vignette|La Cicadelle pisseuse (Homalodisca vitripennis) a été introduite à partir du sud des États-Unis en Californie où elle a été découverte dans la vallée de Temecula en 1996. Cet insecte semble être un nouveau vecteur, très efficace pour certaines souches phytopathogènes pour la vigne, de la bactérie X. fastidiosa et il peut facilement se développer dans le contexte de grandes cultures (rangées de plants génétiquement proches ou identiques)
Xylella fastidiosa est une Gammaproteobacteria de la famille des Xanthomonadaceae.
Xylella fastidiosa est la seule espèce du genre Xylella, et cinq sous-espèces sont décrites : fastidiosa, sandyi, multiplex, pauca, tashke. Cette dernière sous-espèce est moins rencontrée dans la littérature.
Certaines souches sont responsables de maladies mortelles ou potentiellement mortelles chez diverses espèces de plantes cultivées pour l'alimentation humaine, notamment la vigne, l'olivier et les agrumes. Si l'on considère toutes les souches de cette bactérie, on recense dans le monde 309 espèces de plantes sensibles (plantes-hôtes) appartenant à 193 genres et 63 familles, dont 54 familles de dicotylédones, six de monocotylédones et une de gymnospermes (Ginkgoaceae). Toutefois beaucoup de ces plantes peuvent être infectées tout en restant asymptomatiques..
Étymologie Le nom générique, Xylella, dérive de xylème et fait référence au fait que cette bactérie est limitée aux tissus vasculaires qui assurent le transport de la sève brute dans la plante. L'épithète spécifique, , rappelle qu'il s'agit d'une bactérie fastidieuse, c'est-à-dire difficile à cultiver en laboratoire sur milieu artificiel à cause d'exigences nutritionnelles très spécifiques..
Bactériologie Les 25 souches de cette bactérie connues en 1987 sont toutes Gram négatives, catalase positives et oxydase négatives, utilisent l'hippurate et produisent de la gélatinase et souvent des beta-lactamases mais pas de bêta-galactosidase, de coagulase ni de lipase, amylase, phosphatase, indole, ou H2S.
Ce sont des aérobies strictes caractérisées par une croissance optimale à 26- et à un pH de 6,5 à 6,9.
Les anticorps monoclonaux préparés contre la maladie de Pierce ont réagi avec les 25 autres souches.
L'ADN en est composé pour 51 à 53 % (molaire) de guanine et cytosine, et les souches étudiées étaient au moins pour 85 % liées lors de l'hybridation de l'ADN.
Phytopathogène C'est un agent pathogène important chez de nombreuses plantes. En effet plus de 300 espèces végétales sont dites plantes « hôtes » de cette bactérie. Elle cause plusieurs maladies comme la du pêcher (dans le sud des États-Unis), le du laurier-rose, la maladie de Pierce de la vigne en Californie, et la chlorose variéguée des agrumes sur des orangers au Brésil ou dans d'autres pays (la bactérie semble pourvoir infecter tous les cultivars de Citrus sinensis).
Introduite en Europe et identifiée en , elle décime depuis quelques années les oliviers de la région des Pouilles, dans le sud de l'Italie., menaçant depuis son introduction l'ensemble du pourtour méditerranéen. En , la France interdit l'importation de végétaux sensibles à la bactérie provenant des régions atteintes. Mais quelques jours plus tard la bactérie est identifiée au marché de Rungis sur un caféier ornemental originaire d'Amérique centrale., et quelques semaines plus tard cette mesure est abrogéeArrêté du 22 mai 2015, JORF du 24 mai 2015.. En , la bactérie est trouvée à Propriano en Corse sur un polygale à feuilles de myrte (Polygala myrtifolia) planté en 2010., ainsi que sur des plants de genêts d'Espagne (Spartium junceum). La souche trouvée en Corse est identifiée comme appartenant à la sous-espèce multiplex, différente de celle pauca affectant les oliviers des Pouilles.. Début , sa présence est confirmée à Nice dans les Alpes-Maritimes.. Début , sa présence est détectée dans l'Aude en Occitanie ., et dans le Gard en . Seule la souche Xylella fastidiosa subsp. Multiplex -ST6 a été détectée jusqu'à présent en Occitanie .
En 2015, parmi les plantes cultivées en France, la liste des plantes hôtes de la bactérie est portée de 10 à 15 parmi lesquelles figurent la lavande dentée, le romarin, le chêne-liège ou encore le myrte communMathilde Frénois (2015) Alpes-Maritimes : La liste des végétaux sensibles à la Xylella fastidiosa s'étend - AGRICULTURE - Le nombre d’espèces positives à la bactérie passe de dix à quinze, Journal 20 min, publié 09.11.2015. Une campagne de communication est engagée par le ministère de l'agriculture pour inviter le grand public à ne pas « faire voyager » les plantes pour éviter de risque de dissémination de la maladieXylella fastidiosa : la campagne de communication.
Plantes hôtes
Xylella fastidiosa est une bactérie très polyphage., qui admet une vaste gamme de plantes hôtes, comprenant de nombreuses espèces de plantes sauvages ou cultivées, souvent des plantes ligneuses mais également certaines plantes herbacées. La seule sous-espèce Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa, agent causal de la maladie de Pierce, compte 132 espèces de plantes-hôtes appartenant à 46 familles différentes..
