vignette|right|Affiche diffusée en 2011 sur Facebook par des opposants au régime Durant le conflit syrien, depuis 2011, les exactions ont été nombreuses et attribuées aux différents belligérants, en particulier au régime syrien, accusé de multiples crimes de guerre et crimes contre l'humanité.
Les victimes sont diverses : journalistes, personnels soignants, défenseurs des droits de l'homme, femmes et enfants, minorités religieuses, prisonniers d'opinion...
En , l'ONU met en place une commission chargée de la collecte de preuves : Le Mécanisme international, impartial et indépendant (MIII) chargé de la collecte des preuves des crimes de guerre en Syrie.
Attaques ciblées Les attaques ciblées contres des civils et des infrastructures civiles constituent des crimes de guerre. Elles sont cependant systématiquement utilisées par les aviations syrienne et russe, visant notamment les infrastructures nécessaires aux habitants : hôpitaux, secours, écoles, marchés, boulangeries, captage d'eau, convois humanitaires... dans uns stratégie délibérée de faire fuir les populations civiles.
Contre des journalistes Les citoyens syriens qui filment les manifestations au printemps 2011 sont les premiers pris pour cibles par l'armée et les milices du régime. Cela devient rapidement habituel : faire disparaître les témoins avant de réprimer le reste des manifestants.
À l'exception des journalistes sélectionnés par les autorités officielles, les reporters sont bannis de Syrie. Ceux qui entrent malgré tout dans le pays, font des cibles particulièrement visées. Durant les 18 premiers mois de la guerre civile, l'organisation Reporters sans frontières dénombre 33 meurtres de journalistes Thirty-three professional and citizen journalists killed since March 2011, article sur le site de Reporters sans frontières, publié le 12/07/2012. Beaucoup de journalistes ont été tués par les forces armées du gouvernement, comme Marie Colvin<ref> [https://www.telegraph.co.uk/news/worldnews/middleeast/syria/9097762/Syria-Sunday-Times-journalist-Marie-Colvin-killed-in-Homs.html Syria: Sunday Times journalist Marie Colvin 'killed in Homs], article de Murray Wardrop, publié sur le site du Telegraph, le 22/02/2012</ref>. La mort du journaliste français Gilles Jacquier, alors en reportage autorisé par Damas, a tout d'abord été imputée à des tirs rebelles mais serait, selon ses confrères présents sur place, le fait du régime syrienJacquier : l'enquête française pointe les rebelles syriens, article de Georges Malbrunot, publié sur le site du Figaro, le 17/07/2012.
La Syrie est en avril 2014, le pays le plus dangereux au monde pour les journalistes.. À cette période, le gouvernement n'est plus le seul à s'en prendre aux journalistes, mais également certains groupes armés extrémistes, notamment l’État islamique. À l'instar du régime, ils s'opposent à la liberté de la presse et le simple fait d'avoir une caméra ou un appareil photo sont des motifs d'arrestation et de détention.
En , Des juges français émettent des mandats d'arrêt contre Bachar El Assad, et sept anciens hauts responsables baasistes syriens, accusés de complicité de crimes de guerre et de crimes contre l'humanité pour une attaque à la roquette en 2012 contre un centre de presse à Homs qui a tué les journalistes Marie Colvin et Rémi Ochlik, et en a blessé plusieurs d'autres.
Contre du personnel soignant Début 2017, le rapporteur spécial sur le droit à la santé auprès des Nations unies, revenant d'une enquête auprès de blessés et soignants en Syrie, peut « confirmer que les infrastructures de santé sont délibérément visées dans le conflit syrien, ce qui constitue une violation du droit international et des droits de l'homme. C'est sans précédent. Les hôpitaux sont ciblés, les civils sont volontairement privés d'accès aux soins. » et affirme que les bombardements d'hôpitaux ne peuvent pas être niés, et sont au contraire des faits avérés, répétés et qu'il s'agit d'une tactique de guerre.
