Les transports dans le département français des Bouches-du-Rhône sont marqués par l'importance de l'agglomération de Marseille dans le sud-est du département. Site du premier port et du quatrième aéroport de l'Hexagone, carrefour de plusieurs autoroutes et extrémité d'une ligne à grande vitesse provenant de Paris, Marseille est aussi une ville dont le développement a été contraint par le relief environnant. Il en résulte la concentration des infrastructures dans des voies de passages étroites, cause de la saturation des transports routier et en commun, et la construction de nombreux tunnels.
Transport routier thumb|left|Échangeur des autoroutes A50 et A507 dans le quartier Saint-Loup à Marseille. Infrastructures routières
Les Bouches-du-Rhône sont parcourues par un dense réseau d'autoroutes et de voies rapides. La métropole d'Aix-Marseille est reliée par des autoroutes à Avignon, Lyon et Paris (autoroute A7), Draguignan et Nice (autoroute A8), Toulon (autoroute A50), Digne-les-Bains et Gap (autoroute A51), Arles et le Languedoc (autoroute A54). La plupart de ces autoroutes sont concédées et payantes, et plusieurs ont été mises à 2x3 voies au regard de l'importance du trafic.
Mais surtout, ces autoroutes et voies rapides permettent de relier entre eux les multiples pôles de la conurbation d'Aix-Marseille elle-même. Les autoroutes A7, A8, A50, A51, A52, A55, A501, A502, A507, A515, A517, A520 et A557, la route nationale 296 et les routes départementales D6 et D9 forment un tissu complexe dans la métropole. Contraintes par le relief et l'urbanisation, ces voies empruntent de nombreux ouvrages d'art, viaducs et tunnels ; le cœur de la ville de Marseille lui-même est traversé par les tunnels successifs de la Joliette, de la Major, du Vieux-Port et Prado-Carénage.
Malgré ces aménagements, le réseau routier de l'agglomération marseillaise est quotidiennement saturé aux heures de pointe : en 2021, Marseille serait ainsi la ville la plus embouteillée du monde..
+ Identifiant Origine Principales agglomérations desservies dans le département Fin Remarques Autoroute A7 Route métropolitaine 7 et autoroute A450 à Pierre-Bénite au sud de Lyon Châteaurenard, Sénas, Salon-de-Provence, Vitrolles, Marseille Marseille (quartier Saint-Lazare) Autoroute à 2x3 voies (tronçons à 2x2 voies entre l'A8 et l'A55), concédée et payante jusqu'à Rognac, non-concédée et gratuite au-delà. La partie non-concédée de l'A7 doit être transférée au département des Bouches-du-Rhône en 2024. Les 300 derniers mètres de l'A7 dans Marseille ont été déclassés en 2010. Autoroute A8 Autoroute A7 à Coudoux, vers Salon-de-Provence et Avignon Frontière italienne vers Vintimille Autoroute concédée à 2x3 voies dans le département, payante sauf le contournement d'Aix-en-Provence. Autoroute A50 Sortie du tunnel Prado-Carénage à Marseille Marseille, Aubagne, La Ciotat Autoroute A57 à Toulon Autoroute à 2x3 voies, non-concédée et gratuite de Marseille à Aubagne-Sud, concédée et payante au-delà. Autoroute A51 Autoroute A7 à Septèmes-les-Vallons, près de Marseille Bouc-Bel-Air, Aix-en-Provence, Venelles Route nationale 85 à La Saulce près de Gap(au-delà de La Saulce, l'autoroute A51 s’interrompt sur plus d'une centaine de kilomètres ; l'« A51 Nord » reprend au col du Fau et s'achève à Claix, sur l'autoroute A480, près de Grenoble) De Marseille à Aix-en-Provence-Sud : autoroute non-concédée et gratuite, à 2x3 voies jusqu'à Bouc-Bel-Air et 2x2 voies ensuite.