L'histoire génétique de l'Afrique du Nord englobe l'histoire génétique des peuples d'Afrique du Nord. La source la plus importante de flux génétique vers l'Afrique du Nord provenait du Moyen-Orient. Le désert du Sahara au sud et la mer Méditerranée au nord constituaient d'importants obstacles au flux génétique en provenance d'Afrique subsaharienne et de certaines parties de l'Europe durant la préhistoire. Cependant, l'Afrique du Nord est reliée à l'Asie occidentale via l'isthme de Suez et la péninsule du Sinaï, tandis qu'au niveau du détroit de Gibraltar, l'Afrique du Nord et l'Europe ne sont séparées que par , de même Malte, la Sicile, les îles Canaries et la Crète sont proches des côtes de l'Afrique du Nord.
L'Afrique du Nord est une région génétiquement hétérogène et diversifiée, caractérisée par la diversité de ses groupes ethniques, les principaux étant les Arabes, les Berbères et les Coptes (en Égypte). Les populations d'Afrique du Nord présentent une structure génétique complexe et hétérogène qui a été décrite comme un amalgame d'au moins quatre composants ancestraux différents du Moyen-Orient, d'Afrique subsaharienne, d'Europe et des peuples autochtones d'Afrique du Nord. Même si l'Afrique du Nord a connu des flux génétiques en provenance des régions environnantes, elle a également connu de longues périodes d'isolement génétique. Certaines études génétiques ont été critiquées pour leur interprétation et leur catégorisation des données génétiques africaines.
Le débat scientifique actuel porte sur la détermination des contributions relatives des différentes périodes de flux génétique au pool génétique actuel des Nord-Africains.
Préhistoire On sait que des humains anatomiquement modernes étaient présents en Afrique du Nord au Paléolithique moyen (il y a ), comme l'atteste le Djebel Irhoud 1. Sans discontinuité morphologique, l'Atérien a été remplacé par l'industrie ibéromaurusienne, dont les assemblages lithiques entretenaient des relations étroites avec les cultures de Cro-Magnon d'Europe et d'Asie occidentale, plutôt qu'avec les cultures contemporaines de l'Afrique subsaharienne ou de la Corne de l'Afrique. L'industrie ibéromaurusienne a été remplacée par l'industrie capsienne fortement influencée par l'Asie occidentale (8000 avant notre ère à 2700 avant notre ère) dans la partie orientale de l'Afrique du Nord (Égypte, Libye, Tunisie, est de l'Algérie, Malte).
Les données d'ADN ancien du nord-ouest de l'Afrique indiquent une population génétique stable et isolée datant d'au moins 15 000 à 7 500 ans AP.
Cette stabilité est perturbée par l'arrivée des premiers groupes d'agriculteurs du sud-ouest de l'Europe entre et ans AP, qui ont marqué le début du Néolithique au Maghreb en introduisant des pratiques agricoles auprès des chasseurs-cueilleurs locaux. Néanmoins, les populations néolithiques ultérieures du Maghreb oriental conservent une ascendance essentiellement locale de chasseurs-cueilleurs, auxquelles s'ajoutent des contributions plus modestes d'agriculteurs européens (datées d'environ 7 000 ans AP) puis de groupes levantins (datées d'environ 6 800 ans AP). D'une manière générale, ces populations semblent avoir été beaucoup moins impactées par les flux génétiques externes que les populations d'autres régions du Néolithique méditerranéen.
Les premiers bergers avec leur bétail entrent en Afrique probablement par les routes du Sinaï et de la mer Rouge. Ils se répandent ensuite rapidement en Afrique du Nord-Est et atteignent le Sahara central il y a environ ans.
Il y a ans, un nouveau flux génétique se produit avec l'apparition d'une ascendance associée aux groupes néolithiques du Levant, dont les signatures archéologiques sont visibles dans le Sahara oriental.
Histoire Après avoir migré vers l'Afrique du Nord au , les colons phéniciens des villes de Tyr et de Sidon ont établi plus de 300 colonies côtières dans toute la région et ont construit avec Carthage un puissant empire qui contrôlait la majeure partie de la région du jusqu'au milieu du Une étude récente a révélé que près de 40 % des hommes maghrébins modernes portent le marqueur paternel E-M81, qui se serait propagé du Levant vers l'Afrique du Nord.
