Marguerite d'Autriche (en ), également appelée Marguerite de Babenberg (en ), née vers 1204 et morte le à Krumau, fut reine de Germanie de 1224 à 1235 par son mariage avec , puis reine de Bohême de 1253 à 1261 par son mariage avec .
Origine et famille Issue de la maison de Babenberg, Marguerite est la fille aînée du duc , et de son épouse Theodora Angelina, apparentée à l'empereur byzantin . Ses grands parents paternels sont le duc et la princesse Hélène de Hongrie. En 1194, son père avait d'abord hérité le duché de Styrie. Quatre ans plus tard, après le décès de son frère aîné , il devient duc d'Autriche.
Parmi les jeunes frères et sœurs de Marguerite figurent : Agnès († 1226), épouse du duc , un membre de la maison d'Ascanie ; Henri († 1228), époux d'Agnès, fille du landgrave ; Gertrude († 1241), épouse du landgrave Henri le Raspon ; († 1246), succéda à son père en tant que duc d'Autriche ; Constance († 1243), épouse du margrave (maison de Wettin). mourut en 1230 et son seul fils survivant, , hérite des duchés d'Autriche et de Styrie.
Unions et postérité vignette|gauche|Marguerite, reine de Bohême et duchesse d'Autriche, Liber fundatorum de l'abbaye de Zwettl (). Le à Nuremberg, Marguerite d'Autriche épouse , fils aîné de l'empereur , qui est son cadet de sept ans. Henri a été élu roi des Romains en 1220, ce en quoi son père avait promulgué la Confoederatio cum principibus ecclesiasticis en faveur des princes ecclésiastiques. Marguerite elle-même est couronnée, le , reine de Germanie à Aix-la-Chapelle. Le couple a deux enfants, Henri et Frédéric qui meurent très jeunes.
Peu après, toutefois, s'est disputé avec son père et il se sépare de Marguerite de facto en 1231. Emprisonné et déposé par en 1235, il meurt misérablement lors d'un transport en Calabre en . Sa veuve Marguerite se retire dans un couvent de dominicaines à Trèves, puis à Wurtzbourg.
À la mort de son frère le duc sans enfant en 1246, la lignée mâle des Babenberg est éteinte. Marguerite est considérée comme l'héritière des duchés d'Autriche et de Styrie, elle devait toutefois faire face à la concurrence de sa nièce Gertrude de Babenberg, fille de son frère Henri. Marguerite et Gertrude toutes les deux peuvent hériter selon les principes du Privilegium Minus. Très vite, Gertrude est mariée au margrave Vladislav de Moravie, fils aîné du roi , qui cependant meurt en janvier de l'année suivante. Gertrude se marie en secondes noces avec le margrave qui ne réussit pas à s'imposer en tant que souverain autrichien. Le duc est chargé de la gestion de l'Autriche.
Pendant le Grand Interrègne, après le décès de l'empereur en 1250, les troupes d', fils cadet du roi , envahissent les pays autrichiens. Le prince bohémien obtient la reconnaissance de la nobilité locale et, pour légitimer ses prétentions, il se marié avec Marguerite d'Autriche le au château de Hainburg (Heimenburg). De ce fait, Gertrude de Babenberg se voit dépossédée de tous ses droits contre une indemnisation annuelle modeste. Lors de son second mariage, Marguerite était de 28 ans plus âgé que son époux. Leur communauté conjugale, confirmé par dispense pontificale du , reste stérile et son mari la répudie en 1260.
succède à son père en tant que roi de Bohême en 1253. Il engagea la guerre contre le roi et a participé aux croisades de l'ordre Teutonique contre les Prussiens. Une fois en possession de l'Autriche et de la Styrie, il divorçait de Marguerite pour se marier à la princesse Cunégonde de Slavonie en 1261. vignette|Épitaphe, abbaye de Lilienfeld. Marguerite d'Autriche passa les dernières années de sa vie au château de Krumau sur le Kamp au nord de Krems. À sa mort, survenue en 1266 ou 1267, elle est inhumée à l'abbaye de Lilienfeld. Les plans ambitieux de son ex-mari d'obtenir la couronne impériale échouent lors de la lutte contre Rodolphe de Habsbourg. Finalement, Ottokar est tué à la bataille de Marchfeld en 1278.
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