Sadwavirus citri (SDV, virus du nanisme du satsuma) est une espèce de virus de la famille des Secoviridae.

Occurrence Il est originaire d'Asie, présent en Extrême-Orient (Chine, Corée sur Setoka et Dékopon, Japon), au Moyen-Orient (Iran, Syrie, Turquie). Au Japon il est largement répandu dans les principales régions productrices d'agrumes, sa première détection date de 1950. En Europe il est classé dans la liste A2 de l'OEPP, c'est un organisme de quarantaine, de même au Maroc et en Tunisie. centré|vignette|Présence du SDV (point violet) chez les agrumes dans le monde en 2023 Le virus n'affecte pas que les agrumes, il peut être facilement se transmettre à de nombreuses espèces herbacées, notamment le sésame (Sesamum indicum L.), Physalis floridana Rydb, Daphniphyllum teijsmannii Zoll. ex Kurz., Viburnum odoratissimum.

Description Ce sont des petits virus à ARN linéaire à simple brin, isométriques ( de diamètre) de deux ARNs + (, molécules génomiques) à polarité positive, rattachés à la classe IV de la classification Baltimore, qui infectent les plantes (phytovirus).

Une publication chinoise (2020) donne les séquences complètes du génome et analyse de recombinaison de trois isolats divergents du SDV provenant d'agrumes des provinces du Zhejiang et du Sichuan. Elle confirme la proximité du SDV avec le virus de la marbrure infectieuse de l'oranger Navel (Navel orange infectious mottling virus) et le virus du nanisme du natsudaïdaï (NDV natsudaidai dwarf virus). L’analyse de recombinaison prouve leur cooccurrence commune dans la nature.

Le virus de la mosaïque des agrumes (CiMV),le virus Hyuganatsu (HV) ont aussi des propriétés communes avec le SDV. Tous ces virus affectent les mandarines, l'orange douce (Citrus × sinensis (L.) Osbeck), le natsudaidai, le hyuganatsu (Citrus tamurana). La principale plante-hôte du SDV est la mandarine satsuma (Citrus reticulata subsp. unshiu). centré|vignette|Déformation en forme de bateau d'une feuille de mandarinier satsuma par le SDVLa vigueur des arbres infectés et la qualité des fruits diminuent avec les années. Chez l'oranger, les tangor et autres cultivars hybrides la feuille ne prend pas la forme de bateau mais devient petite et étroite. À la déformation de la feuille s'ajoutent des entre-nœuds courts.

Taxinomie Le virus du nanisme du satsuma appartient au sous-genre Satsumavirus du genre Sadwavirus de la famille des Secoviridae (Sanfaçon et al. 2020). Jusqu'à la détermination de sa séquence nucléotidique, ce virus était considéré comme un membre provisoire du genre Nepovirus dans l'actuelle sous-famille des Comovirinae.. Le SDV partage de nombreuses propriétés avec les membres de la famille Secoviridae; les virions sphériques ont une protéine de capside composée de génomes bipartites linéaires, l'organisation génétique de l'ARN1 et de l'ARN2 est similaire à celle des autres membres de la famille.

Au Japon, un virus bien caractérisé a été décrit sous le nom de CiMV Citrus mosaic virus (virus de la mosaïque des agrumes). Ce virus, sérologiquement apparenté au SDV, est désormais considéré comme une souche du SDV..

Transmission La transmission se fait habituellement par inoculation mécanique via les outils de coupe, sécateurs, greffoirs et les greffons infectés. Mais on a constaté au Japon (2023) que des Poncirus trifoliata plantés à proximité d'agrumes greffés sur le même porte-greffe ont été infectés par le SDV et la CiMV.

Notes et références

Bibliographie L'auteur de référence est Toru Iwanami.

Toru Iwamani. Major Citrus Viruses in Japan. Japan Agricultural Research Quarterly: JARQ, 2023

Liens externes

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citri Catégorie:Virus décrit en 2004 Catégorie:Phytovirus Catégorie:Groupe IV – Virus à ARN simple brin à polarité positive