Le sous-type H7N9 du virus de la grippe A circule normalement entre oiseaux en infectant occasionnellement les humains. Comme tous les virus de la grippe A, il s'agit d'un virus à ARN monocaténaire de polarité négative à génome segmenté (8 segments) qui appartient au genre Alphainfluenzavirus de la famille des Orthomyxoviridae.

D'abord détecté chez deux personnes à Shanghai et une dans la province de l'Anhui au mois de OMS Avian influenza Fact sheet Updated March 2014, il a causé quarante-cinq décès confirmés en six mois (selon l'OMS au ). Entre le et fin , étaient confirmés et signalés à l'OMS (dont ) signalés par la Chine, deux par le CDC de Taipei CDC), 5 par Hong Kong et un cas détecté en Malaisie chez un voyageur chinois. Temporellement, une première vague () a eu lieu de février à ; suivie de 2 cas en juillet et août; et une seconde vague a démarré en (240 à ce jour).

Les enfants, adolescents et jeunes adultes sont les moins touchés mais l'âge moyen a diminué à la seconde vague (53 ans contre ) et les hommes sont légèrement plus touchés (67 %OMS (2014) Background and summary of human infection with avian influenza A(H7N9) virus – as of 31 January 2014f ). Lors de ces deux vagues environ 22 % des patients sont morts. Hormis chez les enfants le tableau clinique est presque toujours graveWHO (OMS) RISK ASSESSMENT - Human infections with avian influenza A(H7N9) virus - 28 February 2014 - Summary of surveillance and investigation findings Human cases of avian influenza A(H7N9) virus infection to date.

Officiellement, l'état d'épidémie n'est pas proclamé, mais l'épidémiosurveillance considère le H7N9 avec attention puis l'assimile, à fin , à la phase 3 de la typologie établie par l'OMS.

Pathogénicité La virulence de ce sous-type est faible chez l'oiseau, mais élevée (et croissante) chez l'Homme, il tue en quinze jours, et au début dans un peu plus d'un cas sur cinq, puis il semble être devenu plus pathogène encore.

Le (lire chronologie), l'OMS observe que le taux de morbidité du H7N9 dépasse celui du H5N1sciencemag, 24 April 2013. ; on sait cependant peu de choses sur ce tout nouveau virus d'origine aviaire et ses éventuelles capacités de propagation et recombinaison via les migrations d'oiseaux, de manière identique ou non aux vagues de recombinaisons observées pour la grippe de 1968.

L'innocuité apparente de ce sous-type pour les oiseaux (pas de symptôme observable jusqu'à présent) complexifie l'établissement d'une cartographie de la circulation et d'un éventuel déploiement du virus dans les années à venir, là où les cadavres d'oiseaux victimes du H5N1 en étaient un marqueur.

Selon les autorités chinoise (début ), la plupart des patients ont en outre des séquelles comme : Une gêne respiratoire très présente, d'occasionnels encombrements des bronches et quelques insuffisances rénales. Le virus semble avoir été ralenti et endigué après selon l'OMS sans pour autant disparaître (le la première transmission interhumaine a été confirmée par des chercheurs chinois qui estiment que le virus H7N9 est alors en train de muter).

Selon le bilan publié le : sur humains confirmés en laboratoire, 359 malades sont morts.

Au , ce bilan est dont 616 mortels selon l’Organisation des Nations unies pour l’alimentation et l’agriculture..

Apparition et évolution

Cas aviaires dans le Minnesota en 1988

Le virus H7N9 a été identifié pour la première fois en 1988 sur des dindes de l'État du Minnesota, comme indiqué par le Hartwell Center for Bioinformatics & Biotechnology ; il s'est alors propagé à la volaille domestique commerciale et à des oiseaux migrateurs sauvages.

Il n'a par la suite infecté des humains qu'en Chine..

Le virologue Ron FouchierPublication of flu study reveals full nature of threat, New Scientist, juin 2012. a indiqué à CNN que ce virus n'est pas semblable à la plupart des virus de la grippe aviaire car il sous-types de grippe A.

