Hieronymus Merkle (1887-1970), un homme politique allemand ; Marcel-André Casasola Merkle (1977-), un auteur de jeux de société allemand ; Ralph Merkle (1952-), un cryptographe américain et chercheur en nanotechnologie ; arbre de Merkle, en informatique, une structure de données ; puzzles de Merkle ou énigme de Merkle, en iinformatique, la première construction à clé asymétrique ; cryptosystème de Merkle-Hellman, un des premiers cryptosystèmes asymétriques ; Sebastian Merkle (1862-1945), un théologien catholique et historien de l'église allemand.
Arnaud Merklé (2000-), un joueur français de badminton.
Autre Institut Adolphe Merkle, un centre de recherche suisse indépendant dédié aux nano-sciences et aux sciences des matériaux