L'AJ Auxerre joue lors de la saison 2016-2017, sa cinquième saison consécutive en deuxième division. Guy Cotret entame sa quatrième saison à la présidence du club alors que Viorel Moldovan commence sa première saison au club. Il est remplacé au mois d'octobre par Cédric Daury. Cette saison voit le club s'engager dans trois compétitions que sont la Ligue 2, la coupe de France et la coupe de la Ligue. Elle est notamment marquée par le changement de propriétaire du club. En effet, James Zhou dirigeant de l'entreprise chinoise ORG Packaging, rachète les parts de Corinne Limido« L'AJ Auxerre officiellement sous pavillon chinois », site de L'Yonne républicaine, 13 octobre 2016. Consulté le 14 octobre 2016..

Avant-saison À la suite d'une saison décevante selon Guy Cotret« AJA : « Saison mitigée mais pas mauvaise » pour Jean-Luc Vannuchi », site de L'Yonne républicaine, 17 mai 2016. Consulté le 21 juin 2016., le président décide de se séparer de Jean-Luc Vannuchi« Guy Cotret - Conférence de presse AJA 2016 - 2017 », site de Dailymotion, 21 juin 2016. Consulté le 21 juin 2016. pour engager Viorel Moldovan« Viorel Moldovan, nouvel entraîneur de l’AJ Auxerre ! », site de l'AJ Auxerre, 26 mai 2016. Consulté le 21 juin 2016. qui devient le premier entraîneur étranger de l'histoire du club« Liste des entraîneurs de l'AJ Auxerre », article Wikipedia. Consulté le 21 juin 2016.. D'autres changements ont également lieu dans l'organigramme du club dont notamment la nomination de Christophe Point à la place de Jean-Marc Nobillo à la tête du centre de formation« Le staff 2016-2017 du Centre de Formation », site de l'AJ Auxerre, 08 juin 2016. Consulté le 21 juin 2016..

Matchs amicaux L'AJ Auxerre dispute cinq matchs amicaux pendant cette préparation estivale« 5 matchs amicaux au programme de l’AJA !», site de AJ Auxerre, 15 juin 2016. Consulté le 2 juillet 2016..

Détail des matchs

Le club dispute également un match amical lors de la trêve internationale du mois de septembre contre l'ESTAC Troyes.

Abdoulaye Sissako et Florian Ayé sont absents en raison de leurs sélections internationales« France : La sélection des U19 pour la Serbie», site foot-national.com, 22 août 2016. Consulté le 2 septembre 2016.« France U20 : La liste de Batelli pour le Japon», site foot-national.com, 25 août 2016. Consulté le 2 septembre 2016..

Le club dispute également un match amical lors de la trêve internationale du mois d'octobre contre l'US Ivry Football, club de CFA 2« Le programme à venir pour le groupe professionnel», site aja.fr, 7 octobre 2016. Consulté le 7 octobre 2016..

Abdoulaye Sissako est absent en raison de sa sélection internationale« France U19 : La liste pour la République Tchèque», site foot-national.com, 26 septembre 2016. Consulté le 8 octobre 2016..

Un nouveau match amical a lieu à la fin du mois de décembre contre le FC Chambly Oise, 4e de National.

Rachat du club par James Zhou Le , l'actionnaire majoritaire du club, Corinne Limido, annonce qu'une proposition d'achat provenant d'un dirigeant chinois, James Zhou, a été transmise. Ce repreneur chinois, dirigeant d'ORG Packaging, devrait verser 2 millions d'euros par an pendant 3 ans dans les caisses du club. Cette proposition a, pour le moment, été acceptée par le Conseil d'Administration de l'AJ Auxerre mais doit être également validée par l'Association AJA qui détient 40 % des parts du club« Communiqué officiel : Proposition de rachat de l’AJ Auxerre », site officiel de l'AJ Auxerre, 19 juillet 2016. Consulté le 19 juillet 2016.« AJA : Corinne Limido prête à vendre au Chinois ORG Packaging », site de L'Yonne républicaine, 19 juillet 2016. Consulté le 19 juillet 2016..

Après de nombreux échanges, les membres de l'Association AJA votent finalement à l'unanimité en faveur de la vente du club à James Zhou« Les membres de l'Association votent à l’unanimité pour le rachat. », twitter de France Bleu Auxerre, 9 septembre 2016. Consulté le 9 septembre 2016..

Le rachat devient officiel le après l'assemblée générale et le conseil d'administration de la SAOS AJA entérinant la vente du club.

L'imbroglio Jean-Pierre Papin Le , Guy Cotret annonce la nomination de Jean-Pierre Papin, vainqueur du Ballon d'or 1991, au poste de directeur sportif et ambassadeur du club en Chine, pays dont est originaire James Zhou, le nouveau propriétaire du club« Papin directeur sportif de l'AJA, c'est officiel », site de L'Yonne républicaine, 11 janvier 2017. Consulté le 24 janvier 2017..

