vignette|Groupe de macaques japonais dans une source chaude au Parc aux singes de Jigokudani
Voici dans cet article la liste des mammifères vivant sur les îles du Japon. Décrits pour la première fois dans le cinquième volume de Fauna Japonica sorti en 1838 rédigé par Coenraad Jacob Temminck à partir des notes et dépouilles collectées par Philipp Franz von Siebold dans les années 1820. Riche d’une culture prolifiques et influente, les mammifères du Japon sont reconnus dans le monde par l’intermédiaire des arts et du tourisme, comme le cerf sika ou encore le macaque japonais. Caractérisée par sa faible diversité d’espèces de gros mammifères, notamment d’ongulés, l’archipel japonais possède néanmoins un grand nombre de sous-espèces endémiques souvent mises en avant dans la culture locale, comme le tanuki d’Ézo.
Caractéristiques géographiques Le Japon en tant qu’archipel adjacent au continent asiatique, est constitué d’un ensemble d’îles où les espèces ayant migré depuis le continent durant les périodes glaciaires, formant des populations distinctes. S’étendant sur 3 000 km du nord au sud et abritant des zones montagneuses de plus de 3 000 m d’altitude, l’archipel couvre une grande diversité d’environnements, allant de la zone subarctique à la zone subtropicale. Dans ce contexte, plus de 30 % des quelque 130 espèces de mammifères terrestres du Japon sont des espèces endémiques, réparties en sept genres endémiques. Dans les régions proches du continent eurasiatique comme les îles d’Hokkaidō ou Tsushima, ces espèces endémiques coexistent avec des espèces de l’île principaleOhdachi et al. eds. "The Wild Mammals of Japan" Shoukadoh, 2009.
D’un point de vue zoogéographique, de par plusieurs barrières naturelles, notamment la dans le détroit de Tsugaru entre Hokkaidō et Honshū, ainsi que la , les populations de mammifères du Japon sont divisées en deux grands groupes : les espèces du Paléarctique présentes au nord de la ligne de Watase et les espèces d’écozone Indomalaise originaires d’Asie du Sud-Est, présentes au sud de cette ligneAkio Dohi et al., 哺乳類の生態学 (Écologie des mammifères), Tokyo University Press, 1997, p. 8-9, . Au Japon, les animaux sont de ce fait, divisés en quatre catégories associée à une région du pays :
L’archipel principal : , constitué des îles de , et . En japonais, les espèces sont souvent désignée sous le terme de , sous-entendant qu’il s’agisse du véritable Japon, ou encore , mais à l’international, le terme de « Honshū » est souvent maladroitement employé. Le nord : ：avec l’île septentrionale d’, où les espèces sont plus semblables à celle se trouvant en Europe. Anciennement désignée sous les noms : d’Ézo, Yeso ou encore Jesso, cette dénomination se retrouve parfois pour désigner les sous-espèces locales. Les îles : : Désignant les îles très éloignées de l’archipel principal, les îles Ryūkyū. Les espèces, endémiques de ces îles et en petit nombre, sont pour la plupart menacées.
Conservation Cette liste répertorie les espèces de mammifères recensées au Japon (à l'exclusion des populations d’animaux domestiques et ceux détenus en captivé). Parmi les 172 espèces de mammifères recensées : 112 mammifères terrestres autochtones, (dont les espèces endémiques sont identifiées ci-dessous ; ce nombre inclut 37 espèces de chauves-souris), 19 espèces introduites, 40 espèces de cétacés, ainsi que le dugong — 162 figurent dans la région du Japon sur la Liste rouge de l'UICN. Parmi celles-ci, trois taxons sont considérés comme en danger critique d'extinction, : Rat à épines d’Okinama (Tokudaia muenninki), le Murin de de Yanbaru (Myotis yanbarensis) et la Murine ténébreuse (Murina tenebrosa), vingt-deux sont en danger, huit sont vulnérables et onze sont quasi menacées. Le lion de mer du Japon et la pipistrelle des îles Bonin (Pipistrellus sturdeei) sont considérés comme éteints.
La Liste rouge du Ministère de l'Environnement (Japon) de 2020 classe également comme éteints la rousette d'Okinawa (Pteropus loochoensis) la loutre du Japon, ainsi que la sous-espèce de Rhinolophe de Miyako.
