L'institut hospitalo-universitaire en maladies infectieuses de Marseille (IHU Méditerranée Infection) ou « IHU MI » est un institut hospitalo-universitaire créé en 2011 sous la forme d'une fondation de coopération scientifique, et inauguré en . Il est dirigé par Didier Raoult jusqu'en , puis par Pierre-Édouard Fournier.

L'institut a comme membres fondateurs l'université d'Aix-Marseille, l'AP-HM, l'Institut de recherche pour le développement (IRD), le Service de santé des armées, BioMérieux, et l'Établissement français du sang (EFS). L'Inserm et le CNRS s'en sont dissociés après une mauvaise évaluation scientifique du centre en 2018. Les anciens dirigeants de l’IHU et de l’IRD sont condamnés en 2023 pour prise illégale d’intérêts dans le cadre du financement de l'IHU par l'IRD.

En 2021 et 2022, l'IHU fait l'objet de plusieurs enquêtes par l'IGAS et l'IGESR, qui relèvent de graves manquements en matière de recherche et de soin, dénoncent le management très autoritaire de Didier Raoult, et exigent une réorganisation profonde de la structure.

En 2023, une information judiciaire est en cours, portant sur les . Des faits relatifs à la prise en charge thérapeutique de la tuberculose et de la Covid-19, qui, selon la mission d’inspection Igas-IGESR, seraient susceptibles de constituer des faits de recherches cliniques non autorisés, font l’objet d’une analyse complémentaire en cours par le parquet de Marseille.

Présentation Genèse Lauréat des investissements d'avenir en 2011, le projet d’IHU de Marseille en maladies infectieuses (POLMIT) consistait en 2011 à concentrer sur le site de la Timone à Marseille les moyens de lutte contre les maladies infectieuses. La création de l'institut est financée grâce à la subvention la plus élevée accordée en France pour la recherche médicale : (dont consacrés à la construction du bâtiment). Le coût total est de « plus de d'euros »« Droit de réponse du professeur Raoult », La Provence, 29 novembre 2017. Il est ouvert aux patients en . Un nouveau bâtiment de est inauguré en ..

Gouvernance de l'institut L'IHU est administré par la fondation Méditerranée Infection, une fondation de coopération scientifique qui regroupe sept membres fondateurs, dont l'Assistance Publique – Hôpitaux de Marseille et Aix-Marseille Université, et des membres partenaires.

À sa création, l'IHU est présidé par le docteur Yolande Obadia et dirigé par le professeur Didier Raoult.. Philippe Douste-Blazy, ancien ministre de la Santé est membre du conseil d’administration, ainsi que Geneviève Fioraso, ancienne ministre de la recherche. Yolande Obadia était précédemment directrice de la fondation Infectiopôle Sud présidée par Didier Raoult.

Ces derniers sont remplacés en 2022 par Emmanuelle Prada-Bordenave et Pierre-Édouard Fournier.

Critiques à partir de 2015 et évolution à partir de 2023 La mission de l'IGAS regrette en 2015 que .

En 2017, le rapport « no 2017-093 » missionné par le ministère de l’Enseignement supérieur et de la Recherche dénonce de nombreuses dérives. Court de 25 pages, il fait suite à une visite de l'institut entre les 9 et . Le rapport décrit , et un . Frédérique Vidal, à l’époque ministre de l’Enseignement supérieur et de la Recherche, Yvon Berland, ami proche de Didier Raoult et président d’Aix-Marseille Université et Jean-Olivier Arnaud, directeur de l’AP-HM, étaient destinataires de ce rapport qui n'a pas été rendu public. L'année suivante, l’IHU perd ses tutelles Inserm et CNRS, pour et .