Conquête musulmane du Maghreb
Au , la région fut colonisée par les Arabes musulmans omeyyades de la péninsule arabique. Sous la conquête arabo-omeyyade relativement brève et l'arrivée ultérieure de Bédouins nomades, d'Arabes levantins et de peuples arabisés du Proche-Orient en Asie occidentale et l'arrivée de certains Juifs séfarades et musulmans ibériques fuyant la Reconquista catholique espagnole de la péninsule ibérique, un mélange partiel de population ou des fusions ont eu lieu et ont abouti à une certaine diversité génétique chez certains Nord-Africains.
Une étude de 2017 qui compare des groupes berbérophone et arabophones du Maghreb suggère que certains groupes berbères, en particulier ceux moins isolés géographiquement, auraient intégré des groupements moyen-orientaux. Toutefois, cette introgression a pu varier selon les groupes berbères, ce qui expliquerait l'hétérogénéité génétique forte observée aujourd'hui chez l'ensemble des populations d'Afrique du Nord et soulignée dans un grand nombre d'études. L'intégration de ces populations arabes aurait également favorisé un remplacement linguistique (du berbère vers l'arabe) chez certains groupes, tandis que d'autres auraient conservés la langue berbère, ce qui expliquerait l'absence de différenciation génétique marquée entre locuteurs arabophones et berbérophones.
Ainsi, les chercheurs soutiennent que l'arabisation, c'est-à-dire l'expansion de la langue et de la culture arabes depuis la péninsule Arabique vers le Maghreb à partir du siècle, fut avant tout un processus démographique impliquant un flux génétique et une restructuration de la composition génétique, plutôt qu'un simple remplacement culturel comme suggéré auparavant par certaines sources historiques. Ce processus a non seulement entraîné un apport génétique en provenance du Moyen-Orient, mais aussi introduit un schéma d’hybridation génétique complexe issu de multiples origines, notamment subsaharienne par le biais de l'esclavage ou encore ibérique, entrainant une forte hétérogénéité au sein des groupements actuels. Une autre étude a révélé que la majorité des chromosomes J-M267 (Eu10) au Maghreb sont dus au récent flux génétique provoqué par les migrations arabes vers le Maghreb au cours du premier millénaire de notre ère, alors que les Arabes Qahtanites du sud et les Arabes adnanites du nord s'ajoutaient à l'hétérogène creuset ethnique maghrébin. Le pool de chromosomes Eu10 au Maghreb provient non seulement des premières dispersions du Néolithique, mais dans une bien plus grande mesure des expansions récentes des tribus arabes de la péninsule arabique.
ADN-Y d'anciens échantillons d'Afrique du Nord NamePaysCultureDate (Avant J.C.)Y-DNA HaplogroupeProfil génétiqueÉtudeTAF009MarocIberomaurusian15,100-13,900E-M78Afro-LevantinLoosdrecht et al. 2018TAF010MarocIbéromaurusien15,100-13,900E-M78Afro-LevantinLoosdrecht et al. 2018TAF011MarocIbéromaurusien15,100-13,900E-M78Afro-LevantinLoosdrecht et al. 2018TAF012MarocIbéromaurusien15,100-13,900E-M78Afro-LevantinLoosdrecht et al. 2018TAF013MarocIbéromaurusien15,100-13,900E-M78Afro-LevantinLoosdrecht et al. 2018TAF015MarocIbéromaurusien15,100-13,900E-M78Afro-LevantinLoosdrecht et al. 2018KTG004MarocCardial7,400-6,900G2EuropéenSimoes et al. 2023KTG006MarocCardial7,400-6,900G2EuropéenSimoes et al. 2023IAM.4MarocCardial7,300-6,700E-L19LevantinFregel et al. 2018IAM.5MarocCardial7,300-6,700E-L19LevantinFregel et al. 2018SKH002MarocProto-campaniforme6,700-6,100TLevantinSimoes et al. 2023SKH005MarocProto-campaniforme6,700-6,100TLevantinSimoes et al. 2023KEB.6MarocProto-campaniforme5,700-5,600TEuropéenFregel et al. 2018KEB.7MarocProto-campaniforme5,700-5,600CTEuropéenFregel et al. 2018Nakht-AnkhÉgypteÉgyptien4,000HInconnuDrosou