Liste de phytovirus (virus s'attaquant aux organismes végétaux) classé par familles et par genres.

La taxinomie des virus phytopathogènes (virus de plantes) est fondée, comme pour toutes les familles et genres de virus, sur des critères de différenciation taxinomiques essentiels qui sont la présence ou l'absence d'une enveloppe virale, la symétrie de la capside (structure qui entoure le génome) et la nature du génome. L'acide nucléique qui constitue le génome présent dans le virion, peut être constitué d'ARN (RNA, la très grande majorité) ou d'ADN (DNA), dont la forme peut être linéaire ou circulaire, segmentée ou non segmentée ; la structure de l'acide nucléique peut être monocaténaire (à simple brin, ss) ou bicaténaire (à double brin, ds). Selon la polarité de l'acide nucléique à simple brin, on distingue des génomes à polarité négative ss(-), positive ss(+) et ambisens ss(-/+) . Chez certains virus de plantes, lors de la propagation par une transcriptase inverse (RT), l'ARN est transcrit en ADN.

La plupart des familles énumérées ci-dessous ne comprennent que des virus affectant les plantes, seules quatre familles (et huit genres) : Reoviridae (Fijivirus, Oryzavirus, Phytoreovirus), Rhabdoviridae (Cytorhabdovirus, Nucleorhabdovirus, Tenuivirus), Tymoviridae (Marafivirus), Tospoviridae (Orthotospovirus), comprennent aussi des espèces de virus des animaux.. Plusieurs genres de virus des végétaux ne sont pas encore, selon les dispositions de l'ICTV, rattachés à une famille (non classés).