En , quinze espèces et sous-espèces ont été désignées comme par décret du Cabinet du Japon, conformément à la . Statuts des listes rouges de l’UICN Éteint Il n'y a pas le moindre doute sur le fait que le dernier spécimen recensé est mort. Éteint à l'état sauvage L'espèce est connue uniquement en captivité ou en tant que population naturalisée bien en dehors de son ancienne aire de répartition. En danger critique L'espèce risque prochainement de s'éteindre à l'état sauvage. En danger L'espèce fait face à un très gros risque d'extinction à l'état sauvage. Vulnérable L'espèce fait face à un gros risque d'extinction à l'état sauvage. Quasi menacé L'espèce ne satisfait pas un ou plusieurs des critères prévus qui permettraient de la catégoriser, mais pourrait risquer de s'éteindre dans le futur. Préoccupation mineure Il n'y a pas de risque identifiable pour l'espèce. Données insuffisantes Il n'y a pas d'information adéquate qui permettraient de faire une évaluation des risques pour cette espèce. Non évalué L'espèce n'a pas encore été confrontée aux critères précédents, n'est pas reconnue par l'UICN ou bien s'est éteinte avant le .
Ordre : Primates
Famille : Hominidés Nom vulgaire français et japonais, Nom binominal et citation d’auteurOrigine et statutAire de répartitionStatut UICNImageÊtre humain Homo sapiensLinnæus, 1758Autochtone100px|sans_cadre|centré
Famille : Cercopithécidés Nom vulgaire français et japonais, Nom binominal et citation d’auteurSous espèces et auteurOrigine et statutAire de répartitionStatut UICNImageMacaque japonais
Macaca fuscata Blyth, 1875Macaque de Honshū M. f. fuscataGray, 1870Endémique100px|sans_cadre100px|sans_cadreMacaque de Yakushima M. f. yakuiKuroda, 1940100px|sans_cadreMacaque de FormoseMacaca cyclopisSwinhoe, 1863Espèce introduite100px|sans_cadre100px|sans_cadreMacaque rhésusMacaca mulattaZimmermann, 1780Espèce introduite100px|sans_cadre100px|sans_cadre
Ordre : Lagomorphes
Famille : Leporidés Nom vulgaire français et japonais, Nom binominal et citation d’auteurSous espèces et auteurOrigine et statutAire de répartitionStatut UICNImageLièvre variableLepus timidusLinnaeus, 1758L. t. ainuThomas, 1905Autochtone100px|sans_cadre100px|sans_cadreLièvre du JaponLepus brachyurusTemminck, 1845Lièvre du TōhokuL. b. angustidensThomas, 1907Endémique100px|sans_cadre100px|sans_cadreLièvre de KyūshūL. b. brachyurusTemminck, 1845Lièvre de SadoL. b. lyoniAllen, 1903Lièvre d’OkiL. b. okiensisKuroda, 1924Lapin domestiqueOryctolagus cuniculusLinnaeus, 1758Espèce introduiteŌkunoshima100px|sans_cadreLapin des RyūkyūPentalagus furnessiStone, 1900Endémique 100px|sans_cadre100px|sans_cadre
Famille : Ochotonidés Nom vulgaire français et japonais, Nom binominal et citation d’auteurSous espèces et auteurOrigine et statutAire de répartitionStatut UICNImagePika du NordOchotona hyperboreaPallas, 1811O. h. yesoensisAbe, 1971Autochtone100px|sans_cadre100px|sans_cadre
Ordre : Rodentiens
Famille : Sciuridés Nom vulgaire français et japonais, Nom binominal et citation d’auteurSous espèces et auteurOrigine et statutAire de répartitionStatut UICNImageÉcureuil du JaponSciurus lisTemminck, 1844S. l. lisTemminck, 1844Endémique100px|sans_cadre100px|sans_cadreÉcureuil rouxSciurus vulgarisLinnaeus, 1758S. v. orientisBlyth, 1844Autochtone100px|sans_cadre100px|sans_cadreÉcureuil à ventre rougeCallosciurus erythraeusPallas, 1779C. e. taiwanensisMilne-Edwards, 1872Espèce introduite100px|sans_cadre100px|sans_cadreTamia de SibérieTamias sibiricusLaxmann, 