Médecins sans frontières affirme que « depuis le début du soulèvement syrien, l’aide humanitaire en zone d’opposition est criminalisée et le personnel de santé, directement visé par le gouvernement syrien, fait l’objet d’une véritable campagne de persécution ». L'ONG n'a pas l'autorisation d'intervenir en Syrie, et décide d'opérer clandestinement.
Des témoins, parmi lesquels des soignants survivants, le GPPI, Physicians for Human rights et le New York Times affirme qu'apporter des soins médicaux dans une zone d'opposition est un crime aux yeux du régime d'Assad, qui, avec ses alliés, a visé et tué des centaines de personnels soignants et en a arrêté, torturé, souvent à morts, des centaines d'autres. La mort de 942 personnels soignants a été documentée par Physicians for Human rights.
Contre l'aide humanitaire Des convois humanitaires, en plus d'être empêchés d'accès à des zones assiégées, sont également la cible de bombardements aériens. Le ciblage d'un convoi de l'ONU le 20 septembre 2016 fait de nombreux blessés et morts.
Le largage de 28 bombes barils lors de la distribution d'aide alimentaire à Daraya, quelques heures après l'arrivée du seul convoi humanitaire depuis plusieurs années de siège a provoque l'indignation..
Selon Médecins sans frontières « l’aide humanitaire en zone d’opposition est criminalisée et le personnel de santé, directement visé par le gouvernement syrien, fait l’objet d’une véritable campagne de persécution ». L'enlèvement de cinq volontaires par l'État islamique contraint également l'ONG à cesser ses activités dans la zone contrôlée par le groupe.
Contre des minorités religieuses Deux évêques aleppins sont enlevés le 22 avril 2013 : le grec orthodoxe Boulos Yazij et le syriaque orthodoxe Yohanna Ibrahim. Revenant de Turquie, leur chauffeur a été abattu, et les deux évêques sont portés disparus Syrian bishops kidnapped in Aleppo still missing one month on, article sur le site du Guardian, publié le 25/05/2013. De nombreux témoignages accusent des brigades rebelles d'enlèvements, de tortures et de meurtres ciblant les minorités chrétiennes et kurdes.
Viols et agressions sexuelles pendant le conflit Women Under Siege, une organisation de défense des droits humains, avait documenté, en juillet 2012, plus de de viols et d'agressions sexuelles pendant le conflit. La plupart de ces crimes sont attribués aux Shabiha et aux autres milices loyalistes. Les victimes étaient des hommes, des femmes et des enfants, les femmes et les filles représentant 80 % des victimes., même si une étude du HCR indique que les violences sexuelles envers les hommes et les garçons pourraient être sous-estimées.
À la fin de novembre 2013, selon un rapport de l' intitulé , près de femmes avaient été victimes de viols (y compris de viols collectifs) depuis le début du conflit. Les chiffres sont probablement beaucoup plus élevés, un grand nombre de cas ne faisant pas l'objet de déclaration.Report: rape used as weapon of war against Syria women, Alarabiya, 25 novembre 2013.6,000 cases of women raped during Syrian conflict, human rights group says, Globalpost, 26 novembre 2013.. En mars 2014, Abdel Karim Rihaoui, président de la Ligue syrienne des droits de l'homme, estime à plus de le nombre des femmes violées dans les prisons du régime syrienLe viol, arme de destruction massive en Syrie, Le Monde, 4 mars 2014.« En Syrie, le viol était le maître mot », article du journal Le Monde, 5 décembre 2017, à l'occasion de la diffusion d'un documentaire Syrie, le cri étouffé, réalisé par Manon Loizeau et coécrit avec Annick Cojean, avec l’aide de Souad Wheidi, diffusé le mardi 12 décembre 2017 sur France 2.. Parmi elles, 90 % auraient été violées de manière répétée. Les hommes et les mineurs sont également victimes de viol.
Le viol est utilisé comme arme de guerre par le régime de manière systématique, ce qui pourrait constituer un crime contre l'humanité. Les forces de sécurité du régime sont également connues pour harceler sexuellement les femmes, notamment lorsque leurs époux ont été arrêtés.
