Les protéines liées à la pathogenèse (PR, de l'anglais Pathogenesis-related protein) sont des protéines produites dans les plantes en cas d'attaque par un pathogène. Ils sont induits dans le cadre d'une résistance systémique acquise. Les infections activent les gènes qui produisent des protéines PR. Certaines de ces protéines sont antimicrobiennes et attaquent les molécules de la paroi cellulaire d'une bactérie ou d'un champignon. D'autres peuvent fonctionner comme des signaux qui propagent des « nouvelles » de l'infection aux cellules voisines. Les infections stimulent également la réticulation des molécules dans la paroi cellulaire et le dépôt de lignine, réponses qui mettent en place une barricade locale qui ralentit la propagation du pathogène vers d'autres parties de la plante Campbell, N.A. and Reece, J.B. (2005). Biology (7th ed). San Francisco: Benjamin Cummings..

L'acide salicylique joue un rôle dans la résistance des plantes aux maladies en induisant la production de protéines liées à la pathogenèse. De nombreuses protéines présentes dans le vin sont des protéines liées aux agents pathogènes du raisin. Ceux-ci comprennent des protéines et des chitinases de type thaumatine.

De nombreuses familles de protéines liées à la pathogenèse coïncident également avec des groupes d'allergènes humains, même si l'allergie peut n'avoir rien à voir avec la fonction de défense des protéines This article contains quotations from this source, which is available under the Creative Commons Attribution 3.0 (CC BY 3.0) license.. Le regroupement de ces protéines par leurs caractéristiques de séquence permet de trouver des protéines allergènes potentielles à partir de génomes végétaux séquencés, un domaine d'étude surnommé « allergénomique ».

Classification En , 17 familles de protéines PR ont été nommées : + Différentes familles de protéines PR et allergènes identifiés Famille Classification de domaine Protéines Fonctions Allergènes PR-1 IPR034111 IPR001283 PR-1 a, PR-1 b et PR-1 c Antifongique (CAP) Cuc m 3 (melon melon ; ) - syndrome d'allergie orale PR-2 (GH17) β-1,3-glucanases Clive les β-1,3-glucanes Hev b 2 (latex ; ) - contact avec une dermatite Ole e 9 (olive) - allergie respiratoire Mus a 5 (banane) - syndrome d'allergie orale PR-3 IPR016283 Chitinase types I, II, IV, V, VI et VII Endochitinase Pers a 1 (avocat) - yeux ou nez qui piquent, asthme, enflure, etc. Mus a 2 (banane) - allergie alimentaire comme gonflement des lèvres, anaphylaxie, etc. PR-4 IPR001153 Domaine de Barwin chitinase I / II Antifongique et chitinase Pro-heveins : Hev b 6 - dermatite de contact PR-5 IPR001938 Similaire à la thaumatine Antifongique Jun a 3 (cèdre de montagne), Cry j 1 (cèdre japonais) et Cup a 3 (cyprès d'Arizona) - rhinite, conjonctivite et asthme Pru av 2 (cerise), Mal d 2 (pomme), Cap a 1 (poivron), Act d 2 (kiwi) et Mus a 4 (banane) - syndrome d'allergie orale PR-6 IPR000864 Protéase de pomme de terre I Inhibiteur de protéinase PR-7 (Similaire à la subtilisine ) Endoprotéinase de tomate P69 () Endoprotéinase PR-8 (GH18) Chitinase de concombre Chitinase III Hévamine (latex, ) —contacter une dermatite. Ziz m 1 (jujube indien, ) - syndrome d'allergie orale Cof a 1 (café, ) - allergie aux et aux voies respiratoires PR-9 (Haem peroxydase III) Peroxydase formant de la lignine du tabac () Peroxydase PR-10 IPR024949 IPR000916 Persil "PR-1" Similaire à la ribonucléase Bet v 1 (pollen de bouleau) - rhinoconjonctivite allergique et asthme Pru av 1 (cerise), Mal d 1 (pomme), Api g 1 (céleri) et Dau c 1 (carotte) - syndrome d'allergie orale Gly m 4 (soja), Vig r 1 (haricot mungo), Cor a 1 (noisette) et Cas s 1 (châtaigne) - syndrome d'allergie orale PR-11 (GH18) V du tabac () Chitinase PR-12 IPR008176 Radis Rs-AFP3 () Defensin végétal PR-13 IPR001010 Arabidopsis THI2.1 () Thionine PR-14 IPR000528 Protéines de transfert lipidique Navette de phospholipides et d'acides gras Par j 1 (mauvaise herbe; ) - rhinite et asthme Pru p 3 (pêche), Mal d 3 (pomme), Pru av 3 (cerise), Pru ar 3 (abricot), Cor a 8 (noisette), Cas s 8 (châtaigne) et Zea m 14 (maïs) - syndrome d'allergie orale PR-15 IPR001929 OxOa d'orge () germin ; Oxalate oxydase PR-16 IPR001929 Orge OxOLP () germinatif PR-17 IPR007541 Tabac NtPRp27 () résistance au mildiou (? )

Identification Comme les protéines PR sont produites lorsque le tissu végétal est stressé, diverses manières de signaler le stress sont utilisées pour forcer la plante à exprimer les gènes PR pour l'identification. Les facteurs de stress utiles incluent une infection réelle ou simplement des signaux de défense tels que le salicylate et le jasmonate de méthyle. Les protéines peuvent être identifiées par isolement, digestion des peptides et appariement contre les séquences génomiques (séquençage des protéines). Les séquences obtenues peuvent ensuite être vérifiées par rapport aux familles de protéines PR connues pour la catégorisation.

Notes et références

Voir aussi Articles connexes

Gène R, protéines de résistance non apparentées

Bibliographie

 Cet article intègre des textes de Mau Sinha, Rashmi Prabha Singh, Gajraj Singh Kushwaha, Naseer Iqbal, Avinash Singh, Sanket Kaushik, Punit Kaur, Sujata Sharma et Tej P. Singh disponibles sous licence CC BY 3.0.

Liens externes

Nomenclature des allergènes de l'OMS pour la conversion des allergènes en séquences spécifiques. Mot - clé UniProt : KW-0568 Cartographie de l'ontologie génétique : GO: 0009607, GO: 0006952

Catégorie:Protéine végétale