La sexualité est un thème important dans les séries télévisées et les longs-métrages de l'univers de Star Trek.

Dans les premières séries Star Trek, les relations sexuelles sont pour la plupart hétérosexuelles. Quelques relations bisexuelles ont été mises en scène, mais toujours dans le cadre d'un artifice narratif (par exemple, l'utilisation de personnages issus d'un univers parallèle, au lieu des « vrais » personnages, ou encore le couple de femmes Trill Dax et Kahn (dans l'épisode L'interdit) couple hétérosexuel dans leurs vies antérieures).. Des relations inter-espèces et inter-ethniques ont été souvent représentées. Comparativement, un assez large spectre est exploré pour ce qui est de la monogamie, de la polygamie, et du mariage. Dans la mesure où la sexualité peut conduire à la reproduction, certaines intrigues ont montré la possibilité d'avoir des enfants dans une relation inter-espèces, ainsi que les préjugés que les enfants ont à subir dans leurs sociétés parentes. Ces représentations reflètent les opinions contemporaines des Américains de culture urbaine face à la sexualité, d'abord pendant les années soixante et puis durant les dernières décennies du .

Depuis la reprise de séries Star Trek en 2017, la représentation des sexualités évolue fortement, ces séries comportant des personnages importants bisexuels, gays, lesbiens et non-binaires.

Mariage

Les nombreuses espèces importantes dans Star Trek  ont principalement des unions conjugales monogames et hétérosexuelles. Les principaux personnages mariés les uns aux autres comprennent Keiko et Miles O'Brien, Worf et Jadzia Dax, Leeta et Rom, Tom Paris et B'Elanna Torres, William Riker et Deanna Troi, ainsi que Jean-Luc Picard et Beverly Crusher (dans le futur de l'univers parallèle de l'épisode Toutes les Bonnes Choses...Star Trek: Next Generation, saison 7, épisode 25). D'autres personnages, dont l'histoire note qu'ils sont ou ont déjà été mariés, comprennent Leonard McCoy (divorcé à la fois avant la série originale et avant les événements de Star Trek, il se remarie au cours de la série originale), Beverly Crusher (veuve avant le début de Star Trek : The Next Generation), Katherine Pulaski, Benjamin Sisko, Tuvok, et T'Pol. Le Docteur, un hologramme, vit avec sa propre famille holographique et se marie à une femme humaine dans l'univers parallèle de l'épisode La Fin du JeuStar Trek: Voyager, saison 7, épisode 26. James Kirk, aux prises avec des pertes de mémoire, épouse une femme autochtone d'Amérique, Miramanee. Le mariage dure plusieurs mois, jusqu'à la mort de Miramanee. Le mariage de deux membres de l'équipage commence mais est interrompu dans l'épisode Zone de terreur.

L'épisode Nouvel Échelon de La Nouvelle Génération met en scène deux groupes de colons humains, dont l'un est entièrement constitué de clones montrant des anomalies génétiques, à qui l'on a dit qu'ils devaient se résoudre au polyamour, ou au moins à une monogamie moins stricte, pour demeurer viables génétiquement. Le docteur Pulaski conseille à chaque femme d'avoir un enfant de trois hommes différents et à chaque homme, d'avoir un enfant avec trois femmes différentes afin d'assurer une diversité génétique suffisante à leur survie.

Dans l'épisode de La Nouvelle Génération, Une journée de Data (diffusé en 1991), Data mentionne que les mariages boliens nécessitent trois personnes. En 1999, l'épisode de Star Trek : Deep Space Nine, Champ de feu fait référence à ceci, alors de Dax mentionne qu'un homme bolien décédé avait un co-mari, en plus d'une épouse.

Le premier personnage principal à faire partie d'un mariage avec polyamour a été Phlox, la médecin dénobulien à bord de l'Enterprise (NX-01) de la télésérie Enterprise. Il a trois épouses qui, à leur tour, ont chacune deux autres maris en plus de lui, et ces mariages sont ouverts, c'est-à-dire que les époux sont libres de poursuivre des relations sexuelles avec d'autres. De fait, une des femmes de Phlox visite lEnterprise dans l'épisode Contamination et flirte ouvertement avec Trip Tucker.

