Le motif de reconnaissance de l'ARN ou RRM (de RNA recognition motif en anglais ) est un domaine protéique d'environ 90 acides aminés de long et qui est présent dans de nombreuses protéines eucaryotes connues pour fixer de l'ARN simple-brin. On le trouve en particulier dans plusieurs protéines participant aux petites ribonucléoprotéines nucléaires (snRNPp) du splicéosome et dans la Poly(A)-binding protein.

Ces domaines contiennent un motif conservé de huit acides aminés appelé séquence consensus RNP-1.

Les domaines RRM typiques se composent de quatre feuillets bêta antiparallèles et de deux hélices alpha disposés dans un motif en β-α-β-β-α-β avec des chaînes latérales qui s'empilent sur les bases de l'ARN. Une troisième hélice se forme parfois lors de l'interaction avec l'ARN.

Voir aussi Domaine protéique

Notes et références

Catégorie:Domaine protéique Catégorie:ARN