vignette|300x300px|Juifs lituaniens et un soldat allemand de la Wehrmacht pendant la Shoah en Lituanie ().

L'occupation allemande de la Lituanie fait partie de l'invasion de l'URSS par l'Allemagne nazie le (opération Barbarossa). Le territoire sera totalement libéré le par la retraite de la Wehrmacht et sa mise en déroute lors de la bataille de Memel.

Initialement, les Allemands sont acclamés par les Lituaniens qui voient en eux des libérateurs du régime soviétique, qui occupait la Lituanie avant l’arrivée allemande, espérant que ces derniers rétablissent leur indépendance, ou au moins permettent un certain degré d'autonomie (semblable à la République slovaque). Les Allemands n’apportent cependant aucun soutien de ce type : ils remplacent progressivement les institutions lituaniennes par leur propre administration et déroulent leur planification nommée Generalplan Ost. Le Reichskommissariat Ostland est créé à la fin du mois de . Privé par l'occupant de tout pouvoir réel, donc réduit à un rôle de marionnettes, un gouvernement fantoche éphémère s'auto-dissout le .

Contexte

Pacte Molotov – Ribbentrop vignette|300x300px|Changements territoriaux en Lituanie entre 1939 et 1941. En , l'Union soviétique et l'Allemagne nazie signent le pacte germano-soviétique de non-agression et son protocole additionnel secret, divisant l'Europe centrale et orientale en sphères d'influence. La Lituanie est initialement affectée à la sphère allemande, probablement en raison de sa dépendance économique vis-à-vis du commerce allemand. Après l'ultimatum de mars 1939 concernant la région de Klaipėda, l'Allemagne représente 75 % des exportations lituaniennes et 86 % de ses importationsSkirius (2002). Pour renforcer son influence, l'Allemagne suggéra une alliance militaire germano-lituanienne contre la Pologne en promettant de restituer la région de Vilnius, mais la Lituanie respecta sa politique de stricte neutralitéClemens (2001), . Lorsque l'Allemagne envahit la Pologne en , la Wehrmacht prend le contrôle de la voïvodie de Lublin et de la voïvodie de Varsovie orientale, alors situées dans la sphère d'influence soviétique. Pour compenser cette perte pour l'Union soviétique, un codicille secret du Traité de frontière et d'amitié germano-soviétique transfère la Lituanie dans la sphère d'influence soviétiqueEidintas (1999), , ce qui sert de justification permettant aux Soviétiques d'occuper la Lituanie le , afin d'établir la RSS de Lituanie.

Première occupation soviétique

Quasiment immédiatement après le Traité d'amitié et de frontière germano-soviétique, les Soviétiques font pression sur les Lituaniens pour qu'ils signent le . Selon ce traité, la Lituanie acquiert carrés de territoire dans la région de Vilnius (y compris Vilnius, capitale historique de la Lituanie) en échange de cinq bases militaires soviétiques en Lituanie ( hommes au total)Eidintas (1999), . Les territoires que la Lituanie reçoit de l'Union soviétique étaient les anciens territoires de la Seconde République polonaise, disputés entre la Pologne et la Lituanie depuis les temps de la guerre polono-lituanienne de 1920 et occupés par l'Union soviétique à la suite de l'invasion soviétique de la Pologne en . Le New York Times qualifie le traité soviéto-lituanien de . Des pactes similaires ont été proposés à la Lettonie, à l'Estonie et à la Finlande. Cette dernière fut le seul État à refuser un tel traité, ce qui déclencha la guerre d'Hiver. Cette guerre retarde l'occupation de la Lituanie : en effet, les Soviétiques n'interviennent en aucun cas dans les affaires intérieures de la LituanieVardys (1997), et les soldats russes présents dans les bases lituaniennes ne se font pas remarquerSabaliūnas (1972), . À l’achèvement de la guerre d'Hiver en mars et tandis que l'Allemagne progresse rapidement dans la bataille de France, les Soviétiques intensifient la rhétorique anti-lituanienne et accusent à tort les Lituaniens d'avoir enlevé des soldats soviétiques de leurs bases. Malgré les tentatives lituaniennes de négocier et de résoudre les problèmes, l'Union soviétique lance un ultimatum le 14 juin 1940Rauch (2006), . Cet ultimatum exige la formation d'un gouvernement pro-soviétique ainsi que le stationnement d'un nombre indéterminé de soldats russes. La Lituanie est contrainte de céder. Le président Antanas Smetona quitte le pays et quinze divisions de l'Armée rouge, soit un total de soldats, franchissent la frontière lituanienne . La Lituanie perd son indépendance. Vladimir Dekanozov forme alors le nouveau gouvernement fantoche pro-soviétique. Justas Paleckis remplace Smetona comme président de la Lituanie. Le , le Seimas décide à l'unanimité la création de la République socialiste soviétique de LituanieVardys (1997), . Ces actions permettent à la propagande soviétique d'affirmer que la Lituanie avait adhéré volontairement à l'Union soviétique.