Le , François Crémieux, nommé à la tête de l'AP-HM en , et Eric Berton, président de l'Université Aix-Marseille, annoncent que Didier Raoult prendra sa retraite de professeur-praticien des hôpitaux le , et qu'ils souhaitent qu'il abandonne aussi la direction de l’IHU. Cela dans un contexte où les prises de positions de Didier Raoult sur la vaccination anti-Covid sont présentées dans la presse comme étant problématiques, et l'image de l'IHU auprès de ses partenaires comme dégradée. Le le conseil d'administration met en route une procédure de recrutement, qui .. Le processus de remplacement est piloté par Louis Schweitzer, un membre du conseil stratégique d’Aix-Marseille Université.

Le comité sélectionne l'ancien doctorant de Didier Raoult et professeur de l’IHU Pierre-Édouard Fournier.., en annonçant que son projet devrait conduire . Cette nomination suscite la polémique, le professeur Fournier étant . Il a contesté en aux côtés de Didier Raoult l'efficacité du vaccin contre la Covid-19 avant de signer début 2022 l’appel à la vaccination lancé par l’AP-HM ; il est secrétaire du comité d’éthique de l’IHU, très critiqué par l’Agence nationale de sécurité du médicament ; et c'est un proche d'Éric Ghigo, le médecin condamné en première instance pour agression sexuelle et de harcèlements moral et sexuel sur des collègues féminines au sein de l’IHU. Les représentants du personnels s'opposent à cette nomination., en vain. Au contraire, Didier Raoult s'en félicite en postant un sur twitter.

Un rapport de l'IGAS et de l’Inspection générale de l’éducation, du sport et de la recherche, faisant le bilan d'une inspection lancée en après les révélations de Mediapart et de L’Express sur les expérimentations médicales sauvages de l'IHU, est dévoilé dans une version préliminaire début , puis dans sa version finale début septembre. Les inspecteurs vont plus loin que ceux de l’ANSM en s'intéressant aussi à la gouvernance de l’IHU-MI, à sa stratégie, et aux conditions de travail. Ils relèvent de graves manquements en matière de recherche et de soins, notamment en termes de risques psychosociaux (avec la mise en place d'une des personnels à un management « tyrannique ») et de .. Le rapport relativise la qualité de la production scientifique, moins bonne que celle des autres IHU. La mission relève l'histoire de la longue dérive autoritaire de Didier Raoult, décrit par certains personnels comme « parfois brutal ou colérique », qui s'est entouré de chefs de service qui lui doivent leur nomination et sont dans une posture de « grande soumission » ; le conseil d’administration de l’IHU qui ne joue pas le rôle de contre-pouvoir.. Les inspecteurs demandent qu'une instruction judiciaire évalue les « comportements qui pourraient s’apparenter à du “ harcèlement” ». La protection juridique accordée à Didier Raoult a coûté à l’IHU.

Après la finalisation du rapport administratif en , les ministres de l’enseignement supérieur et de la santé annoncent avoir saisi le procureur de la République de Marseille pour des faits . Comme le lui demande l’inspection générale des affaires sociales, Pierre-Édouard Fournier, qui s'est engagé à suspend tous les essais cliniques en cours.. Ces restrictions sont partiellement levées en , mais l’ANSM garde l'IHU et l'AP-HM sous « surveillance renforcée », avec obligation de rendre des comptes chaque trimestre pendant au moins un an.

Le , la présidente de l'IHU, Dr Yolande Obadia annonce quitter ses fonctions à la présidence mais restera membre du CA dans le collège des personnalités qualifiées.. ; elle est remplacée par Emmanuelle Prada-Bordenave., membre du conseil d’État, passée par la direction de l’agence de biomédecine et la haute autorité de santé. Philippe Douste-Blazy est remercié, et les principaux lieutenants de Didier Raoult sont mis à l'écart: il s'agit notamment de Michel Drancourt, ancien directeur adjoint, Philippe Parola qui pilotait les relations extérieures, Philippe Brouqui, chef du pôle Maladies infectieuses, et Yannis Roussel, responsable de la communication de l'IHU pendant la crise Covid. Mais des postes clés restent attribués à des promoteurs assidus de l’hydroxychloroquine, notamment la directrice adjointe Florence Fenollar ou Jean-Christophe Lagier, successeur du professeur Brouqui au pôle maladies infectieuses.

