thumb|upright=1.5|Cas confirmés de variant Bêta, par pays, au 25 juin 2021.
Légende:
Le variant Bêta. du SARS-CoV-2, aussi appelé variant 501.V2 ou B.1.351 et surnommé « variant sud-africain », est un variant considéré comme hautement transmissible du SARS-CoV-2, coronavirus responsable de la Covid-19. Ce variant a été détecté en Afrique du Sud et son existence rendue publique par le de ce pays le .. Il a par la suite été observé également en Europe, dont le Royaume-Uni.. et la France..
On a observé que la prévalence de ce variant est plus élevée chez les personnes jeunes sans comorbidité et qu'elle conduit chez ces patients à des formes plus graves de la maladie que les autres variants... Le ministère de la Santé d'Afrique du Sud indique également que ce variant pourrait être responsable de la seconde vague de la pandémie de Covid-19 dans ce pays en raison de sa plus grande vitesse de diffusion.
Mutations Ce variant contient plusieurs mutations qui lui permettent de se lier plus facilement aux cellules humaines, notamment en raison des trois mutations suivantes. du péplomère S du virus affectant le domaine de liaison au récepteur, ou RBD (pour ), susceptible de se lier à l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2) : une mutation N501Y. (un résidu d'asparagine est remplacé par une tyrosine en position 501), une mutation K417N. (un résidu de lysine est remplacé par une asparagine en position 417) et une mutation faux sens E484K (un résidu de glutamate est remplacé par une lysine en position 484).
La mutation N501Y est également présente dans le variant variant Alpha observé fin 2020 au Royaume-Uni...
Le variant Bêta possède aussi la mutation E484K, également présente chez le variant Gamma, et sans doute liée avec un échappement immunitaire..
Contagiosité Le variant sud-africain serait une souche plus contagieuse du SARS-CoV-2, ce qui le rendrait plus difficile à contrôler et pourrait causer, arithmétiquement, plus d'hospitalisations et de décès. Le variant sud-africain 501.V2 semblerait être plus contagieux que le variant anglais VOC-202012/01, ce dernier étant déjà entre 50 % et 70 % plus contagieux que la souche commune. Cette contagiosité supérieure serait due principalement à la mutation N501Y, mais aussi aux mutations K417N et E484K, présentes sur la protéine .
Résistance aux vaccins L'inquiétude quant à la résistance au vaccin du variant 501.V2 est plus grande que pour le VOC-202012/01, qui a été confirmé sensible aux vaccins occidentaux, notamment à ARN. La modification de la protéine S détectée par le système immunitaire est problématique. Il existe en effet, selon le professeur John Bell de l'université d'Oxford, une grande inconnue quant à l'efficacité des vaccins, qui, a minima, pourrait être réduite.. Des analyses de plasma de personnes précédemment infectées avaient montré que le virus déjouait l'immunité en étant par les lymphocytes.. On note également le cas en d'une Brésilienne réinfectée par un variant porteur de la E484K, qui avait alors eu une forme plus sévère. Pfizer et Moderna ont assuré que leur vaccin neutralisait un virus porteur de la mutation N501Y, mais aucune étude n'a été faite pour la E484K.. Ce variant augmenterait également le risque de réinfection.
Les scientifiques s'inquiètent de l'éventuelle accumulation de mutations dans le futur, réduisant progressivement l'efficacité des vaccins et nécessitant leur reformulation, même si à l'heure actuelle, une moitié d'entre eux reste optimiste concernant 501.V2, alors que l'autre est dubitative..
Une étude provenant du Qatar publiée le dans la revue The New Journal of Medecine portant sur 37 674 participants a démontré l'efficacité du vaccin BNT162b2 (Pfizer-BioNTech) sur les variants B.1.1.7 (anglais) et B.1.351 (sud-africain). Pour un intervalle de confiance de 95%, l'étude indique que pour un minimum de 14 jours après la seconde dose, l'efficacité était de 89,5% contre les contaminations repérées par test PCR (symptomatiques ou non) pour le variant anglais contre 75% pour le variant sud africain. Le vaccin a été efficace à 100% contre les formes graves et mortelles pour les deux variants. L'étude suggère donc une réduction de l'efficacité du vaccin contre le variant sud-africain sur les formes légères et modérées qui ne remet cependant pas en question l'efficacité contre les formes graves et mortelles sur l'échantillon de population étudiée.
Origine Ce variant accumule un nombre de mutations plus important que d'habitude. Les mutations pourraient être apparues chez un sujet immunodéprimé, ayant de moins bonnes défenses et favorisant la multiplication du virus. D'autant que l'Afrique du Sud a un taux de prévalence au SIDA de plus de 20 % (pour les personnes âgées de 15 à 49 ans), particulièrement dans l'Est du pays.
Détection Lors d'un test RT-PCR, le variant Bêta peut être distingué notamment par la mutation E484K, également présente chez le variant Gamma.
Statistiques
Cas par pays (mis à jour le 4 août 2021) GISAID De campagne Cas confirmés Date de collecte225 avril 202140122 avril 202124 juin 20213524 avril 2021125 juin 2021410 avril 2021Auckland330 janvier 20217328 juin 20212608 juin 202116 février 202119 avril 20215616 juin 20211 07514 juin 202119 avril 2021111 février 202134227 juin 202165 avril 2021120 janvier 202129 juin 2021230 mai 2021214 mai 2021131 mai 202191er mars 202186021 juin 2021229 avril 2021422 mai 2021894 juin 2021113 avril 2021124 mai 202116 mars 2021417110 juin 2021DR Congo3020 avril 202112129 juin 2021229 avril 2021221 mai 2021431 avril 20213723 avril 20212623 mars 2021Îles Falkland12 mars 2021Îles Féroé16 mai 20211,12321 mai 20212,14923 juin 2021Guyane française27 avril 2021421 février 2021123 mai 20212 23119 juin 2021178 avril 2021114 mai 2021224 février 20211929 avril 2021425 mai 2021328 avril 2021Guinée-Bissau11 février 2021Haiti4016 janvier 202127 mars 202120814 juin 2021102 juin 202123 avril 2021126 février 20216919 avril 202124028 mai 2021691 juin 202117 juin 20218913 juin 2021218 avril 2021Kansas2226 mars 202117831 mai 2021121 juin 202126 juillet 2021913 mai 20211418 janvier 2021Libéria210 juillet 2021119 avril 202174422 mai 202131216 avril 202116110 juin 202131 juin 2021Manila187 juillet 2021228 avril 202125 juin 2021712 mars 20213231 janvier 20212016 mai 202132822 avril 2021969327 mai 20213125 juin 2021110 mars 2021Îles Mariannes du Nord127 avril 202136211 juin 2021355 juin 2021212 janvier 20211.2138 avril 2021457 juin 2021992 juin 202165018 mai 2021La Réunion40019 juin 2021726 mai 20212312 juin 20213915 juin 2021315 avril 2021128 février 2021Les Seychelles214 mars 202110025 juin 2021124 mars 20213127 mai 2021316 avril 202116 15421 juin 20211917 avril 2021324 avril 202158818 juin 2021426 mars 2021Surinam531 mars 20212.32217 juin 202122522 juin 2021326 avril 20214025 mai 202125 février 202128 juin 2021124 avril 202191224 mai 2021132 avril 2021Émirats Arabes Unis627 avril 202181224 juin 20212 45428 juin 202116 janvier 2021Wallis et Futuna122 février 202116128 avril 202133126 février 2021Monde (131 pays)Total : 28 537Total au 4 août 2021
Notes et références
Voir aussi
Articles connexes
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