L’Etat libre associé de Porto Rico compte plus de 143 îles, cayes, îlots et atolls. Seules l'île principale de Porto Rico () et les îles de Vieques () et de Culebra () sont habitées. L'île de Mona () compte du personnel du en poste toute l'année, mais aucun citoyen ne l'habite (à l'exception des visiteurs qui passent la nuit au camping). L'île Caja de Muertos () est également une réserve naturelle du DNER, tandis que l'île de Desecheo () est un refuge national pour la faune sauvage administré par le US Fish and Wildlife Service.
Les 140 autres îles, cayes, îlots et atolls ne sont pas habités. Trois des îles sont entre des mains privées : l’île de Palomino, louée à long terme à l’hôtel El Conquistador, et l’île de Ramos et l’île de Lobos.
Porto Rico Desecheo (National Wildlife Refuge) Mona Monito Cardona Isla de Cabras (Site historique national de San Juan) Isla del Frío Isla de Jueyes Caja de Muertos Ratones vignette|Îles Vierges espagnoles Et les « Îles Vierges espagnoles » : Cayo Lobo Cayo Luis Peña Cayo Norte Culebra (Refuge faunique national de Culebra) Culebrita Vieques
* Porto Rico Île