La Coupe de Russie 2006-2007 est la de la Coupe de Russie depuis la dissolution de l'URSS.
Le Lokomotiv Moscou remporte la compétition face au FK Moscou et se qualifie pour le premier tour de la Coupe UEFA 2007-2008.
La compétition suivant un calendrier sur deux années, contrairement à celui des championnats russes qui s'inscrit sur une seule année, celle-ci se trouve de fait à cheval entre deux saisons de championnat ; ainsi pour certaines équipes promues ou reléguées durant la saison 2006, la division indiquée peut varier d'un tour à l'autre.
Huitièmes de finale ClubScoreClubAllerRetourFK Rostov (D1)4 - 1(D1) Rubin Kazan3 - 11 - 0Torpedo Moscou (D2) 0 - 1(D2) Dinamo Briansk0 - 10 - 0CSKA Moscou (D1)0 - 2(D1) Krylia Sovetov Samara0 - 00 - 2FK Moscou (D1)6 - 2(D1) Amkar Perm3 - 03 - 2Dinamo Makhatchkala (D4)0 - 3forfait(D1) Lokomotiv MoscouforfaitDynamo Moscou (D1)2 - 1(D1) Tom Tomsk2 - 00 - 1Spartak Moscou (D1)4 - 1(D1) Sibir Novossibirsk1 - 03 - 1Zénith Saint-Pétersbourg (D1)2 - 1(D1) Saturn Ramenskoïe1 - 01 - 1
Quarts de finale ClubScoreClubAllerRetourFK Rostov (D1)1 - 2(D2) Dinamo Briansk1 - 20 - 0FK Moscou (D1)5 - 2(D1) Krylia Sovetov Samara3 - 22 - 0Dynamo Moscou (D1)1 - 4(D1) Lokomotiv Moscou1 - 00 - 4Zénith Saint-Pétersbourg (D1)2 - 3(D1) Spartak Moscou1 - 21 - 1
Demi-finales ClubScoreClubAllerRetourDinamo Briansk (D2)1 - 2(D1) FK Moscou1 - 10 - 1Lokomotiv Moscou (D1)5 - 1(D1) Spartak Moscou3 - 02 - 1
Finale
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