L'organisation de la gendarmerie départementale qui est la subdivision de la Gendarmerie nationale française chargée des missions de sécurité publique, de renseignement et de police judiciaire, est de type décentralisé. En effet, il n'existe pas au sein de la Direction générale de la Gendarmerie nationale (DGGN) de direction ou de sous-direction de la gendarmerie départementale mais différentes sous-directions fonctionnelles subordonnées à la Direction des opérations et de l'emploi et chargées de la sécurité publique, la sécurité routière, la police judiciaire ou l'anticipation opérationnelle.
Les formations de gendarmerie départementales, quant à elles, sont placées sous l'autorité des commandants de régions de Gendarmerie. À chaque région administrative correspond une région de Gendarmerie dont le commandant est directement subordonné au Directeur général de la Gendarmerie nationale (DGGN). Cet officier commande toutes les unités de gendarmerie départementale implantées dans sa région.
Au cours de son existence, l'organisation de la gendarmerie départementale a été adaptée à maintes reprises afin de correspondre d'abord à l'organisation territoriale de la France militaire puis, par la suite, à celle de la France administrative. Elle est toutefois également calquée en partie sur celle de la France judiciaire (une section de recherches par Cour d'appel).
Depuis 2016 En 2016, à la suite de la réorganisation territoriale de la France, le nombre de régions métropolitaines passe de (et la Corse) à 13. Les régions de gendarmerie départementales sont alors réorganisées afin se calquer sur les nouvelles régions administratives. Toutefois, durant cette période de transition, les anciennes régions conservent l'essentiel de leurs prérogatives sous la forme de formations administratives dont le commandement est confié au groupement chef-lieu de l'ancienne région.
De plus, afin de respecter les limites de la nouvelle région Occitanie, les territoires des zones de sécurité Sud et Sud-Ouest sont redéfinis.
Les formations administratives seront dissoutes, et les anciennes régions totalement fusionnées le pour la Normandie, et le pour les huit autres nouvelles régions. groupement de gendarmerie départementale : anciennement appelés compagnies de gendarmerie départementale, les groupements correspondant à l'échelon administratif du département depuis 1958 Encyclopédie de la Gendarmerie Nationale, Besson (Général) et Collectif, tome , Éditions SPE Barthelemy Paris 2005. ;
compagnies de gendarmerie départementale : anciennement appelées sections de gendarmerie départementale, les compagnies correspondent depuis 1958 à l'échelon administratif de l'arrondissement.
Organisation droite|436x436px|Carte de l'organisation de la Gendarmerie Nationale depuis 2016 avec libellés Pour chaque zone de défense et de sécurité, la première région de gendarmerie indiquée est celle implantée au siège de la zone. Son commandant exerce des attributions supplémentaires mais n'a pas d'autorité directe sur les autres régions de la zone. Zone de défense et de sécurité de Paris 20px Région de Gendarmerie d'Île-de-France (Maisons-Alfort) - RGIF Groupement de Gendarmerie départementale de l’Essonne Groupement de Gendarmerie départementale de Seine-et-Marne Groupement de Gendarmerie départementale du Val-d'Oise Groupement de Gendarmerie départementale des Yvelines Zone de défense et de sécurité Sud-Ouest 25x25px Région de Gendarmerie de Nouvelle-Aquitaine (MérignacLe chef-lieu de région est fixé à Bordeaux mais la caserne de l'unité RGNA est située sur la commune de Mérignac.) - RGNA Groupement de Gendarmerie départementale de la Dordogne Groupement de Gendarmerie départementale de la Gironde Groupement de Gendarmerie départementale des Landes Groupement de Gendarmerie départementale de Lot-et-Garonne Groupement de Gendarmerie départementale des Pyrénées-Atlantiques Groupement de Gendarmerie départementale de la Haute-Vienne (formation administrative jusqu'en