vignette|droite|logo Gene Wiki Gene Wiki est un projet de Wikipédia en anglais qui vise à décrire les relations et les fonctions de tous les gènes humains. Il a été créé pour transférer des informations à partir de ressources scientifiques vers les articles de Wikipédia.... Le projet Gene Wiki a également lancé la publication d'articles de synthèse sur des gènes spécifiques dans la revue Gene, ainsi que l'édition des pages spécifiques au gène dans Wikipedia..
Objectifs et portée du projet Nombre d'articles
Le génome humain contient environ codant des protéines.. Le but du projet Gene Wiki est de créer des articles pour chaque gène humain notable, c'est-à-dire chaque gène dont la fonction a été assignée dans la littérature scientifique évaluée par des pairs. Environ la moitié des gènes humains ont une fonction assignée. Par conséquent, le nombre total d'articles concernés par le projet Gene Wiki devrait être de l'ordre de . À ce jour, environ ont été créés ou enrichis.. Une fois que les articles de base ont été établis, l'espoir et l'attente est que ceux-ci seront annotés et verront leur contenu augmenté par des éditeurs allant de l'expérience du public profane, aux étudiants, professionnels et universitaires.
Protéines codées par des gènes La majorité des gènes codent des protéines, par conséquent la compréhension de la fonction d'un gène nécessite généralement la compréhension de la fonction de la protéine correspondante. En plus d'inclure des informations de base sur le gène, le projet comprend donc également des informations sur la protéine codée par le gène. Les informations sont d'abord importées dans Wikidata. En , au total, humains et de souris ont été importés du , le Centre américain pour les informations biotechnologiques, et humaines et de souris ont été importées du sous-ensemble Swissprot d'UniProt.. À partir de Wikidata, les infobox de Wikipédia sont ensuite éditées. De plus, « un terminal SPARQL et l'exportation de fonctionnalités vers plusieurs formats standard (JSON, XML) permettent aux scientifiques d'utiliser les données ».
Sources du projet
Les ébauches d'articles pour le projet Gene Wiki sont créées par un bot informatique et contiennent des liens vers les bases de données de gènes et de protéines suivantes :
HUGO Gene Nomenclature Committee - nom générique officiel Entrez - base de données de gènes OMIM (Mendelian Inheritance in Man) - base de données répertoriant toutes les maladies connues avec une composante génétique Amigo - Gene Ontology HomoloGene - gènes homologues chez d'autres espèces SymAtlasRNA - motif d'expression génique dans les tissus. Protein Data Bank - structure 3D de la protéine codée par le gène UniProt (ressource protéique universelle) - un référentiel central de données sur les protéines
Références
Voir aussi
Wikipedia:WikiProject Molecular Biology/Genetics/Gene Wiki sur Wikipédia en anglais Gene Ontology
Catégorie:Gène Catégorie:Wiki Catégorie:Histoire de Wikipédia