Cas humains à Shanghai en 2013

redresse=1.7|vignette|Graphe représentant l'évolution du nombre de cas officiel depuis l'annonce par les autorités chinoises de l'existence du virus.

redresse=1.7|vignette|Réassortiment du virus de la grippe.

redresse=1.7|vignette|Marché de volailles traditionnel à Xining, dans la province du Qinghai (photo prise en 2008).

Le , la Commission au planning familial et à la santé nationale publie un communiqué faisant état des 3 premiers cas avérés à Shanghai. Ils orientent les autorités de Santé autour d'un marché de volailles traditionnelles situé dans le quartier de centre-ville de Mǐnháng. La typologie de l'OMS atteignant la phase 2, rendre l'information publique est de rigueurPlan de crise pour une pandémie#Plan OMS d'alerte : phase 2 atteinte..

Le , le décès d'un vieil homme de (première victime), qui a eu lieu le , est corrélé avec celui d'un boucher de mort le (deuxième victime).

Le , un troisième patient, un cuisinier de , succombe. Le taux de mortalité est donc de 3., pour 9 cas identifiés.. Les autorités conseillent de nettoyer attentivement, puis de cuire à les œufs et les poulets avant consommation, pour éviter toute transmission de l'animal à l'homme. Les provinces concernées par l'épidémie sont celles de Shanghai, de Anhui et de Zhèjiāng 浙江..

Le , le nombre de cas identifiés atteint 14, dont 5 victimes décédées. Le dixième patient reconnu a et vit à Huzhou 湖州市. Les deux nouveaux décès sont alors un homme de China reports H7N9 bird flu death, ACN, 4 avril. et une femme de , tous deux de Shanghai.. L'OMS et ses partenaires locaux travaillent sur la caractérisation du virus dans le but d'identifier des souches candidates pour la conception d'un vaccin. Les autorités agricoles ont établi que des fientes de pigeon récupérées à proximité de marchés de denrées alimentaires contenaient le H7N9..

Le Viêt Nam a annoncé par mesures de précaution l'interdiction d'importer toute volaille chinoise.. Parmi les , une personne en contact avec l'une des victimes a développé les symptômes de grippe ; cette dépêche de l'agence Chine nouvelle a lancé la confusion dans les esprits concernant la possibilité critique d'avoir affaire à une variante se transmettant d'homme à homme.

Le , un fermier de vivant à Huzhou décède, portant à 6 le nombre de morts et 16 le nombre de cas identifiés. Cinq cent vingt (520) personnes ayant été en contact des malades sont placées sous surveillance par les autorités.. L'OMS annonce que des tests préliminaires suggèrent que le nouveau variant serait sensible à l'oseltamivir (Tamiflu), mais plus tard des cas de résistance seront signalés. Les autorités chinoises ont abattu plus de au marché de Huhuai à Shanghai, après quoi toute la zone a été passée au désinfectant ; des mesures similaires ont été appliquées sur deux autres marchés aux volailles du district de Minhang.. Les autorités publiques ont par ailleurs décidé de fermer tous les marchés vendant des volailles à Shanghai. Les aéroports des pays asiatiques limitrophes mettent en place des moyens de mesure de la température corporelle des passagers provenant de Shanghai, des agents du CDC local étant habilités à prononcer des mises en quarantaine ..

Le , le nombre de personnes infectées est de 18, tandis que la mortalité se maintient à 6, selon le Ministère de la Santé chinois .. Nankin (chef-lieu du Jiangsu) et Hangzhou (chef-lieu du Zhejiang) ont procédé à la fermeture de leurs marchés et à l'abattage massif de leurs volailles, suivant l'exemple de Shanghai.. Malgré l'avis du Ministère de la Santé ne rattachant pas les faits suivants au H7N9, les annonces du décès de l'un des fils de l'octogénaire d'une pneumonie, et qu'un autre a réchappé à une maladie respiratoire, ont relancé de vives spéculations concernant la possibilité d'une transmission humaine du virusLe Monde, édition du samedi 6 mars 2013, page 9. ; la conurbation de Shanghai concentre à elle seule d'habitants.