août 2022) Groupement de Gendarmerie départementale de la Corrèze Groupement de Gendarmerie départementale de la Creuse Groupement de Gendarmerie départementale de la Vienne (formation administrative jusqu'en août 2022) Groupement de Gendarmerie départementale de la Charente Groupement de Gendarmerie départementale de la Charente-Maritime Groupement de Gendarmerie départementale des Deux-Sèvres Zone de défense et de sécurité Ouest 20px Région de Gendarmerie de Bretagne (Rennes) - RGBRET Groupement de Gendarmerie départementale des Côtes-d'Armor Groupement de Gendarmerie départementale du Finistère Groupement de Gendarmerie départementale d'Ille-et-Vilaine Groupement de Gendarmerie départementale du Morbihan 20px Région de Gendarmerie du Centre-Val de Loire (Orléans) - RGCVL Groupement de Gendarmerie départementale du Cher Groupement de Gendarmerie départementale d'Eure-et-Loir Groupement de Gendarmerie départementale de l'Indre Groupement de Gendarmerie départementale d'Indre-et-Loire Groupement de Gendarmerie départementale du Loiret Groupement de Gendarmerie départementale de Loir-et-Cher 25x25px Région de Gendarmerie de Normandie (Rouen) - RGNORM Groupement de Gendarmerie départementale du Calvados (formation administrative de 2016 à 2020) Groupement de Gendarmerie départementale de l'Eure Groupement de Gendarmerie départementale de la Manche Groupement de Gendarmerie départementale de l'Orne Groupement de Gendarmerie départementale de la Seine-Maritime 20px Région de Gendarmerie des Pays de la Loire (Nantes) - RGPL Groupement de Gendarmerie départementale de la Loire-Atlantique Groupement de Gendarmerie départementale de Maine-et-Loire Groupement de Gendarmerie départementale de la Mayenne Groupement de Gendarmerie départementale de la Sarthe Groupement de Gendarmerie départementale de la Vendée Zone de défense et de sécurité Sud-Est 25x25px Région de Gendarmerie d'Auvergne-Rhône-Alpes (Lyon) - RGARA Groupement de Gendarmerie départementale de l'Ain Groupement de Gendarmerie départementale de l'Ardèche Groupement de Gendarmerie départementale de la Drôme Groupement de Gendarmerie départementale de l'Isère Groupement de Gendarmerie départementale de la Loire Groupement de Gendarmerie départementale de la Savoie Groupement de Gendarmerie départementale de la Haute-Savoie Groupement de Gendarmerie départementale du Rhône Groupement de Gendarmerie départementale du Puy-de-Dôme (formation administrative jusqu'en août 2022) Groupement de Gendarmerie départementale de l'Allier Groupement de Gendarmerie départementale du Cantal Groupement de Gendarmerie départementale de la Haute-Loire
Zone de défense et de sécurité Sud 25x25px Région de Gendarmerie de Provence-Alpes-Côte d'Azur (Marseille) - RGPACA Groupement de Gendarmerie départementale des Alpes-Maritimes Groupement de Gendarmerie départementale des Alpes-de-Haute-Provence Groupement de Gendarmerie départementale des Hautes-Alpes Groupement de Gendarmerie départementale des Bouches-du-Rhône Groupement de Gendarmerie départementale du Var Groupement de Gendarmerie départementale de Vaucluse 25x25px Région de Gendarmerie d'Occitanie (Toulouse) - RGOCC Groupement de Gendarmerie départementale de l'Ariège Groupement de Gendarmerie départementale de l'Aveyron Groupement de Gendarmerie départementale de la Haute-Garonne Groupement de Gendarmerie départementale du Gers Groupement de Gendarmerie départementale du Lot Groupement de Gendarmerie départementale des Hautes-Pyrénées Groupement de Gendarmerie départementale du Tarn Groupement de Gendarmerie départementale de Tarn-et-Garonne Groupement de Gendarmerie départementale de l'Hérault (formation administrative jusqu'en août 2022) Groupement de Gendarmerie départementale de l'Aude Groupement de Gendarmerie départementale du Gard Groupement de Gendarmerie départementale de la Lozère Groupement de Gendarmerie départementale des Pyrénées-Orientales 20px Région de Gendarmerie de Corse (Ajaccio) - RGCOR Groupement de