Persécution soviétique

vignette|Le dirigeant du Parti communiste de Lituanie, Antanas Sniečkus, lance les premières déportations massives de Lituaniens en juin 1941. Immédiatement après l'occupation, les politiques de soviétisation sont mises en œuvre. Le , toutes les organisations politiques, culturelles et religieuses sont ferméesKamuntavičius (2001), , seuls le Parti communiste de Lituanie et sa branche jeunesse sont maintenus La totalité des banques (y compris tous les comptes de plus de litas), les immeubles de plus de carrés, les entreprises privées de plus de 20 travailleurs ou plus de litas de recettes brutes sont nationaliséesAnušauskas et al. (2005), , 119. Cette perturbation de la gestion et des opérations entraînent une forte baisse de la production. Les soldats et les responsables russes, impatients de dépenser leurs roubles, provoquent une pénurie massive de marchandises. La collectivisation n'est en aucun cas introduite en Lituanie. Toutes les terres sont nationalisées par la force, les exploitations réduites à 30 hectares et des terres supplémentaires (environ ) distribuées aux petits agriculteursAnušauskas et al. (2005), .En prévision d'une éventuelle collectivisation, de nouvelles taxes représentant 30 à 50 % de la production agricole sont adoptées. Le litas lituanien est déprécié artificiellement 3 à 4 fois sa valeur réelle et finalement retiré en . En prévision des élections au Parlement du peuple, le NKVD arrête environ des principaux militants politiques, paralysant toute tentative de créer des groupes anti-soviétiques. Environ sont emprisonnés en tant qu'Lane (2001), . Incapables de faire face à de nouvelles taxes exorbitantes, environ des plus gros agriculteurs sont traduits en justiceAnušauskas et al. (2005), . Le NKVD oblige les militants communistes locaux, dont certains étaient juifs, à dépister et dénoncer les anciens fonctionnaires de l'État lituanien, les enseignants, prêtres, juges, avocats, policiers, militaires, commerçants et autres . Du 14 au , moins d'une semaine avant l'invasion nazie, quelque Lituaniens sont déportés au Goulag en Sibérie, où beaucoup périront à cause de conditions de vie inhumainesAnušauskas et al. (2005), Gurjanovas (1997). Certains des nombreux prisonniers politiques sont massacrés par l'Armée rouge en retraite. Ces persécutions furent essentielles pour solliciter le soutien des nazis.

Invasion de l'Allemagne et révolte lituanienne

vignette|Pogrom de Kaunas en Lituanie sous occupation allemande, en juin 1941. Photo attribuée à Wilhelm Gunsilius. Le , le territoire de la RSS de Lituanie est envahi par deux groupes d'armées allemandes en progression : le groupe d'armées Nord envahit l’ouest et le nord de la Lituanie, tandis que le groupe d'armées Centre prend le contrôle de la plus grande partie de la région de Vilnius. Les premières attaques perpétrées par la Luftwaffe contre des villes lituaniennes et coûtent la vie à quelque civilsAnušauskas et al. (2005), . La plupart des avions russes sont détruits au sol. Les Allemands avancent rapidement, ne rencontrant que la résistance sporadique des Soviets et l'assistance des Lituaniens, les considérant comme des libérateurs du régime répressif soviétique, espérant que ces derniers rétablissent leur indépendance, ou au moins permettent un certain degré d'autonomie (semblable à la République slovaque).

Les Lituaniens prennent alors les armes dans une révolte anti-soviétique et pro-indépendance. Des groupes d'hommes s'organisent spontanément et prennent le contrôle de zones stratégiques (tels que des voies de chemins de fer, des ponts, du matériel de communication, des entrepôts de nourriture et du matériel), les protégeant d'un éventuel sabotage soviétique. Kaunas est prise par les rebelles du Front des activistes lituaniens (LAF) de Kazys Škirpa, chef des LAF, qui se préparait à un soulèvement depuis au moins . Les activistes proclament l'indépendance de la Lituanie et mettent en place le gouvernement provisoire de Lituanie le . Vilnius est prise par des soldats du corps territorial lituanien, d'anciens soldats de l'armée lituanienne indépendante, ayant déserté l'Armée rouge. Des groupes plus petits et moins organisés émergent dans de nombreuses villes et campagnes lituaniennes.

La bataille de Raseiniai débute le alors que les Soviétiques tentaient de lancer une contre-attaque renforcée par des chars, lourdement défaite quatre jours plus tardAnušauskas et al. (2005), . Selon les estimations, le soulèvement aurait impliqué environ Anušauskas et al. (2005), à rebelles et coûté la vie à environ 600 Lituaniens et militants soviétiques. Le , les Allemands effectue une entrée triomphante à Kaunas et à Vilnius sans tirer un coup de feuAnušauskas et al. (2005), . En une semaine, les Allemands perdent quant à eux hommes, au prix du contrôle de la totalité du paysAnušauskas et al. (2005), p. 164.

Occupation allemande Administration vignette|Carte administrative du Reichskommissariat Ostland. Au cours des premiers jours de la guerre, l'administration militaire allemande, principalement soucieuse de la sécurité de la région, tolère les tentatives lituaniennes de créer leurs propres institutions administratives et laisse un certain nombre d'autorités civiles aux Lituaniens. Le gouvernement provisoire de Kaunas tente alors d'établir l'indépendance proclamée de la Lituanie et de réparer les torts causés par le régime soviétique d'un an. Au cours de ses six semaines d'existence, le gouvernement fantoche met en œuvre une centaine de lois et de décrets, mais ceux-ci ne seront généralement pas appliqués ; ses politiques pouvant être décrites comme à la fois anti-soviétique et antisémite. Les forces bénévoles organisées par le gouvernement, connu sous le nom Tautinio Darbo Apsaugos Batalionas (TDA), sert de base de fondement pour rétablir l'armée lituanienne. Cependant, l'unité paramilitaire sera employée par l'Einsatzkommando 3 et le Rollkommando Hamann pour les exécutions de masse des Juifs de Lituanie notamment au Neuvième Fort. À l'époque, des unités voyous dirigées par le tristement célèbre se déchaînaient en tout impunité à travers la ville et ses banlieues.