Le lendemain, Jean-Pierre Papin réagit à la déclaration de Guy Cotret en indiquant qu'il vient pour occuper une triple casquette d'entraîneur, directeur sportif et ambassadeur en Chine« Papin : "J'ai signé pour être entraîneur d'Auxerre" », site de beIN Sports, 12 janvier 2017. Consulté le 24 janvier 2017..

À la suite de cette révélation, Guy Roux, ancien entraîneur emblématique du club et membre de l'association AJA, réagit en défendant vigoureusement l'entraîneur déjà en place, Cédric Daury« Guy Roux ne veut pas de Jean-Pierre Papin comme entraîneur d'Auxerre », site de L'Équipe, 13 janvier 2017. Consulté le 24 janvier 2017.. Il s'ensuit une opposition entre Guy Roux et Jean-Pierre Papin par média interposé« AJ Auxerre : Jean-Pierre Papin s’en prend à Guy Roux », site de France Bleu Auxerre, 19 janvier 2017. Consulté le 24 janvier 2017..

Après le report de plusieurs conseils d'administration« Le conseil d'administration de l'AJA est reporté », site de L'Yonne républicaine, 17 janvier 2017. Consulté le 24 janvier 2017.« La zizanie se poursuit au sujet de Papin », site de L'Yonne républicaine, 20 janvier 2017. Consulté le 24 janvier 2017. et un passage tourmenté devant la DNCG« La LFP réagit à l'affaire Jean-Pierre Papin - AJ Auxerre », site de L'Équipe, 19 janvier 2017. Consulté le 24 janvier 2017. où le budget n'est finalement pas retoqué, Guy Cotret annonce la fin des négociations avec Jean-Pierre Papin le « Communiqué officiel de l'AJ Auxerre », site officiel de l'AJ Auxerre, 24 janvier 2017. Consulté le 24 janvier 2017..

Transferts

De nombreux joueurs tels que Sébastien Puygrenier, capitaine lors de la saison 2015-2016, ou Vincent Gragnic quittent le club libre« L’AJA reprend l’entraînement ce lundi, à 10 heures », site de L'Yonne républicaine, 20 juin 2016. Consulté le 21 juin 2016.. D'autres comme Cédric Hountondji et Serhou Guirassy retournent dans leurs clubs respectifs en fin de prêt« Treize joueurs sont encore sous contrat, onze sont en fin de bail », site de L'Yonne républicaine, 18 mai 2016. Consulté le 21 juin 2016..

Afin de combler les départs, l'AJ Auxerre recrutent 4 joueurs avant la reprise de l'entraînement. Tout d'abord, le club recrute Baba Traoré en provenance du FBBP 01 afin d'évoluer en défense central ou en arrière gauche« Baba Traoré s’engage avec l’AJA ! », site de l'AJ Auxerre, 03 juin 2016. Consulté le 21 juin 2016., puis Rémi Fournier, défenseur central d'expérience, en provenance du Red Star FC« Rémi Fournier officiellement Auxerrois ! », site de l'AJ Auxerre, 20 juin 2016. Consulté le 21 juin 2016.. Pierre-Alexandre Bois, jeune gardien de but en provenance du Havre AC et Roman Laspalles, jeune arrière droit en provenance de l'EA Guingamp complètent la liste des arrivées« Branches au menu de la reprise de l'AJA », site de L'Yonne républicaine, 20 juin 2016. Consulté le 21 juin 2016..

Le , l'AJ Auxerre enregistre l'arrivée de Lionel Mathis qui revient dans un club dans lequel il a déjà évolué pendant 9 ans et dans lequel il a déjà remporté deux Coupe de France« Officiel : Lionel Mathis revient à l'AJA !!! », site de AJ Auxerre, 22 juin 2016. Consulté le 2 juillet 2016..

Du côté des départs, deux milieux de terrain quittent également le club. En effet, Grégory Berthier rejoint le Stade de Reims« Bonne continuation à Grégory Berthier qui rejoint le Stade de Reims. », site de AJ Auxerre, 22 juin 2016. Consulté le 2 juillet 2016. et Grégoire Lefebvre résilie son contrat« Résiliation de contrat de Grégoire Lefebvre », twitter de L'Yonne républicaine, 2 juillet 2016. Consulté le 2 juillet 2016..

Le , l'AJ Auxerre annonce l'arrivée de Yoann Touzghar« Officiel : Yoann Touzghar s’engage avec l’AJA ! », site de AJ Auxerre, 5 juillet 2016. Consulté le 5 juillet 2016..

