Le genre Burkholderia (auparavant faisant partie du genre Pseudomonas) regroupe un ensemble de bactéries qui colonisent une très large variété de niches écologiques, c'est quasiment un genre ubiquiste. Ce sont des bactéries à coloration Gram négatives, mobiles, aérobies obligatoires formant des bâtonnets, et qui sont pour certaines espèces pathogènes pour l'homme, les animaux et les plantes. Néanmoins le genre comporte également des espèces importantes pour l'écologie de l'environnement.
Historique Les sept premières espèces du genre Burkholderia ont d'abord été classées dans le genre Pseudomonas avant d'être caractérisées comme un genre à part entière en 1992 et transférées dans ce nouveau genre avec l'espèce Burkholderia cepacia comme espèce type. Le nom du genre Burkholderia a ensuite été validé en 1993 d'où cette date d'autorité. Ce genre comprend des espèces connues pour être pathogène pour l'humain, les animaux et les plantes mais comprend aussi des espèces qui peuvent être importantes pour l'écologie et l'environnement. Par exemple, Burkholderia xenovorans (auparavant nommée Pseudomonas cepacia, puis Burkholderia cepacia et Burkholderia fungorum) est étudiée pour ses aptitudes de dégradation des liaisons organochlorées des pesticides et du polychlorobiphényle (PCB).
Ainsi certaines espèces de Burkholderia sont étudiées pour leurs capacités à réhabiliter le sol des friches industrielles chimiques, tandis que d'autres espèces du même genre présentent un intérêt dans les cultures pour leurs rôles au niveau de la rhizosphère. De par leurs résistances aux antibiotiques et les taux de mortalité qu'elles engendrent, les espèces Burkholderia mallei et Burkholderia pseudomallei peuvent être classées parmi les armes biologiques potentielles.
Taxonomie Étymologie L'étymologie du genre Burkholderia est la suivante : Burk.hol.de’ria N.L. neut. pl. n. suff. -ia, suffixe utilisé pour désigner une classe; N.L. fem. n. Burkholderia, ce nom de genre a été proposé 1992 (avec Errata 1993) par Eiko Yabuuchi et collègues d'après le nom du phytopathologue Walter H. Burkholder, qui, au milieu du à l'université Cornell, étudia et décrit de nombreuses bactéries phytopathogènes.
Espèces valides Selon la , les espèces du genre publiées de manière valides sont les suivantes :
Burkholderia aenigmatica Depoorter 2020 Burkholderia ambifaria Coenye 2001 Burkholderia anthina Vandamme 2002 Burkholderia arboris Vanlaere 2008
Burkholderia caribensis Achouak 1999 Burkholderia caryophylli (Burkholder 1942) Yabuuchi 1993 Burkholderia cenocepacia Vandamme 2003 Burkholderia cepacia (Palleroni & Holmes 1981) Yabuuchi 1993 (Espèce type) Burkholderia cepacia complex Burkholderia dolosa Vermis 2004 Burkholderia dabaoshanensis Guo, J. and Zhu, H. 2012 Burkholderia fungorum Coenye 2001 Burkholderia gladioli (Severini 1913) Yabuuchi 1993 Burkholderia glathei (Zolg & Ottow 1975) Vandamme 1997 Burkholderia glumae (Kurita & Tabei 1967) Urakami 1994 Burkholderia graminis Viallard 1998 Burkholderia hospita Goris 2003 Burkholderia kururiensis Zhang 2000 Burkholderia mallei (Zopf 1885) Yabuuchi 1993 Burkholderia multivorans Vandamme 1997 Burkholderia phenazinium (Bell & Turner 1973) Viallard 1998 Burkholderia phenoliruptrix Coenye 2005 Burkholderia phymatum Vandamme 2003 Burkholderia