Sexualité hors mariage

La plupart des relations dans lesquelles les officiers de la Fédération prennent part sont brèves, non maritales. Ces officiers sont des monogames sériels, et ont souvent des relations ne durant pas plus d'un épisode. William Riker en est un exemple. Dans le film Star Trek Générations, Kirk se souvient de sa petite amie de deux ans, Antonia, et regrette de ne jamais l'avoir épousée. Dans l'anomalie temporelle du Nexus, une seconde chance s'offre à lui et il décide de l'épouser. En réalité, le Nexus n'est pas réel et le mariage n'a jamais eu lieu.

Certains personnages ont eu des enfants hors mariage. David Marcus, le fils de Kirk et Alexandre Rozhenko, le fils de Worf, sont tous deux nés de parents non mariés.

Les Deltans, une race présentée dans le premier film Star Trek, est si profondément sexuelle que ses membres doivent prêter serment de célibat au moment d'entrer dans la Fédération pour éviter de nuire aux non-Deltans servant à leurs côtés.

Les chefs religieux, comme dans la réalité, ne sont pas nécessairement astreints au célibat dans l'univers de Star Trek. Sur le monde profondément religieux de Bajor, par exemple, les chefs spirituels peuvent prendre part à des relations sexuelles non conjugales sans encourir de désapprobation religieuse.

Relations interraciales

Les Descendants Cet épisode est souvent cité comme le « premier baiser interracial » montré à la télévision, entre James T. Kirk (William Shatner) et le lieutenant Uhura (Nichelle Nichols), mais ce n'est pas tout à fait exact. William Shatner rappelle en effet dans Star Trek Memories que NBC a insisté pour que leurs lèvres ne se touchent jamais (la technique consistant à tourner la tête à la caméra a été utilisée pour dissimuler ceci) ; de plus, l'épisode montre la baiser comme involontaire, forcé par télékinésie. Cependant, Nichelle Nichols insiste dans son autobiographie Beyhond Uhura (écrite en 1994, après le livre de Shatner) que le baiser était réel, même dans les plans où sa tête cache ses lèvresNichelle Nichols, Beyond Uhura: Star Trek and Other Memories, G.P. Putnam & Sons New York, 1994. .

Le terme « interracial » est utilisé dans ce contexte pour désigner les acteurs noirs et blancs. Star Trek avait également présenté un baiser interracial entre William Shatner et l'actrice franco-vietnamienne France Nuyen dans « Hélène de Troie », mais ceci n'avait attiré aucun commentaire. Par ailleurs, Nancy Sinatra et Sammy Davis, Jr se sont embrassés dans une émission spéciale de 1967 présentée sur NBC-TV intitulée Movin' With Nancy.. À la télévision britannique, un baiser interracial avait été montré encore plus tôt, à la fois en 1964, dans un épisode du roman savon de grande écoute Emergency – Ward 10, et en 1962, dans une dramatique télévisée en direct, You in Your Small Corner.

Malgré cela, lorsque les dirigeants de NBC ont eu vent du baiser planifié, ils ont redouté l'ire des diffuseurs conservateurs du Sud des États-UnisNichols, . En 1968, NBC avait exprimé les mêmes inquiétudes à propos d'un numéro musical dans une émission spéciale de Petula Clark dans laquelle elle touchait le bras de Harry Belafonte, la première occasion d'un contact physique direct à la télévision américaine entre un homme et une femme de races différentes.. Au cours des négociations qui ont suivi, on a soulevé l'idée de montrer Spock embrasser Uhura, mais William Shatner a insisté pour qu'ils respectent le scénario d'origine. NBC a finalement demandé que les deux versions de la scène soient tournées—celle où Kirk et Uhura s'embrassent et celle sans baiser. Après le succès du tournage de la première version de la scène, Shatner et Nichelle Nichols ont délibérément raté chaque prise de la seconde version, forçant ainsi la diffusion du baiserNicholls, .  Nichelle Nichols écrit :