Le , Mickaël Tacalfred signe un accord pour rejoindre le club afin d'y apporter son expérience en défense centrale« Accord avec Mickaël Tacalfred ! », site de l'AJ Auxerre, 11 juillet 2016. Consulté le 11 juillet 2016..

Le , Salimo Sylla quitte le club pour la Jupiler Pro League et le club de Saint-Trond.

À une semaine de la reprise du championnat, le , Stéphane Sparagna rejoint l'AJ Auxerre en prêt en provenance de l'Olympique de Marseille.

Afin de renforcer une équipe à la mi-saison afin d'obtenir le maintien, le club recrute 2 joueurs en prêt en provenance du Standard de Liège. Birama Touré et Mohamed Yattara rejoignent ainsi le club. Yaya Sané rejoint également le club par prêt avec option d'achat. Dans les dernières heures du mercato, Ibrahim Sangaré, attaquant de l'US Avranches MSM, rejoint l'AJ Auxerre.

Dans l'autre sens, Yoann Touzghar quitte le club et rejoint le FC Sochaux-Montbéliard.

Bilan des transferts

Mercato d'été

+20px|Mercato d'été Tableau des transferts du mercato d'été

Mercato d'hiver

+20px|Mercato d'hiver Tableau des transferts du mercato d'hiver

Effectif de la saison 2016-2017

Compétitions Ligue 2

Matchs allers

Matchs retours

Classement

Meilleurs buteurs Ce tableau regroupe l'ensemble des buteurs de l'AJ Auxerre en Ligue 2 à l'exception des buts inscrits contre son propre camp.

Mis à jour le après la fin de la saison. Buteur Buts 1 18 Gaëtan Courtet 10 2 9 Mohamed Yattara 4 3 7 Yoann Touzghar 3 - 10 Adama Ba 3 5 5 Lionel Mathis 2 6 8 Samed Kilic 1 - 14 François-Xavier Fumu Tamuzo 1 - 19 Alexandre Vincent 1 - 21 Rémi Fournier 1 - 28 Birama Touré 1 - 35 Yaya Sané 1

Meilleurs passeurs Ce tableau regroupe l'ensemble des passeurs décisifs de l'AJ Auxerre en Ligue 2.

Mis à jour le après la fin de la saison. Passeur Passes 1 18 Gaëtan Courtet 5 2 9 Mohamed Yattara 3 3 14 François-Xavier Fumu Tamuzo 2 - 5 Lionel Mathis 2 5 3 Ludovic Obraniak 1 - 4 Stéphane Sparagna 1 - 10 Adama Ba 1 - 11 Florian Ayé 1 - 13 Kenji-Van Boto 1 - 17 Baba Traoré 1 - 19 Alexandre Vincent 1

Coupe de France

L'AJ Auxerre entre en lice au septième tour de la Coupe de France, tout comme l'ensemble des clubs de Ligue 2.

Le septième tour se déroule le week-end du 12 et .

L'AJ Auxerre débute par deux victoires contre des clubs amateurs, l'US Saint-Serninoise, club de DH Bourgogne, et le Cluses Scionzier FC, club de DH Rhône-Alpes.

Détails des matchs

Meilleurs buteurs Ce tableau regroupe l'ensemble des buteurs de l'AJ Auxerre en Coupe de France à l'exception des buts inscrits contre son propre camp.

Mis à jour le après les . Buteur Buts 1 18 Gaëtan Courtet 6 2 22 Romain Montiel 3 3 2 Ruben Aguilar 1 - 6 Brahim Konaté 1 - 9 Mohamed Yattara 1 - 11 Florian Ayé 1 - 13 Kenji-Van Boto 1 - 28 Birama Touré 1

Coupe de la Ligue

vignette|Zacharie Boucher juste avant d'effectuer un tir au but lors de la rencontre AJ Auxerre - FBBP 01 lors du de la Coupe de la Ligue.

L'AJ Auxerre entre en lice au premier tour de la Coupe de la Ligue, tout comme l'ensemble des clubs de Ligue 2 et les 4 clubs de National professionnels.

Le premier tour se déroule le contre le FBBP 01.

L'AJ Auxerre débute par une victoire contre le FBBP 01 après les tirs au but. Après une première période où les locaux inscrivent deux buts par Alexandre Vincent et Gaëtan Courtet, les bressans reviennent en seconde pour obtenir les tirs au but. Grâce à une frappe sur le poteau puis à un arrêt de Zacharie Boucher, les joueurs de Viorel Moldovan s'impose 5-4 lors de la séance.

Détails des matchs

Meilleurs buteurs Ce tableau regroupe l'ensemble des buteurs de l'AJ Auxerre en Coupe de la Ligue à l'exception des buts inscrits contre son propre camp.

Mis à jour le après les .