En 2017, une étude du HCR indique que les violences sexuelles ont lieu également hors du territoire syrien dans les pays d'asile entre réfugiés ou par la population locale.
Exactions envers des enfants vignette|right|Cadavres d'enfants à la suite de l'attaque chimique de la Ghouta en 2013 Le 25 mai 2011, le corps mutilé de Hamza al-Khatib, un garçon âgé de disparu depuis le 29 avril, est rendu à sa famille par les autorités syriennes. Il porte des marques de tortures : cou et mâchoire brisés, rotules broyées, brûlures de cigarettes, blessures par balles dans les bras et parties génitales mutilées. Il avait été arrêté lors d'une manifestation contre le régime. Les images de son corps, diffusées par la famille malgré l'interdiction, alimentent l'indignation contre le régime, qui nie les tortures et les circonstances du décès Apparent torture of boy reinvigorates Syria’s protest movement, The Washington Post, 30 mai 2011. Syrian boy's brutal death rouses protesters, CBSnews.com, 31 mai 2011. How a 13-year-old became a symbol of Syrian revolution, The Globe and Mail, juin 2011.. Cependant, la photographie de son corps torturé, prise par le régime fait partie des photographies exfiltrées par l'ancien photographe légiste César, elle porte le numéro 23 et « apporte la preuve que l'adolescent a été torturé par les services de renseignement ».
Au début du mois de février 2012, le Fonds des Nations unies pour l'enfance estimait en outre que plus de avaient été tués 400 children killed in Syria unrest. Arab News. 8 février 2012. ; supplémentaires auraient aussi été arrêtés et torturés dans les prisons syriennes Peralta, Eyder | Rights Group Says Syrian Security Forces Detained, Tortured Children : The Two-Way. NPR. 3 février 2012.. Ces deux informations ont été contestées par le gouvernement syrien.
Le 12 juin 2012, l'ONU dénonce le gouvernement syrien comme étant « l'un des pires sur sa liste annuelle « de la honte » où figurent les protagonistes des pays en conflit où les enfants sont tués, torturés et forcés à combattre. » Dans son rapport « Les enfants dans les conflits armés », rendu public le même jour, les Nations unies affirment que « les soldats syriens ont torturé et exécuté sommairement des enfants, et se sont servis de certains d'entre eux âgés d'à peine huit ans comme de « boucliers humains » au cours de leurs opérations contre les rebelles ». Le rapport cite à l'appui les circonstances d'une opération menée le 9 mars par les forces de sécurité syriennes, armée, services de renseignement et milice Chabiha, contre le village d'Ayn l'Arouz dans la région d'Idleb où ont été « raflés des dizaines de garçons âgés de huit à treize ans avant d'attaquer le village. . Radhika Coomaraswamy, représentante spéciale de l'ONU pour les enfants dans les conflits armés, avait déjà fustigé les forces gouvernementales syriennes avant la publication de ce rapport déclarant
Le , Leila Zerrougui, Représentante spéciale du Secrétaire général des Nations unies pour les enfants et les conflits armés, déclare que le nombre d'enfants affectés par le conflit a doublé en un an et que la Syrie est ainsi devenue « l'un des endroits au monde les plus dangereux pour les enfants ». Elle estime que d'enfants syriens sont privés d'éducation « depuis trois ans pour nombre entre eux »Syrie : une génération entière d'enfants sacrifiée après trois ans de guerre, selon l'ONU. Sur le site du Centre d'actualités de l'ONU..
Des enfants soldats sont aussi présents sur le front, d'après Human Rights Watch. Le régime syrien emprisonne de jeunes enfants « avec des adultes, en les exposant à la violence sexuelle et en les soumettant aux mêmes mauvais traitements et la torture comme détenus adultes ».
Début 2016, il est évalué que plus de 90 % des morts d’enfants et des blessures subies par les enfants durant le conflit syrien ont été infligées par les bombardements aériens.
Sièges de populations civiles