thumb|right|La chaîne de montagne des Andes dans l'ouest de l'Amérique du Sud.
L'histoire de l'Amérique andine s'étend d'environ avant notre ère jusqu'à nos jours. Longue de , la région englobe des environnements montagneux, tropicaux et désertiques. La colonisation et l'occupation de la région ont été influencées par sa géographie et son climat uniques, ce qui a conduit au développement d'une culture et d'une société uniques.
Après leur arrivée en Amérique du Sud par l'isthme de Panama, les premiers hommes, répartis en groupes tribaux de chasseurs-cueilleurs, se sont répandus sur le continent. Les premières traces de peuplement dans la région andine remontent à environ avant notre ère, au cours de ce que les archéologues appellent la période lithique. Au cours de la qui suit, les plantes commencent à être largement cultivées et la première société complexe, la civilisation de Caral-Supe, est apparue vers et a perduré jusqu'en . Des centres religieux distincts sont également apparus, comme la dans les hautes terres.
Vient ensuite la période céramique. Diverses sociétés complexes se développent à cette époque, telles que la culture de Chavín, qui dure de 900 à , la culture de Paracas, qui dure de 800 à , puis la culture Nazca de à , la civilisation Moche, de 100 à 700, les et , entre 600 et 1000, et Chimú, qui dure de 900 à 1470. Plus tard, une grande partie de la région andine est conquise par les Incas qui, en 1438, fondent le plus grand empire que les Amériques aient jamais connu, nommé Tahuantinsuyu, mais généralement appelé Empire inca. Les Incas gouvernent leur empire depuis la capitale de Cuzco, en suivant la tradition andine. L'empire inca naît du royaume de Cuzco, fondé vers 1230.
Au , des colonisateurs espagnols venus d'Europe arrivent dans les Andes. Ils finissent par soumettre les royaumes indigènes et incorporent la région andine à l'empire espagnol. Au , une vague montante de nationalisme anti-impérialiste balaie toute l'Amérique du Sud et conduit des armées rebelles à renverser le pouvoir espagnol. La région andine est alors divisée en plusieurs nouveaux États : le Pérou, le Chili, la Bolivie et l'Équateur. Le voit l'influence croissante des États-Unis dans la région, qui est de plus en plus exploitée pour ses réserves de gaz naturel. Cette situation conduit à la naissance d'un certain nombre de mouvements anti-impérialistes et socialistes qui s'opposent à l'implication des États-Unis et des multinationales dans les Andes.
Période lithique : v. – La période la plus ancienne au cours de laquelle l'homme a habité la région andine est la période lithique, parfois aussi appelée période archaïque précoce.
Première colonisation thumb|Illustration du début du représentant deux humains de la période lithique chassant un glyptodon en Amérique du Sud.
Après l'évolution de l'homme anatomiquement moderne en Afrique de l'Est il y a , l'espèce se répand sur le continent africain, en Europe et en Asie. C'est à partir de la Béringie, entre la Sibérie en Asie du Nord-Est et l'Alaska dans le nord-ouest de l'Amérique du Nord, que l'homme atteint pour la première fois les Amériques. De là, les avant-gardes des groupes humains se dirigent vers le sud, colonisant le reste du continent avant d'atteindre l'isthme de Panama et de traverser l'Amérique du SudMoseley 2001. p. 87.Burger 1992. pp. 08-11.. Bien qu'il y ait eu quatre populations humaines génétiquement distinctes en Amérique du Nord, comme l'a montré l'analyse ADN, une seule de ces populations, celle connue sous le nom de Paléoaméricains, a poussé jusqu'au sud de la Mésoamérique et de l'Amérique du Sud, ce qui signifie que les habitants indigènes de ce dernier continent étaient génétiquement homogènesMoseley 2001. pp. 87-88..
L'analyse comparative des croyances religieuses indigènes en Amérique du Sud a conduit les universitaires à soupçonner que les premiers colons paléoaméricains du continent auraient cru en un univers à plusieurs niveaux dans lequel la Terre était suspendue entre une sphère extérieure céleste et une sphère intérieure caverneuse. L'inceste aurait été fortement tabou, ce qui aurait permis d'éviter la consanguinité (un problème particulier compte tenu de l'homogénéité génétique des indigènes sud-américains), et le mariage aurait été contrôlé par des conventions sociales, telles que le développement de sociétaleMoseley 2001. p. 88..
Les premiers pionniers d'Amérique du Sud, qui migrent vers le sud à partir de l'isthme de Panama, évitent probablement la région montagneuse des Andes, car la partie supérieure de la cordillère était glaciale et froide, ce qui rendait la vie difficile et les premières populations auraient souffert d'hypoxie. Au lieu de cela, les premiers chasseurs-cueilleurs se cantonnent probablement aux marges du continent, où ils peuvent exploiter les ressources des rivières, des deltas et des lagunes d'eau salée. Progressivement, de génération en génération, au fur et à mesure que la population augmente, ces indigènes américains se répandent sur tout le continent, certains groupes atteignant finalement la région des Andes. Il est fort probable qu'ils aient d'abord habité les plaines côtières, ne se déplaçant dans les montagnes que pour s'approvisionner en ressources telles que l'obsidienne. Progressivement, au fur et à mesure que leurs descendants s'acclimatent à l'altitude, des groupes d'hommes commencent à se déplacer et à habiter les points les plus élevés des Andes Moseley 2001. pp. 88-89..