et al. 2018Tuthmoses 1ÉgypteÉgyptien3,450J1InconnuGad et al. 2021YuyaÉgypteÉgyptien3,390G2InconnuGad et al. 2021Amenhotep IIIÉgypteÉgyptien3,370R1bInconnuGad et al. 2021AkhenatenÉgypteÉgyptien3,350R1bInconnuGad et al. 2021TutankhamunÉgypteÉgyptien3,340R1bInconnuGad et al. 2021Ramses IIIÉgypteÉgyptien3,200E-V38InconnuGad et al. 2021PentawerÉgypteÉgyptien3,200E-V38InconnuGad et al. 2021JK2134ÉgypteÉgyptien2,798-2,591J1LevantinSchuenemann et al. 2017JK2911ÉgypteÉgyptien2,791-2,582J2LevantinSchuenemann et al. 2017R11793TunisiePhénicien2,711-2,355J2EuropéenMoots et al. 2023R11746TunisiePhénicien2,683-2,361R1bEuropéenMoots et al. 2023R11751TunisiePhénicien2,678-2,359J2EuropéenMoots et al. 2023R11753TunisiePhénicien2,606-2,355J2EuropéenMoots et al. 2023JK2888ÉgypteÉgyptien2,119-2,024E-V22LevantinSchuenemann et al. 2017R10766AlgérieBerbère1,887-1,746G2BerbèreAntonio et al. 2022
Y-chromosome Des travaux antérieurs avec des marqueurs du chromosome Y ont montré que l'Afrique du Nord est très hétérogène, les lignées Y trouvées dans la région sont : A, B, E-V38, E-M78, E-M81, E-M123, G, F, H., I1, I2, J1, J2 et R1b. L'E-M81 atteint une fréquence moyenne de 40 % dans la région. J-M267 est le deuxième haplogroupe le plus fréquent, représentant environ 30 % des Nord-Africains et supposé s'être répandu du Caucase, de la Turquie et de l'Iran jusqu'en Afrique du Nord.
L'origine géographique de l'haplogroupe E est discutée. Les études les plus récentes privilégient une origine africaine, Trobetta et al. suggèrant « que le rayonnement de l'haplogroupe E a commencé à environ 58 ka, quelque part en Afrique subsaharienne, avec une probabilité postérieure plus élevée (0,73) pour une origine est-africaine »Trombetta et al., Phylogeographic refinement and large scale genotyping of human Y chromosome haplogroup E provide new insights into the dispersal of early pastoralists in the African continent, Genome Biology and Evolution, Volume 7, Numéro 7, juillet 2015, pages 1940–1950, doi.org/10.1093/gbe/evv118
Les sous-clades courantes incluent E1b1b1a, E1b1b1b et E1b1b1*. E1b1b1b est distribué le long d'un cline d'ouest en est avec des fréquences qui peuvent atteindre jusqu'à 80 pour cent parmi les Arabes hassani et 1 % parmi les Berbères Siwa. E1b1b1a a été observé à des fréquences faibles à modérées parmi les populations berbères, avec des fréquences significativement plus élevées observées en Afrique du Nord-Est par rapport à l'Afrique du Nord-Ouest. Loosdrecht et al. 2018 a démontré qu'E1b1b est très probablement indigène au Levant et a migré du Levant vers l'Afrique du Nord au cours du Paléolithique.
L'haplogroupe J-M267 est un autre haplogroupe très courant au Maghreb, étant le deuxième haplogroupe le plus fréquent après l'haplogroupe E. L'haplogroupe R1 a également été observé à des fréquences modérées. Une étude approfondie d'Arredi et al. (2004), qui ont analysé des populations d'Algérie, concluent que le modèle nord-africain de variation du chromosome Y (incluant les principaux haplogroupes J1 et E1b1b) est en grande partie d'origine moyen-orientale, ce qui suggère que leur introduction dans cette partie du monde était le résultat d'une migration récente de pasteurs sémitiques du Moyen-Orient, bien que des articles ultérieurs aient suggéré que cette date aurait pu être aussi longue qu'il y a dix mille ans, avec la transition de la culture oranienne à la culture capsienne en Afrique du Nord. Une autre étude a conclu que le pool de chromosomes J-M267 au Maghreb dérive non seulement des premières dispersions du Néolithique, mais dans une bien plus grande mesure des expansions récentes des tribus arabes de la péninsule arabique lors des migrations arabes vers le Maghreb.