Plantes fruitières Parmi les plantes fruitières susceptibles d'être infectées par la bactérie figurent des espèces de grand intérêt agro-économique appartenant aux genres Vitis (Vitis vinifera, Vitis labrusca, Vitis riparia), Citrus (Citrus spp.) et d'autres agrumes tels que le kumquat, Fortunella), Prunus (Prunus dulcis, l'amandier, Prunus persica, le pêcher, Prunus salicina, le prunier japonais, Prunus domestica, le prunier cultivé, Prunus cerasifera, le myrobolan), ainsi que les caféiers (Coffea spp.)..
vignette|gauche|Symptômes de la chlorose variéguée sur oranger (noter la décoloration jaune des feuilles).
Cette bactérie attaque également d'autres espèces fruitières, comme le nashi ou poirier asiatique (Pyrus pyrifolia), l'avocatier (Persea americana), les myrtilliers (Vaccinium corymbosum, Vaccinium virgatum), le pacanier (Carya illinoinensis).
En revanche, les signalements concernant l'olivier (Olea europaea) comme plante hôte sont rarissimes dans la littérature scientifique : certaines études sur ce sujet, publiées en 2014 par Krugner ., ont été conduites en Californie méridionale après l'annonce d'une augmentation de la mortalité des oliviers dans la région de Los Angeles. Dans ce cas, bien que la sous-espèce, Xylella fastidiosa subsp. multiplex, ait été souvent trouvée chez des oliviers qui montraient des signes de dépérissement des feuilles et des branches, son caractère pathogène n'a pas été formellement démontré . Un autre signalement, en provenance d'Argentine, concerne une autre sous-espèce, Xylella fastidiosa subsp. pauca, et indique des « manifestations symptomatiques non dissemblables ». de celles de l'infection du Salente (Italie), selon une communication personnelle de María Laura Otero à Giovanni Paolo Martelli de l'université de Bari. La découverte argentine concerne la ville de Córdoba et le nord de la province de La Rioja, sur des plantations de plus de cinquante ans d'une variété locale, « Arauco ». Les symptômes relevés sont une pourriture lente, une coloration vert-sombre, des pertes partielles et la mort rapide de bourgeons et de rameaux..
La destruction en 2023 de 21 millions d'oliviers dans le sud de l'Italie est attribué à X. Fastidiosa.
Arbres et arbustes d'ornement Parmi les plantes ornementales attaquées par la bactérie figurent le platane américain (Platanus occidentalis), l'orme blanc américain (Ulmus americana), le liquidambar (Liquidambar styraciflua), les chênes (Quercus spp.), l'érable rouge (Acer rubrum), le mûrier rouge (Morus rubra) ainsi que le laurier rose (Nerium oleander).
Plantes herbacées et arbustives Xylella fastidiosa a été signalée sur la luzerne cultivée (Medicago sativa). De nombreuses plantes sauvages sont susceptibles d'abriter la bactérie sans montrer de symptômes de pathologie (infections asymptomatiques) : parmi elles des mauvaises herbes et des plantes rudérales, les lys, et divers arbustes.
Histoire épidémiologique En 1887, Newton Barris Pierce (1856–1916), l'un des pionniers de la phytopathologie aux États-Unis, décrit une nouvelle maladie de la vigne, dont l'agent causal était alors inconnu. Sévissant en Californie depuis le début des années 1880, elle a détruit environ de vignobles dans la région de Los Angeles, notamment près d'Anaheim.. Cette maladie, baptisée par la suite « maladie de Pierce », est la première forme connue d'une maladie des plantes due à la bactérie Xylella fastidiosa.
Cette bactérie semblait endémique du nord de la Californie. Elle est dans ce contexte favorisant (vastes monocultures de vignes génétiquement peu diversifiées) transportée par un insecte vecteur : la cicadelle Graphocephala atropunctata, appelée aux États-Unis. Durant un siècle environ, elle n'est responsable que de dégâts locaux.
En 1890, une maladie apparentée est signalée aux États-Unis sur le pêcher (Prunus persica). Baptisée échaudure des feuilles du pêcher ( ou PPD), cette maladie connaît par la suite plusieurs épidémies, en particulier en 1929, 1951 et 1976, principalement en Géorgie.
Elle devient une menace réelle pour l'activité vinicole californienne quand une autre cicadelle (Homalodisca vitripennis ou ) est introduite en Californie à partir du sud des États-Unis (elle est découverte dans la vallée de Temecula en Californie en 1996). Ce nouvel insecte se montre un bien meilleur vecteur de la bactérie.
Les premières cultures axéniques de cette bactérie (c'est-à-dire exempte de tous germes saprophytes ou pathogènes) ne sont obtenues qu'en 1978 Hopkins, D. L. (1989) « Xylella fastidiosa: , 27(1):271-290 (résumé).
En 1987, vingt-cinq souches phénotypiquement et génotypiquement proches ont déjà été isolées à partir d'échantillons de dix espèces de plantes malades (vigne, pêcher, pervenche, amandier, prunier, orme, platane, ambroisie, chêne et mûrier). Les cellules sont indépendantes (parfois filamenteuses), immobiles, en forme de bâtonnets, dépourvues de flagelle et d'une taille de de long sur de large Wells JM, Raju BC, Hung HY, Weisburg WG, Mandelco-Paul L & Brenner DJ. (1987). « Xylella fastidiosa gen. nov., sp. nov: gram- Xanthomonas spp. » , 37(2):136-143. ( résumé). Parmi d'autres plantes touchées d'intérêt agricole figure la luzerne cultivée.
L'Europe craint l'introduction de ce pathogène mais celle-ci n'est jamais formellement détectée chez des végétaux plantés jusqu'en 2013