L'épigénèse (du préfixe epí-, « sur », et du suffixe -genesis, « création ») est une notion utilisée dans plusieurs domaines.
En biologie du développement, l’épigenèse est une théorie qui stipule qu'un embryon se développe en devenant de plus en plus complexe, et historiquement opposée à la théorie de la préformation. En géologie, l'épigenèse est le phénomène qui permet le changement de nature chimique des minéraux. En philosophie, l' est une théorie ésotérique et cosmologique.
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