Il n'y a eu, cependant, que quelques plaintes seulement à propos de la scèneNichols, . Nichelle Nichols observe que Les Descendants, diffusé en « a reçu un accueil énorme. Nous avons reçu l'un des plus grands paquets de courrier de fans, entièrement positif, avec beaucoup de lettres me demandant ce que j'avais ressenti lors de mon baiser avec le capitaine Kirk, et beaucoup de lettres adressées à Shatner demandant comment il se sentait, lui, de m'avoir embrassée. Il est intéressant de noter, cependant, que presque personne n'a trouvé le baiser scandaleux, à l'exception d'une seule missive un peu négative adressée par un Blanc du Sud des États-Unis. » Nichols note que « pour moi, le plus mémorable épisode de notre dernière saison était Les Descendants. »Nichols, .

Relations interraciales dans les séries subséquentes Des relations entre des humains de races différentes ont été mises en scène dans les séries télévisées plus récentes, par exemple le mariage de Keiko O'Brien, Asiatique (Japonaise), avec Miles O'Brien, Européen (Irlandais).

Accouplement inter-espèces

Les relations entre les personnages d'espèces différentes ont parfois été utilisées comme une parabole sur les relations interraciales.

Comme en témoigne l'existence de Spock, un hybride Vulcain-Humain, l'accouplement inter-espèces fait partie de Star Trek depuis son premier épisode. La série d'origine, sa série animée subséquente, Star Trek ainsi que Star Trek V : L'ultime Frontière contiennent tous des scènes où Spock doit faire face aux conséquences de sa biologie hybride. Les personnages principaux ou récurrents résultant d'une hybridation inter-espèces incluent Deanna Troi dans La Nouvelle Génération, Ziyal dans Deep Space Nine, et B'Elanna Torres et Naomi Wildman dans Voyager. Dans la série Enterprise, l'avant-dernier arc narratif traite de la première progéniture Humaine–Vulcane. Dans « Terra Prime », un enfant cloné de Charles Tucker III et de T'Pol a été utilisé par un groupe politique xénophobe comme une illustration des « dangers » de la reproduction inter-espèces.

Les Humains sont fréquemment impliqués dans les accouplements inter-espèces : Spock, Deanna Troi, K'Ehleyr, Sela, le lieutenant Daniel Kwan (personnage à demi Napéen dans L'Œil de l'Admirateur), B'Elanna Torres et Naomi Wildman sont quelques-uns des personnages de Star Trek ayant un parent humain et un autre non humain.

Dans Deep Space Nine, Worf, un Klingon, et Jadzia Dax, une Trill, ont une relation de nature sexuelle et, plus tard, se marient.

Un exemple d'accouplement sans reproduction a lieu lorsque Data, un androïde, a une aventure sexuelle avec Tasha Yar, une humaine, dans La Nouvelle Génération, dans l'épisode « L'Enterprise en folie ».

LGBT En 1992, les directives de création littéraire pour publier un livre de poche sous licence Star Trek expliquent que, lors de la relecture d'une histoire, les éditeurs « ne sont pas intéressés par les livres qui suggèrent autre chose que de l'amitié entre les membres de l'équipage de lEnterprise. ».. Dans le récent redémarrage de la série, on révèle pour la première fois un personnage LGBT : Hikaru Sulu. On le montre vivant avec une enfant et un mari aimant.

Il y a eu des tentatives infructueuses et controversées pour inclure un membre d'équipage LGBT dans l'une des séries télévisées dérivées. La diffusion d'épisodes traitant des droits LGBT a connu les mêmes problèmes. En 1987, le créateur de la série Gene Roddenberry a déclaré qu'il y aurait des personnages gays dans La Nouvelle Génération. Les fans ne s'entendent pas pour conclure si cette promesse a été tenue au cours des séries télévisées dérivées de la série originale. Cependant, des personnages et des relations LGBT figurent dans les séries dérivées ne faisant pas partie du canon de Star Trek, incluant la collection de livres de poche sous licence de la Paramount, ainsi que plusieurs productions réalisées par des fans, sans licence. Le premier film de fan mettant en scène des personnages et des thèmes LGBT est Star Trek: Hidden Frontier. vignette|George Takei à une marche des fiertés en 2006.