Henri Margot, né en 1807 et mort en 1894, est un botaniste suisse.
Biographie D'origine genevoise, Henri Margot séjourne sur l'île de Zante, une des îles Ioniennes, de 1834 à 1837, comme précepteur des enfants du comte de Messala. À son retour, il entre en relation avec le botaniste Edmond Boissier.
En 1838, son Essai d’une flore de l’île de Zante, co-écrit avec Georges François Reuter, est publié sous forme d'in-quarto par les soins du botaniste Augustin Pyrame de Candolle, après que le texte a été lu à la Société de physique et d’histoire naturelle de Genève. Le catalogue paraît ensuite en deux parties dans les Mémoires de la société.
Henri Margot enseigne le latin et le grec à Vevey et pratique la botanique en amateur.
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