L'un des premiers sites andins connus à avoir fait l'objet d'une étude approfondie par les archéologues est celui de Monte Verde, dans le sud du Chili, qui a été daté au radiocarbone d'il y a . Sur ce site, on a trouvé des preuves d'un établissement saisonnier le long des rives sablonneuses d'un ruisseau dans les forêts de pins subarctiques de la basse Cordillère méridionale, où l'on a trouvé des outils en bois et en pierre préservés, des restes de légumes sauvages tels que des pommes de terre, et les restes squelettiques de cinq ou six mammouths qui avaient été ramasés ou chassés par les occupants humainsMoseley 2001. pp. 89-90.. D'autres sites de la période lithique ont été découverts dans la région andine, notamment Los Toldos (Santa Cruz) en Argentine, et San Vicente de Tagua Tagua, et Quero au Chili. Pikimachay, la grotte de Jaywamachay (à au sud-ouest d'Ayacucho), Huarago et Uschumachay au Pérou sont également importants. Les preuves mises au jour sur tous ces sites montrent qu'à cette époque, le cheval était l'espèce la plus chassée, même si le paresseux et le guanaco étaient également présentsMoseley 2001. p. 91..
Adaptation lithique En raison de la diversité des zones géographiques de la région andine, des communautés uniques se développent pour s'adapter à leur situation particulière dans la région à la fin de la période lithique. Les archéologues ont défini ces différentes communautés par leurs types uniques d'outils en pierre, les décrivant comme la tradition du Nord-Ouest, la , la tradition lithique des Andes centrales et la tradition maritime de l'AtacamaMoseley 2001. p. 92..
C'est également à cette époque que les communautés andines commencent à domestiquer les cultures, en transformant génétiquement diverses espèces de plantes à partir de leurs homologues sauvagesMoseley 2001. pp. 102-103..
Période précéramique : v. –v. Vue d'ensemble La période lithique est suivie par ce que les archéologues appellent la période précéramique, ou encore la période archaïque tardive, qui se caractérise par une complexité sociale croissante, une croissance démographique et la construction de centres cérémoniels monumentaux dans l'ensemble de la région andineMoseley 2001. p. 107.. C'est cette dernière caractéristique qui reste la plus évidente pour les archéologues et qui indique qu'à cette époque, la société andine est suffisamment développée pour pouvoir organiser de grands projets de construction impliquant la gestion de la main-d'œuvreBurger 1992. p. 27.. La période précéramique voit également une augmentation de la population de la région andine, avec la possibilité que de nombreuses personnes aient été partiellement migratrices, passant la majeure partie de l'année dans les zones rurales mais se déplaçant vers les centres cérémoniels monumentaux pour certaines périodes qui étaient considérées comme ayant une signification particulièreMoseley 2001. p. 114.. La période précéramique est également marquée par des changements climatiques dans la région andine, car la fin de la période glaciaire entraîne la fin de la fonte des glaciers qui s'est produite tout au long de la période lithique, ce qui a eu pour effet de stabiliser le niveau des mers sur la côte ouest de l'Amérique du Sud.
Malgré ces changements, de nombreux éléments de la société andine sont restés identiques à ce qu'ils étaient au cours des millénaires précédents. Par exemple, comme son nom l'indique, la période pré-céramique est aussi une période au cours de laquelle la société andine n'a pas encore développé la technologie de la céramique et n'a donc pas de poterie à utiliser pour la cuisine ou le stockage. De même, les communautés andines de la période précéramique n'ont pas développé l'agriculture ni domestiqué la flore ou la faune, tirant l'essentiel de leur nourriture de la chasse ou de la cueillette, comme l'avaient fait leurs prédécesseurs de la période lithique, bien qu'il existe des preuves que certaines plantes sauvages aient commencé à être cultivées intentionnellement.
Civilisation de Caral-Supe thumb|Carte des sites de Caral-Supe indiquant leur emplacement au Pérou. thumb|left|Reconstruction de l'une des pyramides d'Aspero. La civilisation de Caral-Supe est la première civilisation de l'Amérique précolombienne, située dans l'actuel Pérou, ainsi que l'une des plus anciennes civilisations du monde. Elle s'est formée en et les grandes constructions apparaissent à partir de Elle dure jusqu'en Parmi les plus grandes villes, on trouve Caral et Aspero, le site-type de cette civilisation.
Période céramique : v. –1533 Vue d'ensemble Le développement de la céramique dans la région andine et la production subséquente de poterie pour la cuisson et le stockage marquent le début de la période céramiqueBurger 1992. p. 57.. L'introduction de la poterie n'est cependant « qu'un élément d'une transformation socio-économique beaucoup plus vaste » le long de la côte andine, les communautés cessant de considérer leurs établissements côtiers comme les principaux centres d'activité au profit d'emplacements plus à l'intérieur des terres, et l'ancienne économie maritime est remplacée par une économie dominée par l'agriculture irriguée.
Période initiale Tradition religieuse Kotosh thumb|Kotosh. Dans les zones de drainage des montagnes des Andes, une série de bâtiments cérémoniels ont été construits, que les archéologues ont identifiés comme faisant partie de ce qu'ils ont appelé la Moseley 2001. p. 109.. L'un des sites les plus importants est celui de Kotosh, qui a donné son nom à la tradition religieuse. Situé sur la rive du Río Higueras, Kotosh se trouve à une altitude d'environ et consiste en « deux grands flanqués de constructions moins importantes et d'un certain nombre de petites structures sur une terrasse fluviale voisine ». Un autre exemple notable de la tradition religieuse de Kotosh se trouve à dans le Callejón de Huaylas au Pérou, et se compose à nouveau de deux monticules à plate-forme et de plusieurs structures environnantes.
Puissant séisme au Chili