La nouvelle direction est convoquée par Sylvie Retailleau et François Braun en pour rassurer quant à l'application du plan d’action censé remédier aux graves dysfonctionnements pointés par le rapport d’enquête accablant. Les ministres avertissent alors que le financement de l'IHU par l'État sera conditionné au respect intégral du plan d’actions et de la réglementation en vigueur.. François Crémieux insiste pour que Didier Raoult quitte vraiment l'IHU après le scandale d'une nouvelle étude sur l'hydroxychloroquine brièvement mise en ligne en 2023, estimant que ..

L'IHU est évalué en par l'HCERES, qui publie un rapport très critique en . Les rapporteurs recommandent des mesures plus radicales pour tourner la page de la période Raoult, notamment un changement de gouvernance, pour écarter les personnes ayant participé à l’ancienne équipe de direction et qui ont été impliquées dans la publication d'articles problématiques...

Une étude publiée en 2026 dans la revue montre que 853 des publiés par l'IHU pendant les trente années précédentes posent des problèmes éthiques : soit que leur autorisation n'a été obtenue qu'après que la recherche a été effectuée, soit qu'elle ne correspond pas aux recherches effectuées ; 64 articles ont été rétractés et 270 font l'objet d'une procédure d'expression de préoccupation. Les auteurs regrettent le peu d'empressement de l'Université d'Aix-Marseille à apporter les précisions demandées, certaines n'ayant pu être obtenues qu'en faisant appel à la commission d’accès aux documents administratifs.

Infrastructure et organisation Situé sur le site de la Timone, il s'étend sur , dont destinés aux soins du pôle maladies infectieuses et tropicales avec près de 75 lits d’hospitalisation complète et 25 lits d’hôpital de jour. L'IHU n'a aucune structure de réanimation, mais peut traiter des malades dont l'état ne nécessite pas de prise en charge lourde ; l'unité comporte 75 lits. Les patients qui ont besoin de réanimation sont transférés à l’hôpital de la Timone. Cela explique notamment pourquoi le taux de mortalité lié au Covid-19 à l'IHU Méditerranée entre janvier et était quatre fois plus faible que dans le reste de l'AP-HM.

L'IHU emploie 800 personnes dont un tiers affecté à la recherche. En 2016, l'IHU comporte quatre unités de recherche : l’URMITE (UMR 7278) dirigée par le professeur Didier Raoult, l’EPV (UMR 190), dirigée par le professeur Xavier de Lamballerie, renommée UVE en 2018, le SESSTIM (UMR 912) dirigée par le professeur Jean-Paul Moatti et l’UMR MD-3 du professeur Renaud Piarroux. En , l'une des UMR, l'URMITE, est scindée en deux : VITROME (Vecteurs – Infections Tropicales et Méditerranéennes) et MEPHI (Microbes Evolution Phylogeny and Infections). Il dispose d'un budget annuel de 3 millions d'euroshttps://www.lesechos.fr/2015/01/marseille-au-coeur-de-la-lutte-contre-les-maladies-infectieuses-198602.

Thèmes de recherche Les thèmes de recherche sont la lutte contre le SIDA, la tuberculose et le paludisme, ainsi que la recherche dans le domaine des maladies émergentes (infections respiratoires et infections diarrhéiques)Voir différentes publications sur PubMed.org et l'étude de la contagion de ces maladies. Une de ses missions est « une fonction d'alerte primordiale. » Selon Didier Raoult, le « laboratoire surveille déjà 80 % des microbes isolés par les acteurs de la santé dans la région Paca, soit près de 100.000 bactéries par an »Didier Raoult, https://www.lesechos.fr/2015/06/nous-creons-ce-que-devait-etre-linstitut-pasteur-il-y-a-cinquante-ans-1107366.

L'institut fait beaucoup parler de lui, notamment par la voix de Didier Raoult, lors de la controverse sur le traitement de la maladie à coronavirus 2019 par l'hydroxychloroquine.

Le projet Vitrome