La plupart des musées égyptiens peuvent être considérés comme musées égyptologiques, car possédant une importante collection d'antiquités égyptiennes.
Le docteur Zaoui, archéologue et président du Comité national de lutte contre la contrebande, déplorait. que pendant trop longtemps, les musées égyptiens ont été laissés à l’abandon. Dans les caves du musée du Caire, des pièces ont été volées et ce sont souvent les services du Conseil des antiquités qui sont mis en cause.
Ces dernières années, d'importants efforts ont été faits dans la réévaluation du paysage patrimonial afin de doter d'un musée une majorité de villes en plus des principales agglomérations du pays, faisant passer l’Égypte d’une ère d’exploration et d’exploitation à une ère nouvelle de conservation, de préservation et d’éducation. Le Conseil suprême des Antiquités égyptiennes, sous la direction de Zahi Hawass, s'est donc dirigée vers des projets de gestion et d’élaboration de sites.
Musées par ville
El-Alamein
Musée de Marînâ al-‘Alamayn
Alexandrie
Palais Al-Anfouchi Palais d'Antoniadis Musée aquatique de Qâytbây Musée des Beaux-Arts, Moharram Bey Musée de la Bibliotheca Alexandrina Musée des bijoux royaux Galerie Degas Musée Gamâl ‘Abd al-Nâsir Musée gréco-romain Musée de la mosaïque Musée national Musée international d’Alexandrie pour enfants
Al-Minya Musée d'Aton
Assouan
Musée de la Nubie Musée de l’obélisque inachevé
Le Caire et ses environs
Palais d'Abedin Musée de l'agriculture Musée Ahmad Chawqi Centre Al-Guézira des Arts, 1, rue Al-Cheikh Al-Marsafi, Zamalek Musée d'art moderne égyptien Musée de la barque solaire au pied de la pyramide de Khéops Musée des carrosses royaux Musée des céramiques islamiques Musée national de la civilisation égyptienne Musée copte Musée égyptien Musée Gayer-Anderson Grand Musée égyptien à GizehSite officiel Musée islamique Musée Mohamed Mahmoud Khalil Musée Mahmoud Mokhtar Musée Mahmoud Said Musée de plein air de Matariyya Musée militaire Musée Muhammad ‘Abd al-Wahhâb, consacré à ce compositeur dans les locaux de l’institut de musique arabe Musée de la Nation Musée national de la police, dans la citadelle de Saladin Palais Al-Manyal Village Pharaonique Musée de la poste Musée Suzanne Moubarak Musée Umm Kulthûm
Fayoum Museum d’histoire naturelle Karanis Site Museum
Hurghada Musée d’Hurghada
Ismaïlia Musée régional d'Ismaïlia
Louxor Musée de Louxor Musée de la momification
Mallawi Musée de Mallawi
Port-Saïd Musée national Musée d'art moderne Musée militaire
Saqqarah
Musée d'Imhotep à Saqqarah
Sinaï
Musée d’al-‘Arîsh Musée de Qantara Musée de Sharm al-Sheikh
Sohag
Musée de Sohag
Notes
# Egypte Musee