1769T. s. lineatusSiebold, 1824Autochtone100px|sans_cadre100px|sans_cadreT. s. barberiAbe, 1935Espèce introduite100px|sans_cadrePolatouche de SibériePteromys volansLinnaeus, 1758P. v. oriiKuroda, 1921Autochtone100px|sans_cadre100px|sans_cadrePolatouche du JaponPteromys momongaTemminck, 1844Endémique100px|sans_cadrePétauriste à joues blanchesPetaurista leucogenysTemminck, 1827Petaurista leucogenys leucogenysTemminck, 1827Endémique100px|sans_cadre100px|sans_cadreP. l. nikkonisThomas, 1905P. l. oreasThomas, 1905P. l. hintoniMori, 1923
Famille : Gliridés Nom vulgaire français et japonais, Nom binominal et citation d’auteurSous espèces et auteurOrigine et statutAire de répartitionStatut UICNImageMuscardin du JaponGlirulus japonicusSchinz, 1845Endémique100px|sans_cadre
Famille : Cricétidés Nom vulgaire français et japonais, Nom binominal et citation d’auteurSous espèces et auteurOrigine et statutAire de répartitionStatut UICNImageCampagnol boréalClethrionomys rutilusPallas, 1779Campagnol de MikadoM. r. mikadoThomas, 1905Autochtone100px|sans_cadre100px|sans_cadreCampagnol de SundevallMyodes rufocanusSundevall, 1846M. r. bedfordiaeThomas, 1905Autochtone100px|sans_cadre100px|sans_cadreCraseomys rexImaizumi, 1971Endémique Craseomys andersoniThomas, 1905EndémiqueEothenomys smithiiThomas, 1905EndémiqueMicrotus montebelliMilne-Edwards, 1872Endémique100px|sans_cadreRat musquéOndatra zibethicusLinnaeus, 1766Espèce introduite100px|sans_cadre100px|sans_cadre
Famille : Muridés Nom vulgaire français et japonais, Nom binominal et citation d’auteurSous espèces et auteurOrigine et statutAire de répartitionStatut UICNImageMulot distinguéApodemus speciosusTemminck, 1844A. s. speciosusEndémique100px|sans_cadreA. s. sadoensisA. s. miyakensisA. s. navigatorA. s. insperatusA. s. tusimaensis100px|sans_cadreA. s. ainu A. s. dorsalisMulot de CoréeApodemus peninsulaeThomas, 1907A. p. giliacusKuznetsov, 1948Autochtone100px|sans_cadreMulot argentéApodemus argenteusTemminck, 1844Endémique100px|sans_cadreMulot rayéApodemus agrariusPallas, 1771Espèce introduite100px|sans_cadreRat des moissonsMicromys minutusPallas, 1771Autochtone100px|sans_cadre100px|sans_cadreSouris griseMus musculusLinnaeus, 1758Souris molosseM. m. molossinusTemminck, 1844Espèce introduiteMus caroliBonhote, 1902AutochtoneRat à épines d’OkinawaTokudaia muenninkiJohnson, 1946EndémiqueRat à épines d’AmamiTokudaia osimensisAbe, 1933EndémiqueRat à épines de TokunoshimaTokudaia tokunoshimensisEndo & Tsuchiya, 2006Endémique100px|sans_cadre|centréRat noirRattus rattusLinnaeus, 1758Espèce introduite100px|sans_cadre|centréRat brunRattus norvegicusBerkenhout, 1769Espèce introduite100px|sans_cadre|centré100px|sans_cadre|centréRat TanezumiRattus tanezumiTemminck, 1844Autochtone100px|sans_cadre|centré100px|sans_cadre|centréRat polynésienRattus exulansPeale, 1848Espèce introduite100px|sans_cadreRat des RyūkyūDiplothrix legatusThomas, 1906Endémique100px|sans_cadre
Famille : Myocastoridés Nom vulgaire français et japonais, nom binomial et citation d’auteurSous espèces et auteurOrigine et statutAire de répartitionStatut UICNImageRagondinMyocastor coypusMolina, 1782Espèce introduite100px|sans_cadre100px|sans_cadre
Ordre : Érinacémorphes
Famille : Erinaceidés Nom vulgaire français et japonais, Nom binominal et citation d’auteurSous espèces et auteurOrigine et statutAire de répartitionStatut UICNImageHérisson de l’AmourErinaceus amurensisSchrenck, 1859Espèce introduite100px|sans_cadre100px|sans_cadre
Ordre : Soricomorphes
Famille : Soricidés