phytofirmans Sessitsch 2005 Burkholderia plantarii (Azegami 1987) Urakami 1994 Burkholderia pseudomallei (Whitmore 1913) Yabuuchi 1993 Burkholderia pyrrocinia (Imanaka 1965) Vandamme 1997 Burkholderia sacchari Brämer 2001 Burkholderia singaporensis Burkholderia sordidicola Lim 2003 Burkholderia stabilis Vandamme 2000 Burkholderia terricola Goris 2003 Burkholderia thailandensis Brett 1998 Burkholderia tropica Reis 2004 Burkholderia tuberum Vandamme 2003 Burkholderia ubonensis corrig. Yabuuchi 2000 Burkholderia unamae Caballero-Mellado 2004 Burkholderia vietnamiensis Gillis 1995 Burkholderia xenovorans Goris 2004
Espèces non validées Plusieurs espèces n'ont pas été publiées de manière valide ou sont en attente de validation, selon la , on trouve dans ces cas précis, les espèces suivantes :
Burkholderia agricolaris Shu 2018 Candidatus Burkholderia alatipes Lemaire 2011 Burkholderia alba Lee 2018 Candidatus Burkholderia amboniana Lemaire 2011 Candidatus Burkholderia andongensis Lemaire 2011 Candidatus Burkholderia anthocleistifolia Lemaire 2011 Burkholderia australis Paungfoo-Lonhienne 2014 Candidatus Burkholderia bidentata Lemaire 2011 Candidatus Burkholderia bifaria Lemaire 2011 Candidatus Burkholderia brachyantha Lemaire 2011 Candidatus Burkholderia brachyanthoides Lemaire 2011 Burkholderia brasilensis Baldani 1997
Candidatus Burkholderia brevipaniculata Lemaire 2011 Espèces synonymes Toujours selon la , plusieurs espèces de ce genre sont considérées comme des synonymes et dont le nom ne doit plus être utilisé, à savoir :
Burkholderia acidipaludis est un synonyme de l'espèce Paraburkholderia acidipaludis (Aizawa 2010) Sawana 2017 Burkholderia alpina est un synonyme de l'espèce Pararobbsia alpina (Weber and King 2017) Lin 2020 Burkholderia andropogonis est un synonyme de l'espèce Robbsia andropogonis (Smith 1911) Lopes-Santos 2017 Burkholderia arationis est un synonyme de l'espèce Caballeronia arationis (Peeters et al. 2016) Dobritsa 2017 Burkholderia arvi est un synonyme de l'espèce Caballeronia arvi (Peeters et al. 2016) Dobritsa 2017 Burkholderia aspalathi est un synonyme de l'espèce Paraburkholderia aspalathi (Mavengere 2014) Sawana 2017 Burkholderia bannensis est un synonyme de l'espèce Paraburkholderia bannensis (Aizawa 2011) Sawana 2015 Burkholderia bryophila est un synonyme de l'espèce Paraburkholderia bryophila (Vandamme 2007) Sawana 2015 Burkholderia caballeronis est un synonyme de l'espèce Paraburkholderia caballeronis (Martínez-Aguilar 2014) Sawana 2017 Burkholderia caledonica est un synonyme de l'espèce Paraburkholderia caledonica (Coenye 2001) Sawana 2015
Pathogénicité Les espèces suivantes sont connues pour leurs pathogènicités vis-à-vis de l'homme et ou d'autres animaux : Burkholderia mallei, Burkholderia pseudomallei, cause la mélioïdose Burkholderia cepacia, pathogène opportuniste retrouvé dans les cas d'infections pulmonaires chez les patients de la mucoviscidose
Notes et références Notes
Références
Bibliographie
Liens externes
Pathema-Burkholderia Resource J.P. Euzéby: List of Prokaryotic Names with Standing in Nomenclature - Genus Burkholderia Burkholderia in J.P. Euzéby : Dictionnaire de bactériologie vétérinaire
Catégorie:Pseudomonadota Catégorie:Bactérie décrite en 1995 Catégorie:Bactérie décrite en 1992