtes du Doubs aux environs de Besançon ; 430010460 Carrière au Champ Barbaux ; 430010465 Gouffre du Creux à Pépé et Côte de Château-le-Bois ; 430010467 Combles du Prieuré de Saint-Hippolyte ; 430010469 Zones humides du Cougnet et Pré-Soleil ; 430010949 Pelouses sur Vallodrey et Ruisseau de Vau ; 430010950 Ruisseau de Mambouc, La Roche du Mont et Les Combes ; 430010951 Pelouses de La Roche Lahier ; 430010961 Pelouses d'Éternoz ; 430010962 Prairies et Forêts du Pré Poncet ; 430013627 La Chaux Sèche ; 430013639 Tourbière et Prairie de la Ferme du Forbonnet ; 430013645 Les Grands Prés, La Mécanique et les Rives de L'Ognon ; 430013650 Le Doubs de Montferrand à Osselle ; 430013657 Mont Chateleu ; 430013660 Marais de Palantine ; 430013662 Basse Vallée de La Savoureuse ; 430013670 Grotte de Fourbanne ; 430013673 Pelouse des Montaillers et sur le Tartres ; 430013883 L'Ognon en amont de Marnay ; 430015359 Pelouses à Remeton, Les Grands Ruin et sous-les-Vignes ; 430015370 Prairies sèches de Boujailles ; 430015371 La Roche Chaude et le Bois d'Ambre ; 430015372 Sur la Rappe ; 430015374 Mare à Grandfontaine ; 430015376 Fontaine de Vauchon et Ruisseau à Franey ; 430015384 Vallon et Ruisseau d'Eysson ; 430015562 Pelouse de Malans et Ruisseau du Bief Tard ; 430015563 Pelouse sur le Côté ; 430015566 Grotte de Vaucluse ou Grotte de L'Hermitage ; 430020001 Prés-Bois des Prés-Hauts ; 430020010 Tourbière de La Chaumoz ; 430020017 Ancien Pont ferré et Combles de l'Église de Cléron ; 430020019 Tourbière du Prelot ; 430020020 Haute-vallée du Drugeon et Pré Vaillon ; 430020021 Étang de la Rivière-Drugeon et zones humides ; 430020071 Grotte Deschamps ; 430020075 Falaise de La Voyèze ; 430020076 Clocher de l'église d'Ornans : 430020079 Combles et fossés de l'église de Fourg ; 430020080 Clocher de l'église de Randevillers ; 430020081 Combles et fossés de l'église de Goumois ; 430020082 Combles et fossés de l'église de Laval-le-Prieuré ; 430020083 Église de Glère ; 430020084 Combles et clocher de la Chapelle de Droitfontaine ; 430020126 Sur Le Fourney ; 430020162 Pelouse de La Corne ; 430020167 Vallée de L'Audeux de la source à La Grâce-Dieu ; 430020168 Vallées du Lison et de La Vau ; 430020169 Falaises et Bois de Montrichard ; 430020170 Falaises et Vallon de Cussey-sur-Lison ; 430020171 Les Seignes de Damprichard ; 430020172 Pelouses, Friches et Rochers de Mouthier-Haute-Pierre ; 430020174 Rive droite du Doubs de Laissey à Deluz ; 430020202 Communal du Desssus et Chalt Gillard ; 430020204 Combles de la Mairie de Clerval ; 430020205 Église de Baume-les-Dames ; 430020206 Combles de l'École Marcel Levin ; 430020215 Le Bief bleu et le Bief Rouge ; 430020258 Marais sous la Rochotte et Pré Regrenedey ; 430020259 Marais de Breuillez ; 430020260 Pelouses du Mont de Cessey ; 430020261 Pelouses et bocages de Chenecey-Buillon ; 430020262 Marnière d'Épeugney ; 430020263 Pelouses de la Côte de Moini ; 430020264 Coteaux de La Loue à Vuillafans ; 430020265 Éboulis et Ravin de Saules ; 430020266 Zones humides du Moulin du Bas ; 430020268 Pré humide de La Léchère ; 430020286 Étang et Marais du Barchet ; 430020287 Prés humides et Marais du Peu et du Breuille ; 430020299 Le Crêt Monniot ; 430020301 Marais de l'Épine ; 430020310 Gouffre et Grotte de Vau ; 430020311 Puits de Cival ; 430020313 Baume des Crêtes; 430020314 Baume du Mont ; 430020315 Gouffre de La Planche-Bonnet ; 430020316 Baume aux Sarrons et Baume du Chat ; 430020319 Usine hydro-électrique de Mouthier ; 430020322 Combles de l'Église de Crouzet-Migette ; 430020368 Forêt de Cussey ; 430020407 Ruisseau de Busy ; 430020409 Ruisseau de La Corcelle ; 430020410 Ruisseau des Longeaux ; 430020411 Ruisseau du Moulin-Caillet ;
ZNIEFF de type II
430002172 Forêt de Chaux ; 430002189 Montagne du Laveron ; 430002195 Massif du Risoux ; 430002280 Vallée de la Loue, de la source à Ornans ; 430002282 Bassin du Drugeon ; 430007777 Vallée de la Loue de Ornans à Quingey ; 430007779 Vallée du Lison et Combe d'Éternoz ; 430007792 Moyenne Vallée du Doubs ; 430007802 Vallée du Cusancin et Torrent des Alloz ; 430007811 Vallée de La Reverotte ; 430007813 Vallée du Dessoubre et ses falaises attenantes ; 430007821 Le Doubs franco-suisse ; 430010440 Vallée de L'Ognon de Villersexel à Rigney ; 430010441 Vallée de L'Ognon de Moncley à Pesmes ; 430014008 Vallée de La Loue de Quingey à Parcey ;
Références
* ZNIEFF Doubs