Le , Michael O'Leary., représentant de l'OMS en Chine, réaffirme dans un communiqué que bien que l'origine de l'infection ne soit pas encore établie, aucune preuve n'avère une transmission interhumaine de la variante H7N9..

Le , les autorités de l'État comptabilisent infectées par le H7N9, dont 7 n'ont pas survécu.. Soixante mille () pigeons voyageurs de la province de Zhejiang ont été vaccinés contre les variantes connues de la grippe aviaire. ; le vaccin employé ne traite pas la variante H7N9 puisqu'aucun n'a encore été conçu pour lors..

Le , l'État chinois rapporte 28 malades du H7N9, dans les provinces concernées de Chine de l'Est., car un huitième malade est mort. Découvrir le mode de transmission du HN9 devient un sujet d'études en microbiologie pour l'Académie chinoise des sciences. : ce sujet relève de l'écoépidémiologie rétrospective.

Le , le décompte des patients atteint 33. La BBC indique une mortalité atteignant 9, les deux derniers décès s'étant produits dans les provinces de Anhui et Jiangsu. La surveillance du réseau Internet par l'État est étroite, puisque ont eu lieu dans cinq provinces pour motif de propagation d'informations erronées dans des blogs : les individus annonçaient l'apparition du H7N9 localement, leurs étant immédiatement relayés, propageant la rumeur ; c'est le cas pour 3 arrestations à Guiyang, ville du Sud-Ouest de la Chine, ces personnes ayant parlé de H7N9 dans un marché aux poulets.; alors que les provinces concernées pour lors sont dans l'Est. Les annonces officielles permettent d'espérer la disponibilité d'un vaccin pour le H7N9 seulement dans sept mois..

Le , alors que, jusqu'à cette date, l’infection humaine par le virus H7N9 restait officiellement circonscrite à trois provinces situées dans de l'est du pays — Zhejiang, Jiangsu et Anhui — ainsi qu'à Shanghai , un premier cas de transmission est évoqué à Pékin. Les autorités sanitaires sont déconcertées car les oiseaux ne présentent aucun symptôme du H7N9, alors qu'ils mouraient en grand nombre du H5N1, signalant sa propagation ; la perspective que les volatiles en deviennent des porteurs sains est très préoccupante newsinfo.inquirer.net.; les autorités font également part du cas d’une fillette âgée de sept ans, porteuse du virus et hospitalisée. Le décompte global des infections humaines déclarées, depuis l'annonce du premier cas H7N9 il y a quelque deux semaines, s'élève désormais à . Parmi les cas, quatorze se sont soldés par une issue fatale .

Le , l'organisation mondiale de la santé (OMS) s'attend à constater des contaminations dans de nouvelles régions, comme ce fut le cas ces derniers jours, mais ne voit pas pour le moment de signe de contamination entre humains. , a déclaré le dimanche Michael O'Leary, représentant de l'OMS en Chine. Le virus H7N9 est aussi détecté sur des pigeons, dans de nouvelles provinces de Chine (a-t-on appris le par l'OIE). Jusqu'ici les variantes H7 de la grippe aviaire n'avaient concerné que les oiseaux..

Le , ont été identifiés, dont 16 mortels., répartis sur deux métropoles (Shanghai et Pékin) et 4 provinces (Henan, Zhejiang, Jiangsu, Anhui). Compte tenu du décalage horaire, Le Monde reprend ces chiffres dans son édition du , et indique que les autorités s'attendent à une augmentation du nombre de cas dans les jours qui viennent; des médecins, experts internationaux sont en route vers Shanghai pour accélérer par leur contribution l'identification des modes de transmission du virus .

Le , les autorités chinoises portent une attention accrue aux cas de contaminations multiples rencontrées sur des membres de la même famille. Les deux frères et le père de famille [lire 6 avril], finalement tous trois décédés, tout particulièrement. Dans le , Zeng Guang, épidémiologiste en chef du CDPCC a annoncé que 40 % des cas humains ayant contracté la maladie n'avaient pas eu d'exposition significative à la volailleChina says investigating human-to-human spread of bird flu, Agence Reuters, 18/04..