Gendarmerie départementale de la Corse-du-Sud Groupement de Gendarmerie départementale de la Haute-Corse Zone de défense et de sécurité Est 25x25px Région de Gendarmerie du Grand Est (MetzLe siège de la Région de Gendarmerie du Grand Est est à Metz bien que Strasbourg soit le siège administratif de la région.) - RGGE Groupement de Gendarmerie départementale de Meurthe-et-Moselle Groupement de Gendarmerie départementale de la Meuse Groupement de Gendarmerie départementale de la Moselle Groupement de Gendarmerie départementale des Vosges Groupement de Gendarmerie départementale du Bas-Rhin (formation administrative jusqu'en août 2022) Groupement de Gendarmerie départementale du Haut-Rhin Groupement de Gendarmerie départementale de la Marne (formation administrative jusqu'en août 2022) Groupement de Gendarmerie départementale des Ardennes Groupement de Gendarmerie départementale de l'Aube Groupement de Gendarmerie départementale de la Haute-Marne 20px Région de Gendarmerie de Bourgogne-Franche-Comté (Dijon) - RGBFC Groupement de Gendarmerie départementale de la Côte-d'Or Groupement de Gendarmerie départementale de la Nièvre Groupement de Gendarmerie départementale de Saône-et-Loire Groupement de Gendarmerie départementale de l'Yonne Groupement de Gendarmerie départementale du Doubs (formation administrative jusqu'en août 2022) Groupement de Gendarmerie départementale de Belfort Groupement de Gendarmerie départementale du Jura Groupement de Gendarmerie départementale de la Haute-Saône Zone de défense et de sécurité Nord 25x25px Région de Gendarmerie des Hauts-de-France (Lille) - RGHF Groupement de Gendarmerie départementale du Nord Groupement de Gendarmerie départementale du Pas-de-Calais Groupement de Gendarmerie départementale de la Somme (formation administrative jusqu'en août 2022) Groupement de Gendarmerie départementale de l'Aisne Groupement de Gendarmerie départementale de l'Oise Régions (2005-2016) En 2005, les légions de gendarmerie départementale prennent l'appellation de régions de gendarmerie et sont alors directement subordonnées à la direction générale de la Gendarmerie nationale. Cependant, les commandants de régions de gendarmerie situés aux sièges de zones de défense exercent également leur commandement sur l'ensemble des unités de Gendarmerie mobile implantées dans la zone de défense.
Cette même année, la France métropolitaine est organisée en 7 zones de défense et de sécurité.
En 2010, les 4 groupements de gendarmerie départementale de Paris et sa petite couronne (Paris, Hauts-de-Seine, Seine-Saint-Denis et Val-de-Marne) sont dissous et laissent la place au groupement de gendarmerie interdépartemental de Paris (GGIP) disposant d'une seule brigade territoriale par département : Paris-Exelmans, Nanterre, Bobigny et Créteil. Le GGIP et ses brigades seront dissous en 2015Arrêté du 31 août 2015 portant dissolution des brigades territoriales de Paris-Exelmans (Paris), de Nanterre (Hauts-de-Seine), de Bobigny (Seine-Saint-Denis) et de Créteil (Val-de-Marne) et création de l’assiette territoriale de la brigade interdépartementale de renseignements et d’investigations judiciaires de la section d’appui judiciaire de Paris.
Organisation en 2005 500px|droite 25x25px Région de Gendarmerie d'Ile-de-France - RGIF Groupement de Gendarmerie départementale de l’Essonne Groupement de gendarmerie départementale des Hauts-de-Seine Groupement de gendarmerie départementale de Paris Groupement de Gendarmerie départementale de Seine-et-Marne Groupement de gendarmerie départementale de la Seine-Saint-Denis Groupement de Gendarmerie départementale du Val-d'Oise Groupement de gendarmerie départementale de Val-de-Marne Groupement de Gendarmerie départementale des Yvelines Zone de défense et de sécurité Sud-Ouest 25x25px Région de Gendarmerie d'Aquitaine (Bordeaux) - RGAQ Groupement de Gendarmerie départementale de la Dordogne Groupement de Gendarmerie départementale de la Gironde Groupement de Gendarmerie départementale des Landes