Les transports dans le département français de l'Allier sont caractérisés par le croisement de flux nord-sud, reliant l'Île-de-France et la vallée de la Loire à Clermont-Ferrand et à la Limagne, et de flux est-ouest entre la côte atlantique et l'Europe centrale. L'existence de trois villes ayant un poids démographique et économique à peu près équivalent, et l'absence de contraintes topographiques fortes, expliquent que les itinéraires suivis par ces flux aient varié au cours de l'histoire. De nos jours, Montluçon est ainsi un carrefour autoroutier, tandis que ce sont plutôt Moulins et Vichy qui bénéficient de la meilleure desserte ferroviaire.
Transport routier
Infrastructures routières
Alors que la route nationale 7 reliant Paris à Lyon par Moulins, et la route nationale 9 se séparant de la précédente en direction de Clermont-Ferrand et de l'Espagne, constituaient deux des principaux axes routiers français, c'est un itinéraire beaucoup plus occidental qui a été choisi lors de la construction de l'autoroute A71 entre Paris et Clermont-Ferrand dans les années 1980. Montluçon est ainsi directement desservie par l'autoroute, tandis que la préfecture Moulins est longtemps restée isolée du réseau autoroutier et que Vichy est desservie par une antenne de l'A71 nommée autoroute A719. La route nationale 7 a toutefois été mise à 2x2 voies sur plusieurs sections depuis les années 2000 ; l'achèvement de cette mise à 2x2 voies pourrait encore prendre de nombreuses années.
Perpendiculaire à ces axes nord-sud, la Route Centre-Europe Atlantique est entièrement aménagée à 2x2 voies dans le département depuis 2022. Elle est composée d'ouest en est de la route nationale 145, de l'autoroute A714, d'un tronc commun avec l'autoroute A71 et de la nouvelle autoroute A79, créée en 2022 par élargissement et concession de l'ancienne route nationale 79.