Liste des genres classés par familles Selon ICTV.. GroupeFamilleSous-familleGenreGénomeEnveloppe viraleSymétrie / FormeRoyaume : RiboviriaIV Alphaflexiviridae Allexivirus, Lolavirus, Mandarivirus, Platypuvirus, Potexvirus, ss(+)RNA absente en hélice, filamenteuxIII Amalgaviridae Amalgavirus dsRNA absente V Aspiviridae Ophiovirus ss(-)RNA, segmenté (3-4) absente en hélice, filamenteuxIV Benyviridae Benyvirus ss(+)RNA, segmenté (4-5) absente en hélice, en bâtonnet IV BetaflexiviridaeQuinvirinae Carlavirus, Foveavirus, Robigovirus ss(+)RNA absente en hélice, filamenteux Trivirinae Capillovirus, Chordovirus, Citrivirus, Divavirus, Prunevirus, Ravavirus, Tepovirus, Trichovirus, Vitivirus, WamavirusIV BotourmiaviridaeOurmiavirus ss(+)RNA, segmenté (3) absente icosaédrique, bacilliformeIV Bromoviridae Alfamovirus, Anulavirus, Bromovirus, Cucumovirus, Ilarvirus, Oleavirus ss(+)RNA, segmenté (3) absente icosaédrique, sphérique à bacilliformeVII Caulimoviridae Badnavirus, Caulimovirus, Cavemovirus, Dioscovirus, Petuvirus, Rosadnavirus, Solendovirus Soymovirus, Tungrovirus, Vaccinivirus. dsDNA (RT), circulaire absente icosaédrique, bacilliformeIII Chrysoviridae Alphachrysovirus ds(+)RNA, linéaire, segmenté (3-4) absente icosaédriqueIV Closteroviridae Ampelovirus, Closterovirus, Crinivirus, Velarivirus ss(+)RNA, linéaire absente en hélice, filamenteuxIV Endornaviridae Alphaendornavirus dsRNA(+), linéaire – Virus présents uniquement dans les cellules, il n’existe aucun virion extracellulaire. –V Fimoviridae Emaravirus ss(-)RNA, segmenté (2) absente en hélice, en bâtonnetIV Kitaviridae Blunervirus, Cilevirus, Higrevirus ssRNA(+), linéaire – –IV Mayoviridae Idaeovirus, Pteridovirus ssRNA(+), linéaire – –VI Metaviridae Metavirus ssRNA-RT – –III Partitiviridae Alphapartitivirus, Betapartitivirus, Deltapartitivirus dsRNA, segmenté (2) absente icosaédrique, sphériqueV Phenuiviridae Coguvirus, Rubodvirus, Tenuivirus ss(+/-)RNA et (-)RNA Un segment est toujours ss(-)RNA, les autres segments 3.5 ont une polarité ambisens., segmenté (4-6) absente filamenteux Complexe de nucléoprotéines.IV Potyviridae Arepavirus, Bevemovirus, Brambyvirus, Bymovirus, Celavirus, Ipomovirus, Macluravirus, Poacevirus, Potyvirus, Roymovirus, Rymovirus, Tritimovirus ss(+)RNA, linéaire absente en hélice, filamenteuxVI Pseudoviridae Pseudovirus, Sirevirus ssRNA (RT) – Les particules icosaédriques ne sont présentes au niveau intracellulaire, pas de virions extracellulaires. icosaédrique, sphérique III Reoviridae La famille comprend aussi des genres de virus des vertébrés, des insectes et des champignons.Sedoreovirinae Phytoreovirus dsRNA, segmenté (10-12) absente icosaédrique, sphérique Spinareovirinae Fijivirus, Oryzavirus V Rhabdoviridae Comprend également des genres de virus des vertébrés et des insectes. Alphanucleorhabdovirus, Betanucleorhabdovirus, Cytorhabdovirus, Dichorhavirus, Gammanucleorhabdovirus, Varicosavirus ss(-)RNA, linéaire présente en hélice, bacilliforme IV Secoviridae Cheravirus, Sadwavirus, Sequivirus, Torradovirus, Waikavirus ss(+)RNA, linéaire absente icosaédrique, sphérique Comovirinae Comovirus, Fabavirus, Nepovirus IV Solemoviridae Polemovirus, Sobemovirus, Polerovirus, Enamovirus ss(+)RNA, linéaire absente icosaédrique, sphérique IV Tombusviridae Calvusvirinae Umbravirus ss(+)RNA, linéaire absente icosaédrique, sphérique Procedovirinae Alphacarmovirus, Alphanecrovirus, Aureusvirus, Avenavirus, Betacarmovirus, Betanecrovirus, Gallantivirus, Gammacarmovirus, Macanavirus, Machlomovirus, Panicovirus, Pelarspovirus, Tombusvirus, Zeavirus, Luteovirus Regressovirinae DianthovirusV Tospoviridae Orthotospovirus ss(-/+)RNA et (-)RNA, segmenté (3)Les segments M et S sont ambisens, le segment L est à polarité négative. présente icosaédrique, sphériqueIV Tymoviridae Tymovirus, Marafivirus, Maculavirus ss(+)RNA, linéaire absente icosaédrique, sphériqueIV Virgaviridae Furovirus, Goravirus, Hordeivirus, Pomovirus, Pecluvirus, Tobamovirus, Tobravirus ss(+)RNA, segmenté (3) absente en hélice, en bâtonnetIV Incertae sedis Albetovirus ss(+)RNA, linéaire absente en hélice, en bâtonnetIV Incertae sedis Aumaivirus ss(+)RNA, linéaire absente en hélice, en bâtonnetIV Incertae sedis Papanivirus ss(+)RNA, linéaire absente en hélice, en bâtonnetIV Incertae sedis Virtovirus ss(+)RNA, linéaire absente en hélice, en bâtonnetRoyaume : MonodnaviriaII Geminiviridae Becurtovirus, Begomovirus, Capulavirus, Curtovirus, Eragrovirus, Grablovirus, Mastrevirus, Topocuvirus, Turncurtovirus ss(+/-)DNA, circulaire, segmenté (1-2) absente icosaédrique, sphériqueParticules toujours jumelées (géminées), capsides icosaédriques formant un virion.II Genomoviridae Gemycircularvirus ss(+)DNA absente icosaédrique, sphériqueII Nanoviridae Nanovirus, Babuvirus ss(+)DNA, circulaire, segmenté (6-9) absente icosaédrique, sphériqueViroïdesViroïdes Avsunviroidae Avsunviroid, Elaviroid, Pelamoviroid ssRNA absente Viroïdes Pospiviroidae Apscaviroid, Cocadviroid, Coleviroid, Hostuviroid, Pospiviroid ssRNA absente

Notes et références

Sources . . .

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